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在HPC集群上运行MPI应用 在HPC集群上运行IB驱动自带的OpenMPI 在HPC集群上运行社区OpenMPI 在HPC集群上运行Spectrum MPI 在HPC集群上运行Intel MPI 在HPC集群上运行Platform MPI 父主题： 弹性云服务器场景典型应用
方案概述 方案应用 HPC提供了超高浮点计算能力解决方案，可用于解决计算密集型、海量数据处理等业务的计算需求，如科学研究、气象预报、计算模拟、军事研究、CAD/CAE、生物制药、基因测序、图像处理等，缩短需要的大量计算时间，提高计算精度。 方案架构 方案优势 降低TCO 可以按需
Platform MPI 操作场景 本节指导用户在ECS上安装和使用Platform MPI应用（以版本platform_mpi-09.01.04.03r-ce为例）。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装Platform MPI。 执行以下命令，安装需要的库文件。
配置BMS集群互相免密登录 操作场景 该任务指导用户在BMS集群上进行相关设置，并使其可以相互免密登录。 背景信息 $：表示在普通用户下，执行相关操作。 #：表示在管理员用户下，执行相关操作。 普通用户切换至管理员用户，请使用命令sudo su。 前提条件 已成功创建BMS，并绑定了弹性IP进行登录。
HPC断点续算计算方案 操作场景 在HPC领域很多应用本身是支持断点续算功能的，例如LAMMPS， GROMACS。同时HPC常用的调度软件也对断点续算有集成支持，如PBS、Slurm与LSF等。 本节以LAMMPS为例，介绍如何在HPC进行断点续算。 步骤1 安装FFTW 依次执行以下命令，安装FFTW软件。
附录 常见问题 主要概念 父主题： 基于STAR-CCM+部署HPC集群
MPI安装 Platform MPI安装 PlatformMPI使用STAR-CCM+自带的，不需要安装。 OpenMPI安装（可选） 若使用STAR-CCM+自带的，可不用安装。 cd /root tar zxvf openmpi-4.0.1.tar.gz cd openmpi-4
在HPC集群上运行MPI应用（鲲鹏BMS场景） 该任务指导以CentOS 7.6的操作系统为例在集群上运行MPI应用。 安装和使用IB驱动自带的Open MPI 安装和使用社区OpenMPI 安装和使用MPICH 父主题： 裸金属服务器场景典型应用
实施步骤 创建HPC私有镜像 创建弹性云服务器 配置节点互信 创建SFS Turbo 挂载共享目录 通讯录安装 MPI安装 STAR-CCM+安装与运行 父主题： 基于STAR-CCM+部署HPC集群
安装和使用MPI（X86 BMS场景） 该任务指导以CentOS7.3的OS为例在单节点上运行MPI应用。 裸金属服务器场景支持使用的MPI 安装和使用IB驱动自带的Open MPI 安装和使用社区OpenMPI 安装和使用Spectrum MPI 安装和使用Intel MPI 安装和使用Platform
RoCE RoCE概念 RDMA over Converged Ethernet (RoCE)是一种网络协议，允许应用通过以太网实现远程内存访问。目前RoCE有两个协议版本，v1和v2。其中RoCE v1是一种链路层协议，允许在同一个广播域下的任意两台主机直接访问。而RoCE v
挂载共享目录 安装软件 yum install nfs-utils 挂载SFS Turbo 将SFS Turbo挂载到/opt/Siemens目录 mkdir /opt/Siemens # 在/etc/fstab中添加开启自动挂载 echo "192.168.0.15:/ /opt/Siemens
主要概念 RDMA RoCE 父主题： 附录
IB驱动自带的OpenMPI 操作场景 本节指导用户安装和使用IB驱动自带的OpenMPI（以版本3.0.0rc6为例）。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 检查是否已安装IB驱动。 使用“PuTTY”，采用密钥对方式登录弹性云服务器。 执行以下命令，切换为root
资源和成本规划 所需资源如表1所示，具体资源的实际费用请以对应官网价格显示为准。 表1 资源和成本规划 序号 资源 资源说明 获取路径 数量 费用 1 STAR-CCM+ 使用STAR-CCM+15.02版本。 建议从官方网站获取 1 以官网显示价格为准。 2 MPI（可选） Plateform
常见问题 RoCE网络问题 STAR-CCM+启动相关问题 父主题： 附录
RoCE网络问题 dtest或rping打流测试网络双向不通问题 问题现象： dtest/rping打流测试网络双向不通问题：A机器作为Server端，B机器作为Client端，dtest/rping测试RoCE网络异常；调换A、B机器角色，B机器作为Server端，A机器作为C
创建HPC私有镜像 前提条件 创建镜像需选择ECS系统盘镜像。 需修改镜像属性才能在ECS创建界面的C6h规格中选择到相应的镜像。 镜像获取 请联系技术支持进行操作。 创建系统盘镜像 请使用镜像文件创建系统盘镜像，需注意镜像用途选择ECS系统盘镜像如图1，选择启动方式为UEFI图2，否则系统无法启动。
创建SFS Turbo 功能介绍 SFS Turbo提供按需扩展的高性能文件存储（NAS），可为云上多个弹性云服务器（Elastic Cloud Server，ECS），容器（CCE&CCI），裸金属服务器（BMS）提供共享访问，能够弹性伸缩至320TB规模，具备高可用性和持久性
安装和使用Spectrum MPI 操作场景 本节指导用户在BMS集群上安装和使用Spectrum MPI应用（以版本10.01.01为例）。 对于集群中的每台BMS，都需要执行该操作。 背景信息 IBM Spectrum MPI v10.1版本当前支持的操作系统列表如下： IBM
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