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容,如果蛋白力场选择了gromacs力场,则不支持上传配体。 图1 设置靶点优化配置页面 单击“下一步”,配置靶点优化配置参数。 MD引擎:仅支持GROMACS。 时间步长:MD模拟的时间步长,范围支持0<时间步长≤5fs,默认是2fs。 温度:MD模拟的温度,范围支持0<温度≤1000K,默认是300K。
平衡状态。预平衡模拟时长=预平衡步数×时间步长。时长增加,作业运行时间延长。 平衡时长:默认值:1ns,取值范围:0-10ns。平衡阶段的模拟,用于自由能微扰计算。平衡模拟时长=时间步长×平衡步数/1000,单位为ns。时长增加,作业运行时间延长。 λ个数:默认值20,输入范围为2-30。自由能微扰的窗口数量。
发布镜像的版本。 版本长度必须为1-64个字符,只支持字母,数字,中划线,下划线和点号。 类型 镜像。 标签 设置发布镜像的标签。 最多支持设置5个标签。 短描述 为发布的镜像设置的简要描述。 图片 展示在资产市场的图片。要求如下: 格式:svg,png,jpg,jpeg 尺寸:16 *
labelA - labelB timeout: 1440 # 流程超时时间,取值范围[1,144000],单位分钟,默认1440 output_dir:
话单延迟导致欠费 当前华为云账单都会有一定的延迟计费,延迟时间在1小时左右,故需要提前预留1小时以上的费用来删除平台,以防欠费。 若您是利用优惠券购买平台,则需注意,欠费则不能用优惠券补充。 父主题: 计费
划线、中划线。 核心项目 如果设置该项目为核心项目,不支持立即删除,会进入待删除项目列表。删除项目需要等待7天保留期,到期后系统自动删除。 说明: 一旦设置为核心项目,不可变为非核心项目,非核心项目支持变为核心项目。 标签 设置项目标签。 描述 设置项目描述。 数据保护策略 数据保护策略介绍请参见数据控制与数据审计。
Notebook的简要描述。 镜像类型 选择自定义镜像。 工作环境 选择已上传的自定义镜像。 CPU 设置CPU大小。 GPU 设置GPU大小。 内存 设置内存大小。 存储路径 单击“存储路径”右侧文件夹图标,设置用于存储Notebook数据的OBS路径。如果想直接使用已有的文件或数据,可将数据提前上传至对应的OBS路径下。
购买时长 购买套餐包的时长。最短为一个月,最长为一年。 生效时间 选择购买套餐包后的生效时间。目前支持支付完成后立即生效和指定生效时间两种方式。 如果支付时间晚于指定生效时间,资源包将在支付后立即生效。 图2 购买套餐包 设置完成后,单击“立即购买”,然后单击“确认”。 在云服务订单页面,单击“确认付款”。
创建项目 使用create或submit命令创建项目,并可设置项目级数据权限策略。 命令结构 health create project <project-name> [flags] 或 health submit project <project-name> [flags] 表1
--timeRange -T 否 上传文件时的时间段匹配模式,仅上传最后修改时间在该时间段内的文件。该匹配模式优先级低于文件名匹配模式:exclude和include,优先执行文件名匹配模式后才会执行该匹配模式。 使用“time1-time2”,代表匹配的时间段,其中time1必须小于等于ti
--timeRange -T 否 复制对象时的时间段匹配模式,仅复制最后修改时间在该时间段内的对象。该匹配模式优先级低于对象名匹配模式:exclude和include,优先执行对象名匹配模式后才会执行该匹配模式。 使用“time1-time2”,代表匹配的时间段,其中time1必须小于等于ti
下载数据 禁止/允许删除数据 您可以对某个数据设置禁止删除。设置禁止删除后,该目录只能添加数据,不支持删除数据。也可以通过“允许删除”取消禁止删除设置。 图7 开启禁止删除数据 支持设置最多15个数据的禁止删除状态。 如果平台或者父目录设置禁止删除状态,则对应的数据根路径或者子路径均
labelA - labelB timeout: 1440 # 流程超时时间,取值范围[1,144000],单位分钟,默认1440 output_dir:
图1 AI模型 单击“创建模型”,设置相关参数信息。 表1 参数说明 参数 说明 名称 模型名称。 长度为5-32个字符,首位需以英文字母开头,仅可以使用字母、数字、下划线“_”和中划线“-”和空格。 描述 设置模型的描述信息。 基模型 设置基模型,基模型与分子描述符有关。选择不同的基模型,分子描述符不一样。
最大搜索深度:深度增加,每一个路径可进行搜索的深度限制增加,作业运行时间可能延长;深度减少,部分路径可能在还未搜索完成时被终止。默认值5,取值范围3-12。 最大搜索时间:合成路径规划的搜索时间限制,到达限制时间会返回已经搜索完成的路径。搜索时间增加,作业运行时间延长;搜索时间减少,可能会有部分合理路径未能开始搜
同步上传文件时的时间段匹配模式,仅上传最后修改时间在该时间段内的文件。该匹配模式优先级低于文件名匹配模式:exclude和include,优先执行文件名匹配模式后才会执行该匹配模式。该匹配模式表示的时间是UTC时间。 使用“time1-time2”,代表匹配的时间段,其中time
- labelA - labelB timeout: 1440 # 可选 # 流程超时时间,取值范围[1,144000],单位分钟,默认1440 output_dir: # 可选
fastp-file2。 图8 设置fastp输入数据 将GRCh38目录指定成bwa-mem与picard-insertsize的输入。 图9 设置bwa-mem输入数据 图10 设置picard-insertsize输入数据 若是想查看已经设置好的参数,可以按照下图步骤进行查
骨架搜索是通过设置分子骨架搜索具有相同骨架的分子。 选择数据库:最多可选择10个数据库。 选择属性模型:选择AI模型。如果需要创建模型,可参考AI模型。此参数只有专业版支持。一次最多可以选10个模型属性。 输出个数:输出个数越多,任务时间越长。 作业名称:设置作业名称。长度为5
--update -u 否 增量移动操作,设置该参数后,移动每个源对象时会对比目标桶中对应路径的目标对象,仅在目标对象不存在,或者目标对象大小与源对象大小不一致,或者目标对象的最后修改时间早于源对象的最后修改时间时进行移动。 如果目标对象与源对象大小以及修改时间都一致,此时会直接删除源对象,而不进行移动操作。