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上传镜像。 上传镜像。 在“项目管理”页面“镜像”页签中，可查看已上传的镜像。 在平台镜像管理列表中，将已上传的镜像分类为“NOTEBOOK”。 步骤4：创建并使用Notebook 在医疗智能体平台选择“项目管理 > 开发”，进入Notebook管理页面。 图1 创建Notebook
息提醒。 管理员 消息保留即将达到配额提醒 当前消息保留条数达到了配额的90%后，系统会消息提醒。 管理员 待删除项目提醒 待删除项目在删除前的3天，1天，系统会消息提醒。 项目内所有成员 平台即将升级通知 平台即将升级至X.X.X版本。 所有人 平台已升级通知 平台已升级至X.X
选择系统镜像时，工作环境选择“PY3”。 自定义镜像：当提供的镜像无法满足您的需求时，可以使用自己制作的Notebook镜像。镜像制作方法请参见镜像管理。制作Notebook自定义镜像时，需要依赖平台提供的基础镜像，获取地址请参见获取镜像。 CPU 设置CPU大小。 取值范围：1~128，默认为1。 GPU 设置GPU大小。
订阅该镜像。 登录医疗智能体，进入基因平台。 在“资产市场”中查找“autogenome”镜像。 单击界面右侧“订阅”图标，订阅该镜像。 订阅的镜像将显示在“项目管理 > 镜像”页面的镜像列表中。 步骤2：创建Notebook 在“项目管理 > 开发”页面，单击“创建Notebook”，参考表
创建Notebook时，平台为您提供了系统镜像和自定义镜像。 系统镜像 工作环境选择PY3版本。 自定义镜像 创建Notebook时所需的自定义镜像，依赖于医疗智能体平台自研的基础镜像，您需要基于获取的基础镜像制作自定义镜像。 先连接容器镜像服务，参考步骤1.连接容器镜像服务操作，然后使用如下的镜像地址拉取基础镜像。
购买系统资源 医疗智能体平台购买完成后，单击“进入平台”，在平台右上角单击用户名，选择“系统资源”。 您可以根据实际需求选择购买计算资源、性能加速、数据库。在后续使用过程中，也可根据使用情况随时购买资源。 资源看板 在“资源看板”中，您可以实时监控计算资源、存储资源、性能加速、数据库的使用情况。
使用RNA-Seq Analysis Based on STAR流程 使用AutoGenome镜像 genomeagent镜像 父主题： 用户指南（基因平台）
zip，大小不能超过10M。zip包文件个数规格为1024个，单个文件解压后限制，不超过10M。 如果上传的流程中包含镜像，单击镜像管理跳转至本项目的镜像管理列表，进行镜像上传，具体可参考导入或上传镜像。 图1 添加流程文件 添加完成后，单击“下一步”，配置流程参数。 添加参数方式支持
数据归档配置 设置平台数据归档的区域。 在账号下面选择“系统设置”。 图1 选择系统设置 进入系统设置页面，设置数据归档配置区域。 图2 配置数据归档区域 父主题： 系统设置
像到项目中。 登录医疗智能体，进入基因平台。 在“资产市场”中查找“genomeagent”镜像。 单击界面右侧“订阅”图标，订阅该镜像。 订阅的镜像将显示在“项目管理 > 镜像”页面的镜像列表中。 步骤2：创建Notebook 在“项目管理 > 项目名称 > 开发”页面，单击“创建Notebook”，参考表
准备工作 购买服务 购买存储套餐包 购买系统资源 获取认证信息 父主题： 用户指南（基因平台）
当您需要对账号的安全信息进行设置时，可以在“安全设置”中进行操作。平台的任一用户均可对自己的邮箱、手机号码和密码进行修改。 在平台右上角用户名中选择“个人设置”，在“安全设置”中修改账号的安全信息。 图1 安全设置 如果创建平台用户时，未填写邮箱或手机号，则在进行安全设置时，会提示设置邮箱或手机号。
自定义镜像创建Notebook样例 JupyterLab简介及常用操作 url获取方法 Notebook安装Conda指导 父主题： 用户指南（基因平台）
数据上传方法请参见“数据”页面上传。 使用命令行工具上传 命令行工具（eihealth-toolkit）配套EIHealth平台，提供数据、应用、流程和作业资源的管理和使用，支持上传最大为48.8TB的单个文件。 数据上传方法请参见命令行工具概述。 对于非挂载目录以外的目录下的文件，重
当前Nextflow相关特性仅为公测版本，部分功能暂不支持，因此存在如下限制约束。 流程使用的镜像和数据需要按照医疗智能体（EIHealth）平台的规范进行上传 推荐通过eihealth-toolkit进行上传。eihealth-toolkit介绍详见什么是医疗智能体eihealth
NGS”流程。 单击界面右侧“订阅”图标，订阅该流程。 订阅的流程将显示在“项目管理 > 工具”页面的流程列表中。 步骤2：上传待分析数据 您在使用NGS流程前，请先上传待分析的数据，上传数据方法请参见数据管理。数据要求是成对的双端测序样本，即您需要上传两个样本数据文件，例如：xxx.R1
计费说明 计费模式 基因平台 基因平台提供包年包月、按需两种计费方式，您可以按需求进行选择，计费详情请参见价格计算器。 盘古辅助制药平台 盘古辅助制药平台提供包年包月、按需两种计费方式，您可以按需求进行选择，计费详情请参见价格计算器。 OBS数据下载 OBS数据下载产生的流量费用
单击界面右侧“订阅”图标，订阅该流程。 订阅的流程将显示在“项目管理 > 工具”页面的流程列表中。 步骤2：上传待分析数据 您在使用Docking Summary流程前，请先上传待分析的数据，上传数据方法请参见数据管理。 步骤3：创建分析作业 单击项目名称，进入“项目管理”页面，并选择“工具”页签。 单击Docking
资源包到期后，按需资源不会自动关闭，将会以按需付费的方式继续使用。 超出套餐包部分的用量，将会按需收费。 若平台先到期，套餐包还没到期，则不退套餐包剩余的费用。如果平台续费成功后，套餐包可以继续使用。 资源包不能抵扣已经产生的用量。 父主题： 准备工作
Notebook的下一代产品，可以使用它编写Notebook、操作终端、编辑MarkDown文本、打开交互模式、查看csv文件及图片等功能。 可以说，JupyterLab是开发者们下一阶段更主流的开发环境。JupyterLab支持更加灵活和更加强大的项目操作方式，但具有和Jupyter Notebooks一样的组件。
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