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检查是否已安装IB驱动。 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 执行以下命令,切换为root 用户。 $ sudo su 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令,查询是否已安装IB驱动。 # rpm -qa | grep mlnx-ofa #
普通用户切换至管理员用户,请使用命令sudo su。 前提条件 已成功创建弹性云服务器,并绑定了弹性IP进行登录。 操作步骤 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 将ECS对应的密钥文件(.pem文件,假设为*.pem)拷贝至
在华为云控制台搜索“弹性文件服务 SFS”,并在弹性文件服务页面右上角选择“创建文件系统”。 图1 创建文件系统 2.在"创建文件系统"界面的"文件系统类型"选项中,根据业务需要,选择"HPC型"或"HPC缓存型"文件系统类型。 图2 选择文件系统类型 3.在"创建文件系统"界面的"选择
4 vm2 ... 执行以下命令,添加hostfile文件。 # vi hostfile 添加的内容为集群中参与测试的弹性云服务器的主机名。 vm1 vm2 ... 修改hostfile,运行MPI benchmark,运行时指定hostfile文件路径。 以两个弹性云服务器为例:
登录用户为创建弹性云服务器时指定的用户名。 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令,验证参加测试的弹性云服务器之间是否可以免密码互相登录。 $ ssh 用户名@SERVER_IP 执行以下命令,关闭弹性云服务器的防火墙。 # iptables -F
host-192-168-0-75 /root/spe_hello 图1 在集群上通过Spectrum MPI运行可执行文件 hostfile文件在运行时需要指定路径,可执行文件hello路径需为绝对路径,集群中所有可执行文件在同一路径下。 父主题: 在HPC集群上运行MPI应用
TH unset MPI_REMSH 执行以下命令,查看环境变量导入是否成功。 # which mpirun 图3 查看环境变量 执行以下命令,在单个弹性云服务器上通过Spectrum MPI运行可执行文件。 执行以下命令,编辑文件。 # cd # vi hello.c 编辑内容如下:
如果存在多个pkey,使用英文逗号隔开。 执行以下命令,检查环境变量是否配置成功。 # which mpirun 图3 检查环境变量 在单个BMS上运行Platform MPI。 执行以下命令,重新编译hello.c文件。 $ mpicc hello.c -o hello 执行以下命令,在单个BMS上运行Platform
执行以下命令,导入配置的MPI环境变量。 $ source ~/.bashrc 执行以下命令,查看MPI环境变量是否正常。 $ which mpirun 图3 环境变量正常 回显如图3所示表示环境变量正常。 执行以下命令,在单个BMS上运行社区OpenMPI。 执行以下命令,生成可执行文件。
MPI_REMSH 执行以下命令,查看MPI环境变量是否正常。 $ which mpirun 图1 检查MPI环境变量 在单个BMS上通过Spectrum MPI运行可执行文件。 假设hello.c文件在“/home/rhel/”目录下,生成的可执行文件名为hello,执行以下命令: $ cd /home/rhel/
3-x86_64.tbz。 执行以下命令,解压HPC-X工具套件。 # tar -xvf hpcx-v2.0.0-gcc-MLNX_OFED_LINUX-4.2-1.2.0.0-redhat7.3-x86_64.tbz (可选)执行以下命令,修改HPC-X工具套件的目录。 # mv
STAR-CCM+启动相关问题 STAR-CCM+使用OpenMPI启动时,命令中有"-x"和"--mca"导致启动失败 问题现象: STAR-CCM+使用OpenMPI启动时候命令中同时有"-x"和"--mca"会启动失败,OpenMPI不支持"-x"参数和"--mca"同时使用,报错如下图所示。
128/lib64 执行下列命令,导入环境变量。 # source ~/.bashrc 执行下列命令,查看是否导入成功。 # which mpirun 图2 环境变量导入成功 回显结果如图2所示,表示环境变量导入成功。 执行以下命令,在单个ECS上运行Intel MPI。 执行以下命令,重新生成可执行文件。
128/lib64 执行下列命令,导入环境变量。 $ source ~/.bashrc 执行下列命令,查看是否导入成功。 $ which mpirun 图2 Intel MPI环境变量导入成功 回显结果如图2所示,表示环境变量导入成功。 执行以下命令,在单个BMS上运行Intel
执行下列命令,导入环境变量。 $ source ~/.bashrc 执行下列命令,查看是否导入成功。 $ which mpirun 图2 MPICH环境变量导入成功 回显结果如图2所示,表示环境变量导入成功。 执行以下命令,在单个BMS上运行MPICH。 执行以下命令,生成可执行文件。
bashrc”文件,添加如下配置内容: export PATH=$PATH:/usr/mpi/gcc/openmpi-3.1.0rc2/bin export LD_LIBRARY_PATH=/usr/mpi/gcc/openmpi-3.1.0rc2/lib64 执行以下命令,查看MPI环境变量是否正常。
系统不会定期自动修改弹性云服务器密码。为安全起见,建议您定期修改密码。 高级配置 可选配置,如需使用“高级配置”中的功能,请单击“现在配置”。否则,请单击“暂不配置”。 文件注入 可选配置,主要用于创建弹性云服务器时向弹性云服务器注入脚本文件或其他文件。配置文件注入后,系统在创建
bashrc”文件,添加如下配置内容: export PATH=$PATH:/usr/mpi/gcc/openmpi-4.0.2a1/bin export LD_LIBRARY_PATH=/usr/mpi/gcc/openmpi-4.0.2a1/lib64 执行以下命令,查看MPI环境变量是否正常。
创建虚拟私有云和子网 修改虚拟私有云基本信息 镜像服务(IMS) 可以使用公共镜像、私有镜像、共享镜像创建高性能计算的云服务器。 也可以将已有的HPC场景的云服务器创建私有镜像。 创建私有镜像 云硬盘(EVS) 购买云硬盘并挂载至HPC场景的云服务器。 购买云硬盘 弹性文件服务(SFS)
为确保集群能正常创建/部署,需保证安全组规则22端口开放。具体配置方法请参见:为安全组添加安全组规则 一站式HPC服务使用弹性文件服务SFS作为文件共享存储,更多关于弹性文件系统的信息,请参见《弹性文件服务用户指南》。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击管理控制台左上角的,选择区域和项目。 单击“购买HPC集群”。