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Dockerfile命令，进入Dockerfile文件中，编写文件。 FROM ubuntu:16.04 # FastQC依赖java运行，需安装java环境。安装执行下载、解压缩的软件包 RUN apt-get update && apt-get upgrade -y \
Dockerfile命令，进入Dockerfile文件中，编写文件。 FROM ubuntu:16.04 # FastQC依赖java运行，需安装java环境。安装执行下载、解压缩的软件包 RUN apt-get update && apt-get upgrade -y \
-bam ${bam-file} -outdir ${out-dir} -nt 8 --java-mem-size=80G 镜像：picard-insertsize:2.23.3 启动命令： java -jar /usr/picard/picard.jar CollectInsertSizeMetrics
输出参数 insertsize-txt file 输出的insert size分布的文本文件。 insertsize-pdf file 输出的insert size分布的pdf文件。 参数填写无误后，单击界面上方“启动作业”，运行作业。 步骤4：查看执行结果 在“项目管理”页面选择“作业
输出参数 insertsize-txt file 输出的insert size分布的文本文件。 insertsize-pdf file 输出的insert size分布的pdf文件。 gatk-markduplicates 输入参数 bam-file file 输入比对之后经过sort的bam文件。
以下类型镜像，建议您通过Docker Hub获取，不建议自己制作。 基础操作系统类镜像，如Ubuntu、Suse、Centos等。 基础编程语言类镜像，如Java、Python、R语言等。 基础通用类软件镜像，如Tomcat、Mysql、Ngnix等。 获取创建Notebook的镜像 创建Note
#设置root用户为后续命令的执行者 USER root #执行操作 RUN yum update -y RUN yum install -y java #使用&&拼接命令 RUN touch test.txt && echo "abc" >>abc.txt #对外暴露端口 EXPOSE
scheduled，请根据日志信息扩容计算资源。 execution log提示can't lock file，重试或者克隆作业即可。 execution log提示java.text.ParseException: Unparseable date，请提交工单或联系服务技术支持。 execution log
#设置root用户为后续命令的执行者 USER root #执行操作 RUN yum update -y RUN yum install -y java #使用&&拼接命令 RUN touch test.txt && echo "abc" >>abc.txt #对外暴露端口 EXPOSE
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