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输出 BamQC Report 测序比对数据的质量控制报告，以HTML文件的形式展示。 输出 VCF 样本的突变信息，包含有SNP和INDEL信息，以VCF的格式存储。 输出 VCF Report 样本突变信息的质量控制报告，以HTML文件的形式展示。 表2 参数说明 应用名称
单击“确认”，创建一个新的项目。 项目的创建者默认拥有项目的完整权限，同时项目可以分享给其他用户，并限定其他用户的访问权限。项目角色为项目粒度权限控制，同一用户在不同的项目上可能拥有不同的角色。 创建的项目配额请参见配额管理进行查询。详细添加项目成员并分配角色的方法请参见添加项目成员。 父主题：
流程设计器界面 流程设计器界面由工具栏、资源栏和画布三部分构成。 图1 流程设计器界面 表1 界面说明 区域 说明 工具栏 上方的工具栏显示设计器的快捷控制操作。 由设置、新建作业、保存、另存为、删除、自动保存构成。 资源栏 左侧的资源栏显示项目中可以使用的应用和流程。 画布 中间区域为搭建流程的操作界面。
通过审计日志可用于支撑安全分析、合规审计、资源跟踪和问题定位等常见应用场景。您可以在项目的“数据审计”页面下载最近7天的数据审计日志，其他操作的审计日志请登录云审计服务控制台查看。 图4 数据审计 父主题： 项目管理
查看账号信息 购买服务 医疗智能体平台提供包年包月、按需两种计费方式，您可以按需求进行选择。 关于计费模式的详细介绍，请参见计费说明。 登录华为云管理控制台，在左侧服务列表中选择“人工智能 > 医疗智能体 EIHealth”。 图2 服务列表 进入医疗智能体“总览”页面，单击“EIHealth”。
处理和费用详见“保留期”。保留期满仍未续订或充值，数据将被删除且无法恢复。 当平台处于冻结状态，且资源不再使用，您可以进入EIHealth控制台，在操作列的“更多”中手动删除或释放平台。 图1 删除平台（按需计费） 图2 释放平台（包年包月计费） 话单延迟导致欠费 当前华为云账单
our-proxy:your-port”。 --swr-endpoint -t 是 SWR镜像仓库地址。 获取方式： 登录容器镜像服务管理控制台。 单击界面右侧“登录指令”，获取内网登录指令末尾的SWR镜像仓库地址。例如100.78.15.50:20202。 --iam-endpoint
fastq-extend string fastq文件后缀<extend>，适配不同的后缀。 输出参数 out-dir directory 测序比对数据的质量控制报告的输出目录。 trimmomatic 输入参数 fastq-extend string fastq文件后缀<extend>，适配不同的后缀。
购买服务 盘古辅助制药平台提供包年包月、按需两种计费方式，您可以按需求进行选择。 关于计费模式的详细介绍，请参见计费说明。 登录华为云管理控制台，在左侧服务列表中选择“人工智能 > 医疗智能体 EIHealth”。 图2 服务列表 进入医疗智能体“总览”页面，单击“购买平台”。 图3
在用户管理页面，单击“导入用户”，进入“导入用户”页面。 在导入用户页面，可以选择“用户”或者“用户组”进行导入。 图2 导入用户 导入的IAM子用户需要具有管理控制台访问方式。 导入用户时不能超出配额。如果超出配额，进行配额调整后，5分钟后生效。 以用户组的方式导入时，若超出配额的部分会导入失败。 以
单击项目名称，进入项目“设置”页面。您可以在该页面，查看项目的数据存储量、作业总量、流程数量和应用数量，修改项目是否核心项目。 同时，可以查看项目的基本信息、数据控制信息和成员信息。 图4 项目详细信息 项目状态 可用：项目当前状态正常。项目创建完成后进入“可用”状态，可用状态的项目允许被冻结、删除、转
username为IAM用户名，domainname为账号名，********为用户登录密码，project name为项目名称。可登录控制台“我的凭证”页面获取。 POST https://iam.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v3/auth/tokens
作业设置 场景2 作业投递后处于运行中，但是无日志打印，也没有任何符合预期的输出文件生成。 排查思路 首先需要用户自行确认一下投递的作业是否会在控制台打印日志，如果是有重定向日志输出到具体文件的话，此处无日志为正常现象。 子任务的事件中，确认作业子任务的实例是否有正常创建。 图2 子任务的事件
基于上述比对得到的bam文件，通过GATK4做Variant Calling，输出变异检测结果。 基因组变异检测质控 通过VariantQC对vcf进行质量控制，输出变异数目，变异类型统计等指标。 流程优势 使用Unix管道技术连接比对和排序步骤，以缩短bwa和samtools的存放、读取、删除中间文件的时间。
EIHealth终端节点名称，请在地区与终端节点中获取。 --swr-endpoint -t 否 SWR镜像仓库地址。 获取方式： 登录容器镜像服务管理控制台。 单击界面右侧“登录指令”，获取内网登录指令末尾的SWR镜像仓库地址。例如100.78.15.50:20202。 --log-path
id，不填写时表示获取template列表，填写时表示获取template详情。 --sample -s 否 显示示例yaml文件内容，以yaml格式打印到控制台，需要直接获取示例文件可使用Linux输出流重定向。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例
- /sdsds license: "" health get app -s 获取app.yaml模板，以yaml格式打印到控制台 app: # 系统唯一标识，由系统随机分配，说明如下： # 1. 通过文件创建app时(UI\CMD)，id必须为空，不允许指定
public-read：公共读 public-read-write：公共读写 bucket-owner-full-control：桶拥有者完全控制 --meta -E 否 上传文件时可指定的自定义元数据。格式为：key1:value1#key2:value2#key3:value3。
public-read：公共读 public-read-write：公共读写 bucket-owner-full-control：桶拥有者完全控制 --meta -E 否 复制对象时可指定的目标对象的自定义元数据。 格式为：key1:value1#key2:value2#key3:value3。
public-read：公共读 public-read-write：公共读写 bucket-owner-full-control：桶拥有者完全控制 --meta -E 否 移动对象时可指定的目标对象的自定义元数据。格式为：key1:value1#key2:value2#key3:value3。
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