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推荐扫码认证(即时完成认证) 请参见如何进行扫码认证。 银行卡认证(即时完成认证) 请参见如何进行银行卡认证。 证件认证(1-3个工作日) 请参见如何进行证件认证。 企业账号 推荐银行对公账户认证(最快30分钟) 请参见如何进行企业银行对公账户打款认证。 企业证件认证(0-3个工作日) 请参见如何进行企业证件认证。
查看药筛作业和结果下载 查看作业进程 用户可以在“项目 > 作业”中查看药筛作业的后台进程。 图1 查看作业进程 对接完成后的小分子构象下载 单击应用中的“qvina-w”,获取输出结果的路径。 文件的命名方式为:蛋白质名称_vs_配体名称_blinddock.pdbqt。 图2
NGS流程中需使用二代测序得到的原始fastq文件、参考基因组序列、参考Variants数据集。 本示例中以Windows系统命令行工具为例,介绍如何将本地数据上传到EIHealth平台。更多的命令介绍请参见命令行工具。 使用命令行工具,用switch命令进入待操作的项目。 例如,使用health
应用的参数和镜像启动命令如何设置 创建应用时,需要设置应用的输入、输出参数和镜像的启动命令。需要您熟悉所制作的生物信息学软件的使用并具备一定的开发经验。 例如,设置FastQC应用的参数和镜像启动命令时,首先通过阅读FastQC介绍和FastQC命令说明了解软件的使用。并依照Fa
如何将Notebook中的数据下载至本地 在Notebook页面,可以通过“Upload”和“Download”上传和下载文件。当在Notebook中上传文件提示大小受限时,您可以根据以下不同场景将大文件上传或下载到Notebook中。 图1 上传和下载文件 OBS存储类型的Notebook
project-name 无 否 项目名称,不填时默认为当前所在项目。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 执行以下命令,删除项目demo-project。 health delete project
Windows health docker push demo-image:v1.0 -d "this is a desc" -t APP Linux ./health docker push demo-image:v1.0 -d 'this is a desc' -t APP 上传成功返回值
如果cmd窗口显示目录不是health文件所在目录,请使用cd命令切换路径。例如,切换至D盘: cd /d d: 使用Linux版本命令行工具时,您需要在本地搭建Linux环境,并将下载的health文件放至所需的目录下。 如果当前目录为health所在目录,可以使用./health命令使用命令行工具。
再基于流程创建分析作业。 在“项目管理”页面“作业”页签中,以列表形式展示了项目中运行的分析作业和运行状态。您可以查看分析作业名称、标签、所使用的流程名称、版本、运行状态、创建者、创建时间、完成时间和总耗时。并可对作业执行重试、取消、删除、克隆、导出操作。对于列表中的作业,支持
直接挂载OBS目录进行大规模计算,如何解决偶现报错 问题现象 运行作业时,作业直接挂载OBS目录进行大规模计算。偶现“异常应用”,并日志报错input/output error或file xxx not exists。 问题原因 OBS集群到计算集群之间的带宽达到了上限。 OBS集群的IOPS达到了上限。
push fastqc:v0.11.5 执行health docker images命令查看已有的镜像。 详细的命令介绍请参见“命令行工具 > 镜像管理命令”章节。 登录EIHealth平台,在镜像列表中查看已上传的镜像。 步骤4:创建应用 登录EIHealth平台,在“项目管理”页面“工具”页签中,单击“新建应用”。
单击平台右上角图标,在弹出的“消息中心”中查看异步任务的操作记录和系统通知。 系统通知 在系统通知页签,可以查看系统通知的内容、时间。单击某个消息,可查看消息的详细内容。可以在该页面面查看全部、未读和已读的消息。平台首页也会有未读消息提示。 图1 平台首页查看消息通知 图2 查看系统通知 支持标记为已读和批量标记为已读
获取,或者通过结果清单文件名查询(文件名除去后缀.txt后的后36位)。 待恢复的下载任务会从结果清单的文件夹中查找,结果清单文件夹的路径参考附加参数--o。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。
响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 资产id version String 资产版本 请求示例 发布应用资产,资产名称为demo-app,版本为1.0.0 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{proj
响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 资产id version String 资产版本 请求示例 发布流程,流程的名称为demo-workflow,版本为1.0.0。 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{p
响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 应用id 请求示例 订阅应用,订阅后应用名称为dest_app_name,应用版本为1.0.0 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/eiheal
参数 参数类型 描述 id String 流程id 请求示例 订阅流程,订阅后流程的名称为dest_workflow_name,版本为1.0.0。 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/eiheal
状态码: 201 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 镜像id 请求示例 创建镜像,设置描述、名称、版本、类型、芯片类型 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/eihea
在作业详情页面查询和下载相关信息。相关信息可参考https://www.nextflow.io/docs/latest/tracing.html 对于pod配置,暂不支持用户侧设置。若用户侧设置的情况下可能会导致对应Process执行失败。相关信息可参考https://www.nextflow
和数字。 展示名称 发布成功后在组织共享中展示的名称。若不填写,展示的名称和流程名称相同。发布成功的流程不支持修改展示名称。 版本 发布流程的版本。 版本长度必须为1-24个字符,以字母或数字开头(多个字符可以连续),中间只能包含-.特殊符号(多个特殊符号不能连续),以字母或数字结尾。