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响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 资产id version String 资产版本 请求示例 发布数据资产,数据资产名称为eihealth-asset,版本为1。 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v
最大长度:128 version 是 String 镜像资产版本 最小长度:1 最大长度:128 响应参数 状态码: 200 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 镜像id 请求示例 订阅镜像,选取指定资产和版本订阅 https://eihealth.cn-north-4
是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1 最大长度:128
查询自动作业模板 功能介绍 查询自动作业模板 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/auto-jobs/{auto_job_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id
WorkflowListDto objects 所查询类型的流程总数 count Integer 当前页的流程列表 表5 WorkflowListDto 参数 参数类型 描述 id String 流程id name String 流程名称 version String 流程版本 summary String
餐包。在后续使用过程中,也可根据使用情况随时购买资源。 资源中心 在“资源中心>功能调用”中可以查看功能调用套餐包的使用情况。 图1 功能调用套餐包 在“资源中心>存储资源”中可以查看存储使用量等信息。 图2 存储资源信息 购买功能调用套餐包 在“资源中心>功能调用”页面,购买功能调用套餐包。
镜像tag名称 status String 删除结果 failed_reason String 失败原因 请求示例 批量删除镜像版本,删除v1.0,v2.0版本 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}
下: 登录管理控制台。 单击用户名,在下拉列表中单击“我的凭证”。 在“API凭证”页面的项目列表中查看项目ID。 图1 查看项目ID 调用API获取项目ID 项目ID通过调用查询指定条件下的项目信息API获取。 获取项目ID的接口为GET“https://{Endpoint}/
ize应用。 图1 订阅应用 可以在“工具 > 应用”列表可以看到刚刚订阅的应用。 图2 查看订阅的应用 步骤2:新建流程 在“工具 > 流程”页面,单击“新建流程”按钮,填写流程名称,版本等信息。 图3 新建流程 利用拖拽的方式将左侧边栏应用列表中的需要执行的应用拖拽到中间画布
Nextflow引擎生命周期管理 安装Nextflow 查询Nextflow配置详情 卸载Nextflow 清理Nextflow缓存 查询Nextflow版本列表 父主题: Nextflow接口
查询计算资源 功能介绍 查询计算资源 URI GET /v1/{project_id}/system/computing-resources 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1
-variantqc应用构成。在创建应用前,请先制作并上传应用所需的镜像。搭建NGS流程所需的镜像和版本如表1所示。 表1 NGS流程镜像信息 NGS流程步骤 描述 依赖镜像及版本 镜像下载命令 Read Quality 对测序得到的fastq数据进行质控。 fastp:0.20
数据管理常用操作 复制数据 下载数据 删除数据 查看3D 执行数据管理类操作需要项目成员具备相应的权限,详细的权限介绍请参见项目成员和权限。 数据文件的名称,不可以含有特殊字符。如果文件名包含特殊字符,将不支持下载,可通过去除文件名中的特殊字符方式解决。 查看数据作业 数据复制、数据删除等操作
资产封面图访问链接 vendor_id String 供应商id versions Array of VersionRsp objects 资产版本号列表 create_time String 创建时间 update_time String 更新时间 stars Integer 收藏数
最大长度:128 limit 否 Integer 查询条数 最小值:1 最大值:1000 缺省值:100 message_type 否 String 消息类型 最小长度:1 最大长度:128 offset 否 Integer 查询偏移量 最小值:0 最大值:100000000 缺省值:0
下待载文件大小与本地文件大小不一致。 文件的最后修改时间不一致。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 下载数据前需要使用switch命令进入待操作的项目。例如,使用health switch project
参数确认无误后,单击“立即创建”,创建应用。 表1 fastp、bwa_samtools应用参数说明 应用名称和版本 应用名称:fastp 版本:0.20.1 应用名称:bwa_samtools 版本:0.7.17 镜像和启动命令 镜像:fastp:0.20.1 启动命令: fastp --fix_mgi_id
MOL Editor Mol Editor工具可以查看小分子的2D结构,以及编辑分子结构。 单击“功能模块 > 通用工具 > MOL Editor”,进入Mol Editor页面即可操作。可以通过单击右上角的“保存”,将编辑的分子结构保存在数据中心。 图1 保存分子结构 父主题:
单击镜像名称,进入镜像详情页。在该页面查看“源项目”、“镜像名称”、“镜像版本”,按照以下规则拼接出应用配置模板中的image参数。 {project-name}/{image-repo}:{image-version} #源项目/镜像名称:镜像版本,例如htt_test-01/qvina_w:1