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流程名称:选择已创建的流程,如果还未创建,可参考新建流程进行创建。 优先级:设置作业优先级。在资源充足的情况,高优先级先于低优先级。在满足条件的资源规格情况下,高优先级的先于低优先级投递。如果资源不满足,则优先处理资源满足的作业。例如,资源有2u2g,低优先级的需要1.8u1.8g,高优先级的需要2
服务区域名称。请依据实际购买平台的区域填写。当前支持华北-北京四(cn-north-4)、华东-上海一(cn-east-3)。 --platform-id 是 平台ID,获取方法请参见步骤1:获取认证信息。 方法2:使用AK、SK初始化 执行以下命令,进行初始化,命中的xxx和region信息请参考表2进行替换。
Token的有效期为24小时,需要使用同一个Token鉴权时,可以缓存起来,避免频繁调用。 Token在计算机系统中代表令牌(临时)的意思,拥有Token就代表拥有某种权限。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限。 u
单击“查看3D”可以看到小分子和靶点的对接构象。 图7 查看3D 单击配体对比,可以计算对接后的构象与输入小分子的RMSD值和输入小分子和靶点的相互作用2D图。 图8 设置配体对 图9 配体对接结果图 单击查看2D相互作用图,可以看到对接后的小分子构象与蛋白的2D相互作用图,并且支持相互作用2D图下载。
图1 聚类分析配置页面 输入方式:选择文件和手动输入类型。 上传分子文件:选择可上传的分子文件。分子文件支持SMI格式文件;文件大小不超过5G;小分子支持10-10,000个,超出10,000的分子会进行截断。 输入小分子:可以通过上传文件或输入SMILES以输入小分子。 名称:
标准存储单AZ包适合数据分享、内容分享、热点对象应用场景。 规格 套餐包支持的购买规格。 购买数量 购买套餐包的数量。取值范围:1-50。 购买时长 购买套餐包的时长。最短为一个月,最长为一年。 生效时间 选择购买套餐包后的生效时间。目前支持支付完成后立即生效和指定生效时间两种方式。 如果
Multiple Choices 多种选择。请求的资源可包括多个位置,可返回一个资源特征与地址的列表用于用户终端(例如:浏览器)选择。 301 Moved Permanently 永久移动,请求的资源已被永久的移动到新的URI,返回信息会包括新的URI。 302 Found 资源被临时移动。
id String molecule的序号 smiles String molecule的smiles序列 source String molecule的smiles来源 表8 reactions 参数 参数类型 描述 id String 反应的序号 reactants Array
X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数
MD引擎:仅支持GROMACS。 时间步长:MD模拟的时间步长,范围支持0<时间步长≤5fs,默认是2fs。 温度:MD模拟的温度,范围支持0<温度≤1000K,默认是300K。 配置MD的计算步骤 Energy Minimization:能量最小化的步数,范围支持0<步数≤50000,默认是10000步。
numbers 口袋中心坐标; x, y, z轴的坐标 size Array of numbers 口袋尺寸大小; x, y, z轴的大小 最小值:1.7 最大值:500 表11 CustomProp 参数 参数类型 描述 id String 自定义属性的ID(API侧) 最小长度:1 最大长度:64
异步任务的状态:等待中、运行中、已完成、失败 枚举值: waiting running finished failed task_data SearchTaskData object 分子搜索任务的请求体 result SearchResult object 分子搜索任务的返回结果
X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数
分子ADMET属性值列表 similarity Number 分子与初始分子的相似度 num_fulfilled_weak_constraints Integer 分子所满足的弱约束数量 score Number 分子的打分 表8 MoleculeConstraint 参数 参数类型 描述
计算配体间的3D结构差异 创建配体文件预览任务 查询配体文件预览任务 删除配体文件预览任务 创建配体相似性图计算任务 查询配体相似性图计算任务 删除配体相似性图计算任务 根据center、size、padding参数生成可渲染的口袋文件内容 根据表面离散点坐标集生成可渲染的文件内容
String 异步任务的状态:等待中、运行中、已完成、失败 枚举值: waiting running finished failed task_data CpiTaskData object CPI任务的请求体 result CpiResult object CPI任务的返回结果 表4 CpiTaskData
Notebook 如何使用Notebook的Terminal功能 如何将Notebook中的数据下载至本地 如何在Notebook中安装外部库
口袋发现时长:默认值为50ns,输入范围:20-50。 表面原子离散点数量:每个表面原子离散点数量。默认值为20,输入范围: 10-50。 探针半径:控制产生的离散点到表面原子的距离。默认值为1.4 ,输入范围: 1.4-5,单位:Å。 名称:可修改,修改后左上角也同步修改。长度为5~64个字符;仅可以使用
X-Auth-Token 是 String 用户Token。Token认证就是在调用API的时候将Token加到请求消息头,从而通过身份认证,获得操作API的权限,获取Token接口响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 状态码:
口袋中心坐标; x, y, z轴的坐标 size 否 Array of numbers 口袋尺寸大小; x, y, z轴的大小 最小值:1.7 最大值:500 表8 CustomProp 参数 是否必选 参数类型 描述 id 是 String 自定义属性的ID(API侧) 最小长度:1