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即可完成绑定(可选项)。您也可以单击操作列的“解除绑定”来解除当前的绑定。 图1 绑定CSS资源入口 图2 绑定CSS资源 父主题: 系统设置
delete compute node:1f6d8d7a-0709-44ec-b464-7c5c00eb9740 success 父主题: 系统设置命令
用户组B里有50个用,两者之间有10个用户重复,那么同时选择用户组A和B,统计时显示已选择90个用户。 如果导入后用户状态显示异常,需联系技术支持处理。 单击“下一步”,设置角色。设置是否为“系统管理员”。 配置完成后,单击“确定”。 等待导入成功后,单击“关闭”。可以在用户管理页面查看导入成功的用户信息。 导入的用
同,可参考。 设置供应商名称 health edit vendor-config --name xxx1 --log /root/demo/logo.png # 执行成功返回结果如下 set vendor name to xxx1 successfully! 设置供应商图标 health
选择“作业>分析作业>Nextflow”,单击“新建作业”。 设置作业参数。 作业名称:设置作业名称。名称长度为1-63,只允许出现中划线、字母和数字。 标签:设置作业标签。最多可以设置5个。 描述:作业描述。 流程名称:选择已创建的流程,如果还未创建,可参考新建流程进行创建。 优先级:设置作业优先级。在资源充足的情
单击输入参数图标,设置输入数据。 单击应用图标,弹出编辑图标,单击按钮,设置应用参数。 参数确认无误后,单击界面上方“启动作业”按钮,可以直接基于该流程创建分析作业。 通过“工具”页面创建 在“工具”页面,流程列表中,单击“操作”列“启动作业”。在弹出的作业设置页面,填写作业信息
# 执行成功返回结果如下 set the retention of completed-jobs successfully! 父主题: 系统设置命令
xxx SUCCEED lmx-test-01 2021-02-01 11:11:27 父主题: 系统设置命令
创建子用户 使用管理员账户登录盘古辅助制药平台。 在右上角用户名中选择“用户管理”。 在用户管理页面,单击左上角“创建用户”,进入“创建用户”页面。 填写用户信息,分配子用户权限。 创建完成后,单击“确认”。 父主题: 用户管理
用户权限介绍 表1 用户权限说明 用户类别 权限 最终租户 创建用户、导入用户、删除用户、编辑角色、邮箱和手机号、重置密码、移除用户。 系统管理员 创建用户、导入用户、删除用户、编辑角色、移除用户。 非系统管理员 无相关编辑权限。 父主题: 用户管理
Integer 作业启动事件发生次数 first_timestamp String 作业启动事件首次上报时间 last_timestamp String 作业启动事件末次上报时间 message String 作业启动事件详细信息 reason String 作业启动事件状态 type
描述 type String 任务启动事件类型 count Integer 任务启动事件发生次数 reason String 任务启动事件状态 message String 任务启动事件详细信息 first_timestamp String 任务启动事件首次上报时间 last_timestamp
Failed 未满足前提条件,服务器未满足请求者在请求中设置的其中一个前提条件。 413 Request Entity Too Large 由于请求的实体过大,服务器无法处理,因此拒绝请求。为防止客户端的连续请求,服务器可能会关闭连接。如果只是服务器暂时无法处理,则会包含一个Retry-After的响应信息。
输入已添加至平台的用户的全称。 图5 输入用户名全称 单击“添加”,设置用户角色。详细成员角色介绍请参见表1。 图6 设置成员角色 单击“确认”,将用户添加至项目中。 移除、修改项目成员 操作步骤 单击项目名称,进入项目“设置”页。 单击“操作”列“修改”,重新设置项目成员的角色。 详细项目成员角色和权限介绍请参见成员角色和权限。
描述 type String 任务启动事件类型 count Integer 任务启动事件发生次数 reason String 任务启动事件状态 message String 任务启动事件详细信息 first_timestamp String 任务启动事件首次上报时间 last_timestamp
操作:可以单击操作列“删除”,删除对应的参数。 图2 配置流程参数 参数配置完成后,单击“保存”。 流程创建成功后,单击“保存并启动作业”,或者在流程管理页面,单击流程列表操作列的“启动作业”进入作业设置页面,配置作业的相关信息,具体可参考新建作业。 父主题: Nextflow
描述 type String 任务启动事件类型 count Integer 任务启动事件发生次数 reason String 任务启动事件状态 message String 任务启动事件详细信息 first_timestamp String 任务启动事件首次上报时间 last_timestamp
上传大于1GB数据 当数据过大,或者数据处于服务器上时,页面传输并不是很方便,所以可以利用EIHealth平台的命令行工具进行数据文件、文件夹传输。命令行配置方法请参见配置命令行工具。 上传数据 使用命令行工具upload命令,将本地数据上传到EIHealth平台中。该命令不支持将数据上传到引用目录。
单击应用图标,弹出编辑、删除、复制图标,可对应用执行相应操作。 图5 编辑应用 单击按钮,进入参数设置页面,可查看修改参数。 名称:应用的原始名称。 版本:应用版本。 显示名称:应用在流程中的显示名称,可修改。 镜像启动命令:镜像启动的命令。可在右上角放大查看,在右下角下拉查看。 源项目:显示应用隶属的项目。
单击“新建应用”,创建fastqc应用。 图3 设置镜像名称、版本等信息 镜像启动命令如下所示。镜像启动命令需要引用输入、输出参数中的变量,并以大括号{}扩起,以$符号进行引用。 fastqc -f fastq -o ${output-dir} ${input-file} 图4 设置CPU、内存、输入输出参数