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创建项目 使用create或submit命令创建项目，并可设置项目级数据权限策略。 命令结构 health create project <project-name> [flags] 或 health submit project <project-name> [flags] 表1
最小长度：0 最大长度：10000000 add_hydrogen 否 Boolean 增加氢原子。 缺省值：true 响应参数 无 请求示例 设置受体蛋白文件为1TQN.pdb，配体小分子为1TQN.pdb，拼接成复合物结构。 https://{endpoint}/v1/{proje
--commands -c 否 镜像启动命令。设置方法请参见创建FastQC应用样例。 --image -i 否 镜像地址。获取方法请参见获取镜像地址。 --labels -l 否 标签，多个标签使用;符号分隔开。 --nodeLabels -n 否 用于让应用调度到设置了该标签的节点上。 标签数量取值范围[0
选择的属性包含在我们所设置的参数设置区间内。“最大化”指的是我们所设置的属性越大越好，而不只是限定在某区间内，当我们无法判断属性应该设置在什么区间，但是属性越高，成药性越好，可以设置属性设置条件为最大化，这个只能在弱约束里面进行设置。“最小化”指的是所设置的属性越小越好，与最大化相反，也是只能在弱约束里面进行设置。
构象。 如果不需要设置靶点，此步骤可以进行省略，如果设置了靶点，作业运行时间会加长。 图3 靶点设置 图4 Target1设置 图5 Target2设置 图6 靶点设置完成 通过“靶点设置”上传靶点，并且设置对接口袋。 此处靶点设置为可选参数，如果选择靶点设置，可以将对接活性作为
安装/卸载Nextflow 安装Nextflow Nextflow需要用户自己进行安装，安装的权限只有管理员拥有。 在平台右上角用户名中选择“系统设置”。 在“Nextflow配置”模块，单击“安装”。 图1 安装Nextflow 选择安装方式。目前支持GitHub获取和上传安装包两种方式。
进入流程设计器页面。单击输入参数图标，设置输入数据。 图6 流程设计器 单击应用图标，弹出编辑图标，单击按钮，设置应用参数。 在“高级参数”下面可以设置加速类型。如果作业加速类型选择“无”，task加速类型可以任意选择。如果作业加速类型选择IO加速或者本地盘加速，则此处task加速类型无法设置。 参数确认
IO加速实例id，为空则不开启IO加速，设置相应加速包id将会开启加速。实例id可参考“系统设置命令>获取系统资源”章节获取。当id设置为：auto_schedule，则会自动调度加速包，当id设置为local_disk，则开启本地盘加速。 --nodeLabels -l 否 用于让作业调度到设置了该标签的节
项目简介 项目是EIHealth平台的一个工作空间，可以在项目中存储数据，上传镜像和创建分析作业。也可以将团队成员引入到项目中，并通过设置成员角色实现项目权限的划分。 项目管理是以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组。以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。您可
免误删造成损失。 在“数据”页面单击“归档”，进入归档数据页面。 图1 选择归档 填写归档的参数信息。 表1 参数说明 参数 说明 名称 设置归档数据的名称。归档名称长度为1-100。 描述 归档数据描述信息。 归档类型 选择归档数据存储类型。默认为标准存储。 标准存储：适合高性能，高可靠，高可用，频繁访问场景。
主键用于唯一地标识数据表中的信息，可通过设置复合主键将数据表中的多个数据设置为唯一，主键至多设置10个。 允许为空 主键所包含的列不允许设置为空。当数据库中某些数据允许没有值时，可设置为空。 是否可查询 依据模板中定义的列信息，给出数据库中可进行查询的数据，可查询至多设置10个。 描述 当参数设置为可查询时，可以添加描述信息。
新建研究 进入“专题”页面，单击“新建研究”。 图1 新建研究 参考表1，设置运行信息。 表1 参数说明 参数 说明 选择项目 选择创建好，并带有数据的项目。 研究名称 可自定义研究名称。 流程 选择资产市场中订阅的Docking Summary流程。 配体分子 选择上传的配体小分子文件。
工作效率的有效方式。 从搭建、执行NGS流程中可以看出，图形化的操作界面提供了友好、便捷的操作体验，但是当面临大批量的测序数据时，需要重复设置输入、输出、执行等步骤。为进一步提高NGS流程的执行效率，本章节介绍如何通过循环读取输入数据，批量运行NGS。同时，您也可以参考本示例，将批量运行的方法复制到其他的分析任务中。
产品功能 eihealth-toolkit提供了以下功能： 系统设置 您可以使用该工具获取系统标签、系统资源、系统配额信息、消息列表，查询和修改消息及完成作业保留配置，也可以获取和修改供应商logo、名称设置。 项目管理 您可以使用该工具获取、切换、创建、更新、删除和转移项目，也可以添加、修改、移除项目成员角色。
fastp-file2。 图8 设置fastp输入数据 将GRCh38目录指定成bwa-mem与picard-insertsize的输入。 图9 设置bwa-mem输入数据 图10 设置picard-insertsize输入数据 若是想查看已经设置好的参数，可以按照下图步骤进行查
bd_logo1.png /opt/ #设置环境变量 ENV WEBAPP_PORT=9090 #设置工作目录 WORKDIR /opt/ #设置启动命令 ENTRYPOINT ["ls"] #设置启动参数 CMD ["-a", "-l"] #设置卷 VOLUME ["/data"
项目名称。取值范围3~45个字符，包含数字、小写字母、下划线、中划线，且只能以小写字母数字开头结尾。 项目创建成功后，不支持修改名称。 描述 设置项目描述。 图2 创建项目 单击“确认”，创建一个新的项目。 项目的创建者默认拥有项目的完整权限，同时项目可以分享给其他用户，并限定其他用
据库，在导入数据，需要参照数据库模板格式进行导入。 您可以导入本项目或使用其他项目中的数据生成数据库。 选择好文件后，通过设置数据的分隔符、跳过的行数来设置有效数据的起始位置。 常见的分隔符有“;”、“,”、“\t”，除此之外您也可以使用其他分隔符。以图1为例，分隔符为制表符，创
单击“下一步”，在对接设置页面配置相关参数。 图3 设置参数信息 引擎：对接引擎支持DSDP，AutoDock Vina和Similar Docking。DSDP是由北大高毅勤团队研发的基于GPU加速的对接方法，支持全局对接。 如果对接引擎选择Similar Docking，不需设置口袋信息，
对于pod配置，暂不支持用户侧设置。若用户侧设置的情况下可能会导致对应Process执行失败。相关信息可参考https://www.nextflow.io/docs/latest/process.html#pod 对于publishDir配置，用户侧设置时需要使用一定的技巧。目前测试结果表明下面两种写法是可行的，
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