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表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 job-id 不涉及 是 作业id 命令示例 health nextflow stop job f17a3542-3f7c-11eb-868a-fa163e3ddba1 stop job 3650d348-440e-4ee7-b043-a44481dc6211
作业ID -- params -p 否 本地json/yaml格式参数文件路径 命令示例 health nextflow retry job f17a3542-3f7c-11eb-868a-fa163e3ddba1 retry job 3650d348-440e-4ee7-b043-a44481dc6211
本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 health cancel job f17a3542-3f7c-11eb-868a-fa163e3ddba1 -f # 返回结果如下 cancel job successfully
本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 health retry job f17a3542-3f7c-11eb-868a-fa163e3ddba1 # 返回结果如下 retry job successfully! 父主题:
t的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 使用job-id导出作业 health export job -i f17a3542-3f7c... # 返回结果如下 export job successfully! 使用job-id文件导出作业 health
[ "0000000000/" ], "create_time": "2021-06-17T07:57:35Z", "end_time": "2021-06-17T11:46:37Z", "status": "RUNNING", "destinations":
"2022-12-15 00:40:11" --create-to-time "2022-12-17 00:40:11" --finish-from-time "2022-12-14 17:05:09" --finish-to-time "2022-12-19 23:04:07" --labels
分子属性预测 基于盘古药物分子大模型,预测化合物ADMET相关的80多种成药属性,有些属性的预测值会给出置信区间,更好地辅助分子设计。 单击“分子属性预测”功能卡片,进入配置页面。 图1 小分子配置页面 在配置页面输入分子信息,及配置相关参数。 输入方式:支持绘制分子、选择文件、手动输入。
以删除资源。 在已购买资源的“操作”列,单击“删除”。 图16 删除资源 查找资源 普通搜索:在搜索框中输入关键字,单击按钮查找资源。 图17 查找资源 高级搜索:计算资源支持按照名称、运行状态、计费模式、规格名称、标签进行搜索。 输入某一项搜索条件后,单击“搜索”即可查找出相关信息。
最多可添加2个靶点。 如果不需要设置靶点,此步骤可以进行省略,如果设置了靶点,作业运行时间会加长。 通过“靶点设置”上传靶点,并且设置对接口袋。 此处靶点设置为可选参数,如果选择靶点设置,可以将对接活性作为一个约束条件进行分子生成。靶点1对应的约束条件是target1_bind
时间会加长。 图3 靶点设置 图4 Target1设置 图5 Target2设置 图6 靶点设置完成 通过“靶点设置”上传靶点,并且设置对接口袋。 此处靶点设置为可选参数,如果选择靶点设置,可以将对接活性作为一个约束条件进行分子优化。靶点1对应的约束条件是target1_bind
mp, cost [356], status [200], request id [00000181DB8D6A334012AD144AA17E01] 父主题: 数据管理命令
设置靶点口袋发现文件 查看靶点口袋发现结果。 单击作业名称,在输出结果页面,可以单击“查看轨迹”,下载运动轨迹。可以单击”下游分析”,将发现的口袋作为对接口袋进行分子对接。也可以在右边口袋列表中查看口袋信息。 单击口袋列表的,可以收藏靶点口袋发现结果,收藏后可在收藏夹页进行查看。 图2 查看靶点口袋发现结果
在本地编写模板,模板中的参数与在EIHealth平台创建作业过程一致。 修改yaml模板时,详细的命令和参数请参见作业配置文件说明。 # 详情说明可参考API文档中作业管理-创建作业 job: name: demo-job