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下载数据 在EIHealth平台下载数据 下载数据操作会产生流量费用,计费方式为按需计费,计费详情请参考OBS数据下载费用。 以下操作步骤是在“数据”页面下载数据至本地。您也可以使用命令行工具实现数据的下载。 在EIHealth平台“项目 > 数据”页面,展开数据文件夹,选择待下载的数据。
创建流程 使用create workflow命令引用本地的配置文件,创建流程。 命令结构 health create workflow [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --yaml -y 否 本地的流程模板路径。获取流程模板方法请参见流程配置文件说明。
步骤4:创建并使用Notebook 步骤1:安装容器引擎 在制作自定义镜像时,您需要准备一台安装有Docker的机器。请使用自己的电脑搭建Docker环境,或者使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 例如,在Linux操作系统下,可以使用如下命令快速安装容器引擎。 curl
似下图,请先添加计算节点标签。 计算节点标签添加方法:在平台右上角单击用户名,选择“系统资源 > 计算资源”,在计算节点的操作列单击“更多 > 标签管理”,添加标签。上图示例中需要添加的标签名称为labelsss1。 使用本地已填写好的作业模板job.yaml运行分析作业。 health
Notebook 如何使用Notebook的Terminal功能? 如何将Notebook中的数据下载至本地? 如何在Notebook中安装外部库?
Failed 未满足前提条件,服务器未满足请求者在请求中设置的其中一个前提条件。 413 Request Entity Too Large 由于请求的实体过大,服务器无法处理,因此拒绝请求。为防止客户端的连续请求,服务器可能会关闭连接。如果只是服务器暂时无法处理,则会包含一个Retry-After的响应信息。
数据导入、流程执行完成等,给予状态通知。 单击平台右上角图标,在弹出的“消息中心”中查看异步任务的操作记录和系统通知。 系统通知 在系统通知页签,可以查看系统通知的内容、时间。单击某个消息,可查看消息的详细内容。可以在该页面面查看全部、未读和已读的消息。平台首页也会有未读消息提示。
程不能中断。在执行完成后,“取消”操作才能生效。 删除:运行中的任务不支持删除,只可删除运行结束的数据。 重试:可对执行失败的任务从失败位置进行重试。 复制数据 在“数据中心”页面,使用“复制”,将本项目的某一个文件、文件夹复制到其他文件夹中。 单击页面右上角“复制”。 图1 复制数据
lse:不允许加密操作,默认为false) data_share Boolean 项目级分享策略(true:允许项目数据拷贝/引用操作,false:不允许拷贝/引用操作,默认为true) 请求示例 查询项目级数据权限控制策略 https://eihealth.cn-north-4
请将该模板保存为.yaml格式至本地,并在本地完成模板修改。例如,命名为ngs.yaml。 编写执行脚本并提交作业 运行分析作业时,流程中的每一个应用称之为一个任务(Task),通过循环读取Task的输入数据,可以实现作业的批量执行。 例如,您可以在本地创建.bat格式的批处理文件,执行该脚本即可批量运行NGS分析作业。
默认为false) 缺省值:false data_share 是 Boolean 项目级分享策略(true:允许项目数据拷贝/引用操作,false:不允许拷贝/引用操作,默认为true) 缺省值:true 响应参数 无 请求示例 设置项目级权限控制策略,设置项目级数据可删除,可下载,可分享,启动加密模式。
tag-name> 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 source-image-name 无 是 本地源镜像名称。 source-tag-name 无 是 本地源镜像tag名称。 target-image-name 无 是 新创建的镜像名称。 target-tag-name
块 > 通用工具 > MOL 3D Viewer”,进入MOL 3D Viewer页面即可操作。 主要功能包括: 本地分子结构的3D可视化,支持多种显示样式,支持本地文件拖拽进画布区域进行渲染。 大分子支持PDB编号自动下载。 相互作用的可视化。 支持分子的编辑、标注。 测量、测量距离、角度、二角面等。
获取作业模板 使用health get job -s命令获取启动分析作业的模板,复制并保存模板至本地,您可以保存成.yaml或.txt文件,保存为txt文件时,其内容需为yaml格式。 在本地编写模板,模板中的参数与在EIHealth平台启动作业过程一致。模板修改好后,再使用命令行工具上传模板,启动分析作业。
扩大配额。 EIHealth平台应用的基础设施如下: 统一身份认证(IAM) 容器镜像服务(SWR) 对象存储服务(OBS) 关于如何查看配额,如何申请扩大配额,请参见“《用户指南》 配额管理”章节。
通过“上传作业”创建 通过在本地修改作业的yaml模板,运行分析作业。 获取作业yaml模板。 在“项目管理 > 作业”页签中,单击“上传作业”,在弹出的页面中下载yaml示例文件。 使用命令行工具,执行health get job -s命令获取创建作业的yaml模板,复制模板并保存到本地。可以保存成
None 医学文本标注 医疗智能体 EIHealth 使用ModelArts进行数据管理和标注 07:08 医学文本管理和标注 医疗智能体 EIHealth 使用ModelArts进行团队标注 05:44 医学文本团队标注 药物虚拟筛选 医疗智能体 EIHealth 药物虚拟筛选
复制项目数据 功能介绍 复制项目数据 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI POST /v1/{project_id}/eihealth-projects/
用户可将归档数据恢复到项目桶,恢复到项目桶后,平台不会进行删除(恢复到项目桶中的数据会正常收取标准存储的费用)。 在归档管理页面,可以在“归档天数”列查看已归档天数(从归档拷贝完成时间开始算)。若用户早于90天删除归档数据,将收取费用,收取的费用=对应存储类别存储空间按需月单价*容量*剩余天数/30,超过90天不需要补。
繁读写场景的任务建议开启IO加速,开启前需要先购买性能加速。 本地盘加速:使用计算节点的本地盘进行加速。使用本地盘加速时,需保证购买的计算节点带有“数据盘”。OBS桶中的数据不支持本地盘加速,使用OBS桶中数据用于本地盘加速,可能会导致作业运行失败。 使用OBS桶中的数据投递作业时,当数据大于40G时作业会投递失败。