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拷贝至“/share”目录。 make mpi 步骤3 配置lammps 算例输入文件。 以melt为例,生成一个算例melt.in文件。设置每迭代100步生成一个checkpoint文件,假定该文件存放在共享目录“/share”中。内容如下: # 3d Lennard-Jones
Platform MPI 操作场景 本节指导用户在ECS上安装和使用Platform MPI应用(以版本platform_mpi-09.01.04.03r-ce为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装Platform MPI。 执行以下命令,安装需要的库文件。
基于STAR-CCM+部署HPC集群 方案概述 资源和成本规划 STAR-CCM+部署HPC集群流程图 实施步骤 附录 父主题: 弹性云服务器场景最佳实践
在HPC集群上运行Spectrum MPI 在HPC集群上运行Intel MPI 在HPC集群上运行Platform MPI 父主题: 弹性云服务器场景典型应用
本节指导用户安装和使用IB驱动自带的OpenMPI(以版本3.0.0rc6为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 检查是否已安装IB驱动。 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 执行以下命令,切换为root 用户。 $ sudo su 执行以下命令,防止系统超时退出。
企业分支、科研组织机构等跨全球地理位置进行及时协同工作,提高效率。 可以利用公有云的跨地域能力,共享计算资源,海量数据,并能实现云端大数据分析。 优化性能 性能比普通云服务器大幅提升。 通过虚拟化优化(SR-IOV、PCI直通)等,各类测试报告显示:大规模云化HPC性能损耗不大。 约束与限制 MPI和通讯库的
第1个1表示备份文件系统,第2个1表示从/分区的顺序开始fsck磁盘检测,0表示不检测,_rnetdev 表示主机无法挂载直接跳过,避免无法挂载主机无法启动。 设置服务开机自启动 systemctl enable rpcbind systemctl enable nfs 父主题: 实施步骤
3的OS为例在单节点上运行MPI应用。 裸金属服务器场景支持使用的MPI 安装和使用IB驱动自带的Open MPI 安装和使用社区OpenMPI 安装和使用Spectrum MPI 安装和使用Intel MPI 安装和使用Platform MPI 父主题: 裸金属服务器场景典型应用
实施步骤 创建HPC私有镜像 创建弹性云服务器 配置节点互信 创建SFS Turbo 挂载共享目录 通讯录安装 MPI安装 STAR-CCM+安装与运行 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
附录 常见问题 主要概念 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
提供按需扩展的高性能文件存储。 华为 1 以华为云管理控制台显示为准。 6 虚拟私有云(VPC) 为云服务器等云上资源构建隔离、私密的虚拟网络环境。 华为 1 以华为云管理控制台显示为准。 7 云硬盘(EVS) 为ECS、BMS等计算服务提供持久性块存储的服务。 华为 >1 以华为云管理控制台显示为准。
6的操作系统为例在集群上运行MPI应用。 安装和使用IB驱动自带的Open MPI 安装和使用社区OpenMPI 安装和使用MPICH 父主题: 裸金属服务器场景典型应用
主要概念 RDMA RoCE 父主题: 附录
Spectrum MPI。 将1.a中下载的MPI软件包上传至运行MPI的BMS内(建议“/home/rhel”目录下)。 执行以下命令,设置环境变量。 如果选择自动接受IBM Spectrum MPI安装许可协议,执行以下命令: # export IBM_SPECTRUM_MP
sysctl -a | grep ipv4 | grep range 修改内存限制 设置方法: 设置在内存中锁定进程的最大值无限制(单位:kbytes):ulimit -l unlimited 设置堆栈的最大值无限制(单位:kbytes):ulimit -s unlimited 验证方法:
Turbo 功能介绍 SFS Turbo提供按需扩展的高性能文件存储(NAS),可为云上多个弹性云服务器(Elastic Cloud Server,ECS),容器(CCE&CCI),裸金属服务器(BMS)提供共享访问,能够弹性伸缩至320TB规模,具备高可用性和持久性,为海量的小文件、低延迟高IOPS型应用提供有力支持。
常见问题 RoCE网络问题 STAR-CCM+启动相关问题 父主题: 附录
RoCE RoCE概念 RDMA over Converged Ethernet (RoCE)是一种网络协议,允许应用通过以太网实现远程内存访问。目前RoCE有两个协议版本,v1和v2。其中RoCE v1是一种链路层协议,允许在同一个广播域下的任意两台主机直接访问。而RoCE v
MPI安装 Platform MPI安装 PlatformMPI使用STAR-CCM+自带的,不需要安装。 OpenMPI安装(可选) 若使用STAR-CCM+自带的,可不用安装。 cd /root tar zxvf openmpi-4.0.1.tar.gz cd openmpi-4
IB驱动自带的OpenMPI 社区OpenMPI Spectrum MPI Intel MPI Platform MPI 父主题: 裸金属服务器场景典型应用