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拷贝至“/share”目录。 make mpi 步骤3 配置lammps 算例输入文件。 以melt为例，生成一个算例melt.in文件。设置每迭代100步生成一个checkpoint文件，假定该文件存放在共享目录“/share”中。内容如下： # 3d Lennard-Jones
将1中下载的HPC-X压缩包上传至运行MPI的弹性云服务器内。 执行以下命令，解压HPC-X工具套件。 $ tar xvf hpcx-v2.0.0-gcc-MLNX_OFED_LINUX-4.2-1.2.0.0-redhat7.3-x86_64.tbz 执行以下命令，设置HPC-X环境变量。 $ cd
Platform MPI 操作场景 本节指导用户在ECS上安装和使用Platform MPI应用（以版本platform_mpi-09.01.04.03r-ce为例）。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装Platform MPI。 执行以下命令，安装需要的库文件。
/CAE、生物制药、基因测序、图像处理等，缩短需要的大量计算时间，提高计算精度。 方案架构 方案优势 降低TCO 可以按需租用，成本低，降低中小客户使用HPC的门槛。 提高效率 按需发放，快速部署与扩容，加速产品上市时间和缩短科研周期。 使用灵活 在镜像模板中预制MPI库、编译库及优化配置，加快环境部署。
安装和使用Intel MPI 操作场景 本节指导用户在BMS集群上安装和使用Intel MPI应用（以版本l_mpi_2018.0.128为例）。 对于集群中的每台BMS，都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装Intel MPI。 下载Intel
基于STAR-CCM+部署HPC集群 方案概述 资源和成本规划 STAR-CCM+部署HPC集群流程图 实施步骤 附录 父主题： 弹性云服务器场景最佳实践
在HPC集群上运行Spectrum MPI 在HPC集群上运行Intel MPI 在HPC集群上运行Platform MPI 父主题： 弹性云服务器场景典型应用
使用“PuTTY”，采用密钥对方式登录弹性云服务器。 登录用户为创建弹性云服务器时指定的用户名。 执行以下命令，防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令，验证参加测试的弹性云服务器之间是否可以免密码互相登录。 $ ssh 用户名@SERVER_IP 执行以下命令，关闭弹性云服务器的防火墙。 #
提供按需扩展的高性能文件存储。 华为 1 以华为云管理控制台显示为准。 6 虚拟私有云（VPC） 为云服务器等云上资源构建隔离、私密的虚拟网络环境。 华为 1 以华为云管理控制台显示为准。 7 云硬盘（EVS） 为ECS、BMS等计算服务提供持久性块存储的服务。 华为 >1 以华为云管理控制台显示为准。
3的OS为例在单节点上运行MPI应用。 裸金属服务器场景支持使用的MPI 安装和使用IB驱动自带的Open MPI 安装和使用社区OpenMPI 安装和使用Spectrum MPI 安装和使用Intel MPI 安装和使用Platform MPI 父主题： 裸金属服务器场景典型应用
实施步骤 创建HPC私有镜像 创建弹性云服务器 配置节点互信 创建SFS Turbo 挂载共享目录 通讯录安装 MPI安装 STAR-CCM+安装与运行 父主题： 基于STAR-CCM+部署HPC集群
附录 常见问题 主要概念 父主题： 基于STAR-CCM+部署HPC集群
第1个1表示备份文件系统，第2个1表示从/分区的顺序开始fsck磁盘检测，0表示不检测，_rnetdev 表示主机无法挂载直接跳过，避免无法挂载主机无法启动。 设置服务开机自启动 systemctl enable rpcbind systemctl enable nfs 父主题： 实施步骤
该任务指导用户在已配置好的弹性云服务器上，运行IB驱动自带的MPI应用（3.0.0rc6版本）。 前提条件 已成功创建带IB网卡的弹性云服务器，并绑定了弹性IP进行登录。 已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。 操作步骤 使用“PuTTY”，采用密钥对方式登录弹性云服务器。 登录用户为创建弹性云服务器时指定的用户名。
6的操作系统为例在集群上运行MPI应用。 安装和使用IB驱动自带的Open MPI 安装和使用社区OpenMPI 安装和使用MPICH 父主题： 裸金属服务器场景典型应用
Turbo 功能介绍 SFS Turbo提供按需扩展的高性能文件存储（NAS），可为云上多个弹性云服务器（Elastic Cloud Server，ECS），容器（CCE&CCI），裸金属服务器（BMS）提供共享访问，能够弹性伸缩至320TB规模，具备高可用性和持久性，为海量的小文件、低延迟高IOPS型应用提供有力支持。
延迟会显著减小。 内核旁路：内核协议栈旁路技术使应用程序无需执行内核内存调用就可向网卡发送命令。在不需要任何内核内存参与的条件下，RDMA请求从用户空间发送到本地网卡并通过网络发送给远程网卡，这就减少了在处理网络传输流时内核内存空间与用户空间之间环境切换的次数。 没有CPU参与：
创建HPC私有镜像 前提条件 创建镜像需选择ECS系统盘镜像。 需修改镜像属性才能在ECS创建界面的C6h规格中选择到相应的镜像。 镜像获取 请联系技术支持进行操作。 创建系统盘镜像 请使用镜像文件创建系统盘镜像，需注意镜像用途选择ECS系统盘镜像如图1，选择启动方式为UEFI图2，否则系统无法启动。
主要概念 RDMA RoCE 父主题： 附录
MPI安装 Platform MPI安装 PlatformMPI使用STAR-CCM+自带的，不需要安装。 OpenMPI安装（可选） 若使用STAR-CCM+自带的，可不用安装。 cd /root tar zxvf openmpi-4.0.1.tar.gz cd openmpi-4
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