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受体信息解析 功能介绍 受体信息解析，如果有多个受体蛋白则只处理第一个，如果一个受体蛋白里结合了多个配体，则最多只处理前10个。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/drug-common/receptor/info
pdb格式文件，最多上传100个靶点文件，如果上传多聚体靶点，仅解析第一条链，每个靶点的氨基酸序列长度不超过2048。 图2 靶点配置选择文件 输入PDB ID，最多输入100个PDB ID，用逗号或换行方式隔开；不区分大小写；如果输入多聚体靶点，仅解析第一条链；每个靶点的氨基酸序列长度不超过2048。
药物通用接口 生成分子SVG图 生成分子SDF三维结构 受体预处理 受体信息解析 受体口袋检测 配体格式转换为SMILES 生成相互作用2D图 计算配体间的3D结构差异 创建配体文件预览任务 查询配体文件预览任务 删除配体文件预览任务 创建配体相似性图计算任务 查询配体相似性图计算任务
本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 当前目录，不进行跳转。 health cd . 切换到上一级路径。 health cd .. 切换到指定的路径，如切换到src1。 health cd /src1
目使用。您可以在“项目管理”页面，“数据”页签中，完成数据的添加、导入、归档、复制、删除等操作。 数据总条数<=10000，页面上可以指定跳转具体页码。 数据总条数>10000，通过“下一页”和“上一页”进行页面切换，并且按时间排序只能对当前页面进行排序，页面搜索为按前缀搜索。 使用合规数据
目使用。您可以在“项目管理”页面，“数据”页签中，完成数据的添加、导入、归档、复制、删除等操作。 数据总条数<=10000，页面上可以指定跳转具体页码。 数据总条数>10000，通过“下一页”和“上一页”进行页面切换，并且按时间排序只能对当前页面进行排序，页面搜索为按前缀搜索。 使用合规数据
Notebook简介 EIHealth平台集成了基于开源的Jupyter Notebook，可为您提供在线的开发和调试工具，用于编写和调测模型训练代码。Notebook使您无需关心分析软件包的安装、升级和维护等工作，只需聚焦于科研工作，从而加快科研进展。 关于Jupyter No
收藏夹 收藏夹用于收藏用户的任务结果，通过单击相应的作业名称跳转到作业详情页面，可以收藏大小分子，并在收藏夹中查看。收藏夹内分为小分子和大分子，小分子通常为低分子量的化合物，如蛋白质配体；大分子多为蛋白质靶点。 小分子涉及分子对接、分子优化、靶点口袋分子设计、CPI、分子生成、分子搜索、FEP、聚类详情页。
步骤5：获取分析结果 在“作业”列表中，可单击作业名称查看作业信息和输入输出数据。 图8 查看作业信息 单击输出路径，可跳转至输出文件位置。html文件支持在线预览，zip文件可下载至本地查看。 图9 输出数据 图10 预览html文件 图11 获取zip文件 父主题： 运行作业
自定义镜像创建Notebook样例 Notebook提供了在线的开发和调试工具，用于编写和调测模型训练代码，在创建Notebook时，平台为您提供了系统镜像。同时，您也可以使用自定义镜像，创建Notebook，满足个性化的开发需求。 本章节介绍如何使用自定义镜像创建Noteboo
000条将进行截取。文件必须有两列是“SMILES”、“NAME”，不区分大小写。文件不允许有中文，数据库小分子会自动去重。 数据文件列名：选择数据库列名，仅解析前100个列名，支持选择12个列名保存到数据库。 组织共享： 如果关闭，则该数据库只能自己使用。 如果开启组织共享，则其他子用户也可以使用您的数据库进行分子搜索。
单击具体的每个应用，可以查看每个应用的运行信息：输入输出，节点参数，应用以及日志等信息。 单击具体的输出参数便可跳转到具体的文件位置。 图14 查看应用信息 图15 查看输入、输出数据位置 单击输出参数路径，可以跳转至输出文件位置。 图16 获取输出数据 父主题： 运行作业
String 配体名称，若无名称则自动命名，格式为UNK+索引（从1起编号）。 最小长度：1 最大长度：128 success Boolean 解析是否成功。 smiles String 分子SMILES表达式。 最小长度：1 最大长度：512 formula String 配体分子的化学式。
支持上传的文件格式为nf、 zip，大小不能超过10M。zip包文件个数规格为1024个，单个文件解压后限制，不超过10M。 如果上传的流程中包含镜像，单击镜像管理跳转至本项目的镜像管理列表，进行镜像上传，具体可参考导入或上传镜像。 图1 添加流程文件 添加完成后，单击“下一步”，配置流程参数。 添加参数
展示在资产市场的图片。要求如下： 格式：svg,png,jpg,jpeg 尺寸：16 * 9 大小：不超过20KB 描述 针对此流程的相关描述。 单击“立即发布”。 系统跳转到“我的发布”页面，可以查看发布的流程状态。当流程发布成功后，可以在“资产市场>组织共享”中查看发布的流程。 已发布的流程不能直接编辑和删除，需下线后才能编辑和删除。
ReceptorDrugFileReq 参数 是否必选 参数类型 描述 source 是 String 受体的数据源：外部网络数据（如RCSB在线数据库）、用户私有数据中心、承载租户公共数据（含样例/公共库）。 枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url
展示在资产市场的图片。要求如下： 格式：svg,png,jpg,jpeg 尺寸：16 * 9 大小：不超过20KB 描述 针对此数据的相关描述。 单击“立即发布”。 系统跳转到“我的发布”页面，可以查看发布的数据状态。当数据发布成功后，可以在“资产市场>组织共享”中查看发布的数据。 已发布的数据不能直接编辑和删除，需下线后才能编辑和删除。
展示在资产市场的图片。要求如下： 格式：svg,png,jpg,jpeg 尺寸：16 * 9 大小：不超过20KB 描述 针对此镜像的相关描述。 单击“立即发布”。 系统跳转到“我的发布”页面，可以查看发布的镜像状态。当镜像发布成功后，可以在“资产市场>组织共享”中查看发布的镜像。 已发布的镜像不能直接编辑和删除，需下线后才能编辑和删除。
展示在资产市场的图片。要求如下： 格式：svg,png,jpg,jpeg 尺寸：16 * 9 大小：不超过20KB 描述 针对此应用的相关描述。 单击“立即发布”。 系统跳转到“我的发布”页面，可以查看发布的应用状态。当应用发布成功后，可以在“资产市场>组织共享”中查看发布的应用。 已发布的应用不能直接编辑和删除，需下线后才能编辑和删除。
可以直接基于该流程创建自动分析作业。 查看作业运行结果 自动作业运行完成后，在自动作业列表中单击数据表名称，跳转至对应的数据表中。在设置的状态更新列中，单击执行结果跳转至对应的分析作业，查看作业运行结果详情。 图7 查看作业运行结果 父主题： 作业管理
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