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01.04.03r-ce为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装Platform MPI。 执行以下命令,安装需要的库文件。 # yum install glibc.i686 libgcc-4.8.5-11.el7.i686 增加执行权限,例如安装包所在路径为/root。
创建镜像需选择ECS系统盘镜像。 需修改镜像属性才能在ECS创建界面的C6h规格中选择到相应的镜像。 镜像获取 请联系技术支持进行操作。 创建系统盘镜像 请使用镜像文件创建系统盘镜像,需注意镜像用途选择ECS系统盘镜像如图1,选择启动方式为UEFI图2,否则系统无法启动。 图1 创建系统盘镜像 图2 选择启动方式
主机名。 $ ssh localhost $ ssh hostname1 依次登录集群中其他ECS,重复执行步骤1~4。 执行以下命令,验证参加测试的ECS之间是否可以免密码互相登录。 假设集群中有2个弹性云服务器,另一个云服务器的主机名为hostname2,则命令行为: $ ssh
修改Makefile文件01 图2 修改Makefile文件02 执行以下命令,编译lammps,并将当前目录生成的lmp_mpi文件拷贝至“/share”目录。 make mpi 步骤3 配置lammps 算例输入文件。 以melt为例,生成一个算例melt.in文件。设置每迭代10
为确保集群能正常创建/部署,需保证安全组规则22端口开放,具体配置方法请参见:为安全组添加安全组规则。 一站式HPC服务使用弹性文件服务SFS作为文件共享存储,更多关于弹性文件系统的信息,请参见《弹性文件服务用户指南》。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击管理控制台左上角的,选择区域和项目。 单击“部署HPC集群”。
为确保集群能正常创建/部署,需保证安全组规则22端口开放。具体配置方法请参见:为安全组添加安全组规则 一站式HPC服务使用弹性文件服务SFS作为文件共享存储,更多关于弹性文件系统的信息,请参见《弹性文件服务用户指南》。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击管理控制台左上角的,选择区域和项目。 单击“购买HPC集群”。
有镜像。 创建私有镜像 云硬盘(EVS) 购买云硬盘并挂载至HPC场景的云服务器。 购买云硬盘 弹性文件服务(SFS) 为用户的弹性云服务器提供一个完全托管的共享文件存储。 文件共享 父主题: 产品介绍
启动、停止、重启、删除等管理功能。 共享存储 HPC-S²的管理控制台提供了HPC-S²集群所对应的存储信息,通过弹性文件服务(SFS)为集群中所有节点提供文件共享路径。 任务管理 HPC-S²的管理控制台提供了HPC-S²集群相关的任务队列、动态调度、亲和性调度、负载重组及基于
MPI运行可执行文件。 假设hello.c文件在“/home/rhel/”目录下,生成的可执行文件名为hello,执行以下命令: $ cd /home/rhel/ $ mpicc hello.c -o hello 执行以下命令,在单个BMS上通过Spectrum MPI运行可执行文件。 $
MPI_Finalize(); } $ mpicc hello.c -o hello 不同版本的MPI运行的hello文件是不同的,都需要使用命令mpicc hello.c -o hello对hello.c文件重新编译。 执行以下命令,在单个BMS上运行社区OpenMPI。 $ mpirun -np 2
} $ mpicc hello.c -o hello 不同版本的MPI运行的hello文件是不同的,都需要使用命令mpicc hello.c -o hello对hello.c文件重新编译。 执行以下命令,在单个BMS上运行社区OpenMPI。 $ mpirun -np 2
# which mpirun 图3 查看环境变量 执行以下命令,在单个弹性云服务器上通过Spectrum MPI运行可执行文件。 执行以下命令,编辑文件。 # cd # vi hello.c 编辑内容如下: #include<mpi.h> #include<stdio.h> int
对象存储服务(OBS) 是一种基于对象的海量存储服务,为用户提供海量、低成本、高可靠、高安全的数据存储能力。 弹性文件服务(SFS) 为用户的弹性云服务器提供一个完全托管的共享文件存储,符合标准文件协议( NFS ),能够弹性伸缩至PB规模,具备可扩展的性能,为海量数据、高带宽型应用提供有力支持。
/platform_mpi-09.01.04.03r-ce.bin 根据系统提示安装Platform MPI,默认安装到“/opt/ibm/platform_mpi”文件夹下。 图1 Platform MPI成功安装 配置环境变量。 执行以下命令,获取pkey。 # cat /sys/class/infin
009_01_linux-x86_64-2.12_gnu7.1-r8.sh # 从STAR-CCM+官网买的正版软件中获取license,将license.dat文件放到/opt/Siemens 中 echo “export CDLMD_LICENSE_FILE=/opt/Siemens/license
执行mount -a 备注: 192.168.0.15:/ 是从sfs turbo console中获取到的挂载的路径。 第1个1表示备份文件系统,第2个1表示从/分区的顺序开始fsck磁盘检测,0表示不检测,_rnetdev 表示主机无法挂载直接跳过,避免无法挂载主机无法启动。
环境变量导入成功 回显结果如图2所示,表示环境变量导入成功。 执行以下命令,在单个ECS上运行Intel MPI。 执行以下命令,重新生成可执行文件。 # cd # mpicc hello.c -o intel_hello 执行以下命令,在单个ECS上运行Intel MPI。 # mpirun
MPICH环境变量导入成功 回显结果如图2所示,表示环境变量导入成功。 执行以下命令,在单个BMS上运行MPICH。 执行以下命令,生成可执行文件。 $ mpicc hello.c -o hello 执行以下命令,在单个BMS上运行MPICH。 $ mpirun -np 2 /home/rhel/hello
MPI环境变量导入成功 回显结果如图2所示,表示环境变量导入成功。 执行以下命令,在单个BMS上运行Intel MPI。 执行以下命令,生成可执行文件。 $ mpicc hello.c -o hello 执行以下命令,在单个BMS上运行Intel MPI。 $ mpirun -np 2 /home/rhel/hello
3-1.0.1.0-rhel7.3-x86_64 # ./mlnxofedinstall 配置环境变量。 使用vim编辑“~/.bashrc”文件,添加如下配置内容: export PATH=$PATH:/usr/mpi/gcc/openmpi-3.1.0rc2/bin export