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单击“确定”，保存作业信息。 配置输入和依赖数据 NGS流程中涉及的输入、输出和依赖数据如表1所示。配置数据前，请先参考上传数据，上传原始Fastq文件和依赖数据。 如果在创建应用时打开了“并发”开关，可以设置多个参数值，批量执行作业。 数据上传完成后，在流程设计器页面，分别单击应
输入分子 单击“下一步”，进入靶点设置，此步骤为可选步骤，如果需要设置靶点，并且将对接结合能作为一个约束条件进行优化，需要进行配置。最多可添加2个靶点。在添加靶点后，会进行单分子预对接，可查看Top1的对接打分与构象。 如果不需要设置靶点，此步骤可以进行省略，如果设置了靶点，作业运行时间会加长。
如下所示。 https://iam.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v3/auth/tokens 为查看方便，服务每个具体API的URI，只给出resource-path部分，并将请求方法写在一起。这是因为URI-scheme都是HTTPS，而Endpo
cn-north-4.myhuaweicloud.cn HTTPS 华东-上海一 cn-east-3 eihealth.cn-east-3.myhuaweicloud.com eihealth.cn-east-3.myhuaweicloud.cn HTTPS 华南-广州 cn-south-1 eihealth
ws-x86_64.zip.sha256。 安装eihealth-toolkit 本示例中以Windows系统为例，介绍安装命令行工具的方法。 获取Windows版本的命令行工具，得到health.exe文件，health文件无需安装，放置在任一文件夹中即可。 图1 下载命令行工具
平台项目中数据、应用、流程和作业资源进行管理和使用。 eihealth-toolkit具备灵活性高、扩展性强： 单一可执行文件，方便拷贝与安装。 支持多操作系统，包括Windows、Linux（支持CentOS 7及以上版本和openEuler 20.03 LTS - openEuler
和作业，不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用 最小长度：0 最大长度：24 gpu_type 否 String gpu架构类型，取值范围 ' '|GPU|Snt9|D310。对于流程和作业，不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用
priority Integer 作业的优先级 timeout Integer 作业执行超时时长 output_dir String 压扁后的效果，即job运行的实际配置 status String 作业运行状态 create_time String 作业创建时间 finish_time String
对测序得到的fastq数据进行质控。 trimmomatic 使用trimmomatic工具去掉测序接头，得到去接头后fastq格式的reads。 star 使用STAR比对工具将去接头后的reads比对到参考基因组，得到bam文件和多种格式的统计报告。 使用RNA-Seq流程的详细步骤如下所示：
名称。同时，若想比较好的方式管理输出文件，也可以自行指定输出路径。 图6 新建作业 在作业页面添加好运行参数，添加方式与方式1相同。 配置好参数后，单击右上角“启动作业”按钮启动作业，同时会跳转回作业列表。 图7 作业列表 步骤4：查看作业运行状态、获取作业结果 查看方法与方式1相同。
下载类型(仅支持PRIVATE|PUBLIC) 枚举值： PRIVATE PUBLIC EXTRANET url 否 String 资源地址(支持https、obs地址) 最小长度：1 最大长度：2000 range_start 否 Long 指定下载对象的开始位置 最小值：0 最大值：9223372036854775807
计算节点标签：作业会调度到含有相应标签的计算节点上。 当应用也配置了标签，如果应用和作业的计算节点标签在同一计算节点上，则应用调度至该计算节点上；应用和它的作业，不管节点标签是否一致，都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。 如果设置了不存在的计算节点标签，作业会进入等待，直至配置了相应的标签。 超时时间：作
响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 数据作业ID 请求示例 导入网上数据，数据链接为https://www.hhh.com/test.txt，目的目录为test。 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{pro
ligand 否 TargetOptLigand object 配体文件。 md_params 否 MdParam object MD参数配置。 表4 CreateDrugJobBasicInfo 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 作业的名称，取值范围：[5
枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 format 否 String 文件格式
获取作业结果 作业运行成功后，可以看到每个应用的运行信息：输入输出，节点参数，应用以及日志等信息，最多可以显示5000条日志。 单击具体的输出参数可跳转到具体的文件位置。 图2 获取作业结果 同时，项目支持导出作业的元数据信息，包括以下内容。 作业的基本配置信息，以yaml文件导出
入数据 若是想查看已经设置好的参数，可以按照下图步骤进行查看，同时若发现指定的参数有问题，也可再此处进行删除参数。 图11 删除参数 配置好参数后变可以单击右上角“启动作业”按钮进行启动作业，同时会跳转回作业列表。 图12 作业列表 步骤4：查看作业运行状态、获取作业结果 在作业
资产封面图访问链接 create_time String 创建时间 update_time String 更新时间 请求示例 查询资产详情 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/assets/{asset_id}
"url" : "https://files.rcsb.org/download/1TQN.pdb" } }, "ligand" : { "source" : "EXTRANET", "url" : "https://files.rcsb.org/download/1TQN
枚举值： EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url 否 String 文件URL，当数据源为外部网络数据时为https地址；用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 format 否 String 文件格式
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