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步骤4：创建并使用Notebook 步骤1：安装容器引擎 在制作自定义镜像时，您需要准备一台安装有Docker的机器。请使用自己的电脑搭建Docker环境，或者使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。 例如，在Linux操作系统下，可以使用如下命令快速安装容器引擎。 curl -fsSL get
下所示： 步骤1：搭建Docker环境 步骤2：制作镜像 步骤3：上传镜像 步骤4：创建应用 步骤1：搭建Docker环境 搭建Docker环境，您可以任选以下两种方式搭建Docker环境。 使用自己的电脑搭建Docker环境。 使用华为云弹性云服务器ECS搭建Docker环境。
自由能微扰 自由能微扰基于纯国产分子动力学模拟库SPONGE，产生自动化FEP工作流，端到端计算配体修饰造成的亲和能改变。 单击“自由能微扰”功能卡片，进入上传文件页面。 在上传页面右侧，选择上传受体，上传配体，选择中心配体。 上传受体：受体仅支持PDB格式的文件。 上传配体：配
镜像 如何搭建Docker环境 如何将生物信息学软件封装为镜像并上传
运行作业 方式1：使用预置的NGS流程 方式2：使用预置应用搭建NGS流程 方式3：自定义镜像运行FastQC流程
基于二代测序的基因组突变检测 NGS流程简介 配置命令行工具 上传数据 制作并上传镜像 创建应用 搭建NGS流程 执行分析作业 批量执行NGS分析
画布 中间区域为搭建流程的操作界面。 可以将应用拖拽至画布中，并进行编排创建。 可以将流程放置到画布中进行编排修改。 可通过“概览”展示流程的结构图。 可通过界面右下角快速定位按钮使流程显示在画布中央。 可通过界面右下角规整排列按钮使流程连线排布整齐。 父主题： 工具管理
of NodeLabelRsp objects 数据对象列表 表4 NodeLabelRsp 参数 参数类型 描述 name String 标签名称 请求示例 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/system/nodes/labels
命令行工具概述 镜像、应用、流程、作业 1. 制作镜像 2. 创建应用 3. 搭建流程 4. 执行分析作业 常见问题 了解更多常见问题、案例和解决方案 热门案例 AK/SK是什么？如何获取AK/SK 如何搭建Docker环境？ 如何制作镜像？ 如何将生物信息学软件封装为镜像？ 更多 远程登录
标签列表 数组长度：0 - 100 表4 UpdateNodeLabelReq 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 标签名称 最小长度：1 最大长度：63 响应参数 无 请求示例 批量设置计算资源标签，设置标签为health.labelA https://eihealth
入门实践 表1 常用最佳实践 实践 描述 基于二代测序的基因组突变检测 本最佳实践提供了通过命令行工具上传数据、上传镜像后，在医疗智能体平台搭建NGS流程，执行分析作业及批量执行NGS分析。 新型冠状病毒（COVID-19）虚拟药物筛选 本最佳实践介绍如何使用EIhealth平台虚
health create label [name] [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 name 不涉及 是 标签名。 description -d 否 标签描述。 命令示例 health create label name -d xxx {
镜像管理简介 运行生物信息学软件，往往由于不同的操作系统（Windows、Linux、Mac等）原因，无法实现统一的运维管理。同时，这些软件具有不同的版本和软件包，安装、使用过程复杂。将生物信息学软件封装成Docker镜像，可以使程序在不同的环境中运行，并通过EIHealth平台
ecaller、gatk-mergevcfs和discvrseq-variantqc应用构成。在创建应用前，请先制作并上传应用所需的镜像。搭建NGS流程所需的镜像和版本如表1所示。 表1 NGS流程镜像信息 NGS流程步骤 描述 依赖镜像及版本 镜像下载命令 Read Quality
PresetLabelRsp objects 预置标签 表4 PresetLabelRsp 参数 参数类型 描述 name String 标签名称 请求示例 获取预置标签列表 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{pro
初学者能够基于页面可视化的完成数据管理、复现业内的分析流程和算法。资深从业者能够基于镜像打造自己的分析流程。 使用流程 EIHealth提供了个性化分析流程的搭建和管理操作。您可以将生物信息学软件封装为应用，并将其编排调度，形成自定义分析流程。 同时集成了基于开源的Jupyter Notebook，
为Token。 最小长度：1 最大长度：32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 name 是 String 标签名称 最小长度：1 最大长度：32 description 否 String 标签描述 最小长度：0 最大长度：1024 响应参数 状态码：
of NodeLabelRsp objects 数据对象列表 表4 NodeLabelRsp 参数 参数类型 描述 name String 标签名称 请求示例 获取计算资源标签集 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{pr
、8。 GPU需求：请按实际需求填写，只能输入0到16的正整数。 计算节点标签：请选择标签名称，不支持多选。应用将会调度到有相应节点标签的计算节点。计算节点标签设置方法请参见计算资源标签管理。 填写输入参数、输出参数。 参数填写时，输入参数及输出参数有字符串（String），文件
LabelRsp objects 标签详情 表4 LabelRsp 参数 参数类型 描述 id String 标签id name String 标签名称 description String 标签描述 creator String 标签创建者 create_time String 标签创建时间
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