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PRIVATE PUBLIC RAW url String 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 format String 文件格式，仅支持PDB，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：1
workflow_file String 流程的文件名 workflow_file_url String 流程的文件名下载地址 main_file String 主文件名 params_file String 用户上传时使用的参数文件名 params Array of NextflowParamsDto
在“作业”列表中，可单击作业名称查看作业信息和输入输出数据。 图8 查看作业信息 单击输出路径，可跳转至输出文件位置。html文件支持在线预览，zip文件可下载至本地查看。 图9 输出数据 图10 预览html文件 图11 获取zip文件 父主题： 运行作业
String 文件URL，用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 format String 文件格式，支持PDB、SDF、MOL2、SMI，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：1 最大长度：6 data String 文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。
最小长度：1 最大长度：512 数组长度：10 - 10000 molecule_file DrugFile object 分子文件，分子表达式列表和分子文件二选一，分子文件优先级最高。 num_trials Integer 生成分子数量。 最小值：0 最大值：5000 initial_dataset_size
平台也提供了yaml格式的数据库模板，您可以在本地编辑完成后上传至平台进行使用，数据库模板支持yaml或yml格式，且文件大小不能超过10M。 导入方式选择“上传”，单击“下载示例文件”下载数据库模板示例，编辑后上传模板文件至平台，单击“确定”。 图2 上传模板 模板示例如下： database: name:
据集，作为该流程的原始输入。数据集总大小约 216MB。 docking summary测试数据 配体文件：小分子化合物SMILES结构式文件。 受体文件：蛋白3D结构PDB文件。 RNA-Seq测试数据及参考基因组数据集 RNA-Seq-Dataset数据集包含RNA-Seq分
--md5s -m 否 网络下载链接对应的md5列表，值用; 分隔，和网络数据链接一一对应。值用于下载完后对文件进行md5校验。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Li
PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 format 否 String 文件格式，仅支持PDB，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：1
NextflowJobReportFile objects 作业报告文件列表 表4 NextflowJobReportFile 参数 参数类型 描述 name String 报告文件名 最小长度：1 最大长度：1024 download_url String 报告文件下载地址 最小长度：1 最大长度：1024
v0.11.5 方法2：通过Dockerfile制作FastQC镜像。 执行vi Dockerfile命令，进入Dockerfile文件中，编写文件。 FROM ubuntu:16.04 # FastQC依赖java运行，需安装java环境。安装执行下载、解压缩的软件包 RUN apt-get
设置GPU大小。 内存 设置内存大小。 存储路径 单击“存储路径”右侧文件夹图标，设置用于存储Notebook数据的OBS路径。如果想直接使用已有的文件或数据，可将数据提前上传至对应的OBS路径下。 用户在Notebook列表的所有文件读写操作是基于所选择的OBS路径下的内容操作。 参数确认无
应用管理命令 应用配置文件说明 创建应用 修改应用 查询应用 删除应用 导入应用
Double cpu占用率 mem_percent Double 内存占用率 rchar Long 读取字符数 wchar Long 写入字符数 read_bytes Long 读取字节数 write_bytes Long 写入字符数 vmem Long process虚拟内存大小
单击具体的每个应用，可以查看每个应用的运行信息：输入输出，节点参数，应用以及日志等信息。 单击具体的输出参数便可跳转到具体的文件位置。 图14 查看应用信息 图15 查看输入、输出数据位置 单击输出参数路径，可以跳转至输出文件位置。 图16 获取输出数据 父主题： 运行作业
是否必选 参数类型 描述 limit 否 Integer 读取条数 最小值：1 最大值：1000 缺省值：100 name 否 String notebook名称 最小长度：1 最大长度：200 offset 否 Integer 读取偏移量 最小值：0 最大值：100000000 缺省值：0
EIHealth流程管理命令 流程配置文件说明 创建流程 修改流程 查询流程 删除流程 导入流程
EIHealth作业管理命令 作业配置文件说明 启动作业 查询作业详情 删除指定作业 重试作业 取消作业 导出作业 获取任务实例
盘古辅助药物 为什么下载的部分靶点文件，显示不完整 自定义数据库常见问题
OBS桶管理 获取用户OBS桶列表 获取用户OBS桶内对象 文件下载 父主题： 数据管理
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