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单击流程名称，进入流程详情页面，单击流程文件后的“下载”，可下载该流程文件。 下载流程参数 单击流程名称，进入流程详情页面，单击流程参数后的“下载”，可下载该流程设置的参数文件。 图1 下载流程文件/参数 父主题： Nextflow
图4 拖拽应用 设置输入、输出关系。 fastp的两个输出参数fq-file1和fq-file2是bwa-mem算法的输入参数，bwa-mem的sorted-bam参数是bamqc与picard-insertsize输入参数，参考图进行连接。 图5 设置输入、输出关系 若想修
单击“新建应用”，创建fastqc应用。 图3 设置镜像名称、版本等信息 镜像启动命令如下所示。镜像启动命令需要引用输入、输出参数中的变量，并以大括号{}扩起，以$符号进行引用。 fastqc -f fastq -o ${output-dir} ${input-file} 图4 设置CPU、内存、输入输出参数
查看的文件、文件夹对象。 注意： 如果为引用数据，必须要使用绝对路径（文件夹最后要加/）。未引用的数据不能查看。 --bf -b 附加参数，可选 设置是否以人方便阅读方式输出结果。取值包括：human-readable、raw。 --e -P 附加参数，可选 指定终端节点。 --i -i
后，平台不会进行删除（恢复到项目桶中的数据会正常收取标准存储的费用）。 在归档管理页面，可以在“归档天数”列查看已归档天数（从归档复制完成时间开始算）。若用户早于90天删除归档数据，将收取费用，收取的费用=对应存储类别存储空间按需月单价*容量*剩余天数/30，超过90天不需要补。
行最多输入1024个字符，SMILES不支持输入空格或者中文。 作业名称：设置作业名称。长度为5~64个字符，仅可以使用字母、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格，首位只能以数字或字母开头。 标签：设置任务标签。 功能调用消耗：100000个小分子记一次功能调用。 配置完成后，单击“提交”。
医疗智能体平台API 类型 API 说明 项目管理 项目管理 项目创建、获取项目详情、删除项目等相关操作API。 系统管理 系统管理 系统设置、系统资源、用户管理、消息中心、标签等相关操作API。 镜像管理 标签页面管理 导入镜像、更新镜像、创建镜像、删除镜像等相关操作API。 数据管理
下游分析：靶点口袋分子设计对应的下游分析为分子优化、自由能微扰、合成路径规划和分子搜索，单击“确定”即可创建。 下载3D：如果分子设置了靶点，可以单击“下载3D”下载优化后的小分子或者复合物，如果分子未设置靶点，单击“下载3D”只能下载小分子。小分子下载支持SDF和PDB格式，复合物支持PDB格式。 每个分
输出小分子表征：是否输出小分子表征文件，小分子表征文件可以用作训练模型使用，默认是不输出。 作业名称：设置作业名称。长度为5~64个字符，仅可以使用字母、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格，首位只能以数字或字母开头。 标签：设置任务标签。 功能调用消耗：20000个小分子记一次功能调用。 引用外部桶时，
只有项目所有者和管理员能修改。 --tags -t 否 项目标签，多个标签使用分号(;)分隔。 只有项目所有者和管理员能修改。 --policy -p 否 设置项目级数据权限策略。只有项目所有者能修改。 用数字0和1表示关闭和打开，以data-share、data-download、data-de
用户目录的子文件夹.obsutil_output。 结果清单文件命名规则：abort_{succeed | failed}_report_时间_TaskId.txt。单个结果清单文件默认情况下最大为30MB且最大可保留的文件个数为1024，可在配置文件中通过recordMaxLo
API参考 2021年3月 序号 功能名称 功能描述 阶段 相关文档 1 医疗智能体EIHealth平台迭代更新 支持消息、邮件、安全、商标设置。 支持通过命令行工具对平台进行管理和使用，支持Windows、Linux系统。 开放API 优化 优化流程的搭建和运行过程。 商用 用户指南
使用绝对路径即可，如：health ls /abc/。 --limit -l 否 列举查询结果的最大个数，小于等于0表示列举所有结果，不设置时默认为最大值1000。 引用数据会列举全部，不受该参数影响 。 --simple -s 否 以精简格式显示查询结果，返回结果只包含对象名。
如果关闭，则该数据库只能自己使用。 如果开启组织共享，则其他子用户也可以使用您的数据库进行分子搜索。 默认为关闭。 数据库列表展示数据库的名称、分子数量、创建时间、状态等信息。对于已创建的数据库，可以执行删除和追加数据操作。数据库状态介绍如下： 可用：数据库正常，可以进行分子搜索使用。 等待中：数据库创建任务正在等待。
不能包含两个以上相邻的斜杠（/）。 文件夹名称不能以中划线（-）开头。 多层文件夹不能超过45层。 数据列表按照先文件夹后文件的顺序排列。文件夹默认为首字母排序，文件可按照时间顺序排序，但始终在文件夹后面显示。 上传数据 选择数据需要上传的文件夹，并单击“添加数据”或者直接单击“添加数据”。 在添加数据页面，上传待分析数据。
toolkit/health路径进行使用。 如果无法运行，提示Permission denied，使用chmod 755 health命令设置执行权限。 父主题： 获取并使用命令行工具eihealth-toolkit
toolkit/health路径进行使用。 如果无法运行，提示Permission denied，使用chmod 755 health命令设置执行权限。 父主题： 配置命令行工具
不能包含两个以上相邻的斜杠（/）。 文件夹名称不能以中划线（-）开头。 多层文件夹不能超过45层。 数据列表按照先文件夹后文件的顺序排列。文件夹默认为首字母排序，文件可按照时间顺序排序，但始终在文件夹后面显示。 上传数据 选择数据需要上传的文件夹，并单击“添加数据”或者直接单击“添加数据”。 在添加数据页面，选择“上传”，上传待分析数据。
concurrent: vars_iter # 是否并发，取值 vars_iter 时为开启并发状态，不设置则不开启 description: '' # 参数描述。取值范围：[0-255]
concurrent: vars_iter # 是否并发，取值 vars_iter 时为开启并发状态，不设置则不开启 description: '' # 参数描述。取值范围：[0-255]
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