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批量执行NGS分析 对于测序得到的大量数据，批量并自动执行NGS分析是提高工作效率的有效方式。 从搭建、执行NGS流程中可以看出，图形化的操作界面提供了友好、便捷的操作体验，但是当面临大批量的测序数据时，需要重复设置输入、输出、执行等步骤。为进一步提高NGS流程的执行效率，本章节
搭建NGS流程 登录医疗智能体平台，进入项目并选择“工具 > 流程”页签，单击“新建流程”。 图1 新建流程 在弹出的“流程设置”页面填写“流程名称”和“版本”，其他参数可选填。参数填写完成后，单击“确定”，完成流程设置。 在流程设计器左侧应用列表中选择fastp、bwa-mem应用，并使用鼠标拖拽至画布中。
cn-north-4.myhuaweicloud.cn HTTPS 华东-上海一 cn-east-3 eihealth.cn-east-3.myhuaweicloud.com eihealth.cn-east-3.myhuaweicloud.cn HTTPS 华南-广州 cn-south-1 eihealth
ID。 图1 查看项目ID 调用API获取项目ID 项目ID通过调用查询指定条件下的项目信息API获取。 获取项目ID的接口为GET“https://{Endpoint}/v3/projects”，其中{Endpoint}为IAM的终端节点，可以从地区和终端节点获取。 响应示例如
响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 数据作业ID 请求示例 导入网上数据，数据链接为https://www.hhh.com/test.txt，目的目录为test。 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{pro
询和下载相关信息。相关信息可参考https://www.nextflow.io/docs/latest/tracing.html 对于pod配置，暂不支持用户侧设置。若用户侧设置的情况下可能会导致对应Process执行失败。相关信息可参考https://www.nextflow.
制作并上传镜像 NGS流程由fastp、bwa-mem、picard-insertsize、qualimap-bamqc、gatk-markduplicates、gatk-bqsr、gatk-applybqsr、gatk-haplotypecaller、gatk-mergevcf
资产市场简介 资产市场是在EIHealth平台的基础上构建的开发者生态社区，提供镜像、数据、应用和流程的内容共享。提供安全、开放的资产共享和使用，加速基因、药物、临床应用的开发与落地，保障开发生态链上各参与方高效地实现各自的商业价值。 订阅资产 资产市场提供官方发布的镜像、数据、
nname为账号名，********为用户登录密码，project name为项目名称。可登录控制台“我的凭证”页面获取。 POST https://iam.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v3/auth/tokens Content-Type:application/json
应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度：1 最大长度：32768 响应参数 无 请求示例 删除数据库 https://{endpoint}/v1/{project_id}/databases/{database_id} 响应示例 无 状态码 状态码
响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度：1 最大长度：32768 响应参数 无 请求示例 删除标签 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/system/labels/{label_id}
头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度：1 最大长度：32768 响应参数 无 请求示例 删除css集群。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/drug/css-clusters/{css_cluster_id} 响应示例
启动一个空白的基础容器，并进入容器。 例如，启动一个CentOS容器。 docker run -it centos 安装依赖包。 yum -y install https://dl.fedoraproject.org/pub/epel/epel-release-latest-8.noarch.rpm yum
头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度：1 最大长度：32768 响应参数 无 请求示例 修改跨域归档设置 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/system/arch
响应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度：1 最大长度：32768 响应参数 无 请求示例 收藏资产 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/assets/{asset_id}/stars
NodeLabelRsp objects 数据对象列表 表4 NodeLabelRsp 参数 参数类型 描述 name String 标签名称 请求示例 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/system/nodes/labels
quantity Integer 剩余服务器数 cpu Integer 剩余CPU ram Integer 剩余内存 请求示例 获取节点剩余配额 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/system/comp
应消息头中X-Subject-Token的值即为Token。 最小长度：1 最大长度：32768 响应参数 无 请求示例 取消收藏。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id
String 认证方式:sms，email，vmfa 最小长度：1 最大长度：128 响应参数 无 请求示例 发送验证码，发送方式为email https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/users/{user
数组长度：1 - 50 operation 是 String 通知消息操作 枚举值： read 响应参数 无 请求示例 批量更新消息状态为已读 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/notices/batch-update
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