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health mkdir dataset # 创建成功不进行提示,可以使用health ls命令查看目录 父主题: 数据管理命令
获取流程模板方法请参见流程配置文件说明。 --description -d 否 流程的详细描述信息。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。
覆盖关系:作业->流程->应用 最小长度:0 最大长度:24 响应参数 无 请求示例 更新自动作业,更新自动作业的名称为demo-auto-job,使用的数据库列为user_name。
为保证访问密钥的安全,访问密钥仅在初次生成时自动下载,后续不可再次通过管理控制台页面获取。请在生成后妥善保管。 父主题: 数据管理
创建应用 使用create app命令引用本地的配置文件,创建应用。 命令结构 health create app [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --yaml -y 否 本地的应用模板路径。获取应用模板方法请参见应用配置文件说明。
磁盘加密:选择加密后会提高数据安全性,但对数据库读写性能有少量影响,请按照您的使用策略进行选择。 计费模式:选择“包年包月”或“按需”计费。 购买时长:如果选择的“包年包月”计费,根据实际需求选择购买时长;如果选择的“按需”计费,无需选择购买时长。
图1 作业设置 场景2 作业投递后处于运行中,但是无日志打印,也没有任何符合预期的输出文件生成。 排查思路 首先需要用户自行确认一下投递的作业是否会在控制台打印日志,如果是有重定向日志输出到具体文件的话,此处无日志为正常现象。
最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 状态码: 200 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 count Long 数据对象(目录,文件)总数量 datas Array of TraceDataRsp objects 数据对象列表 bucket_size Long
在右侧文件展示区,您可以拖动打开文件,随意调整文件展示位置,可以同时打开多个文件。 图8 多文件任意编排 当在一个Notebook中写代码时,如果需要实时同步编辑文件并查看执行结果,可以新建该文件的多个视图。
database_id String study作业结果的数据库实例id relative_path String 生成study作业结果的文件的相对路径 output_file_type String 生成study作业结果的文件的类型 workflow_name String
单击“下一步”,添加流程文件。 单击“流程文件”后面的“添加”,添加流程文件。 如果流程文件上传的是zip包,则可以选择添加“主文件”。主文件必须为.nf,为压缩文件夹中的文件完整路径。例如:main.nf。若不填写,默认为main.nf。
未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。
下载流程文件 单击流程名称,进入流程详情页面,单击流程文件后的“下载”,可下载该流程文件。 下载流程参数 单击流程名称,进入流程详情页面,单击流程参数后的“下载”,可下载该流程设置的参数文件。 图1 下载流程文件/参数 父主题: Nextflow
database_id String study作业结果的数据库实例id relative_path String 生成study作业结果的文件的相对路径 output_file_type String 生成study作业结果的文件的类型 workflow_name String
概述 欢迎使用医疗智能体(EIHealth)平台,该服务基于华为云AI和大数据技术优势,为基因组分析、药物研发和临床研究三个领域提供的专业AI研发平台。平台提供大量相关模型、算法及数据资源,是一站式的医疗研发平台。
删除模板 功能介绍 删除模板 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI DELETE /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id
参数 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 模板名称 最小长度:3 最大长度:32 description 否 String 模板描述 最小长度:0 最大长度:1024 columns 是 Array of DatabaseColumnDto objects 数据库列信息
String 来源项目名称 source_project_id String 来源项目id source_template_id String 来源模板id creator String 创建者 columns Array of DatabaseColumnDto objects 数据库列信息列表
对于STRING类型,匹配字符串内容,比如后缀约束.fastq;对于ENUM类型,可以提示一定要在param_enum列表范围内取值;对于FILE类型,约束文件后缀类型;对于DIRECTORY类型,提示目录下需要包含哪些文件; 最小长度:0 最大长度:64 values Array
--main_file -m 否 流程主文件名。 --params -p 否 本地json/yaml格式参数文件路径。