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基于二代测序的基因组突变检测 NGS流程简介 配置命令行工具 上传数据 制作并上传镜像 创建应用 搭建NGS流程 执行分析作业 批量执行NGS分析
获取并使用命令行工具eihealth-toolkit 步骤1：获取认证信息 步骤2：下载并安装命令行工具eihealth-toolkit 步骤3：初始化配置 步骤4：查看与执行操作命令
删除项目 获取项目详情 更新或者添加项目成员角色 移除项目成员 转移项目 批量删除项目成员 获取项目审计日志追踪器 更新项目审计日志追踪器配置 获取项目审计日志 获取指定审计日志 下载近一万条审计日志 父主题： 项目管理
程和作业，不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用 最小长度：0 最大长度：24 gpu_type String gpu架构类型，取值范围 ' '|GPU|Snt9|D310。对于流程和作业，不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用
最小值：1 最大值：128 缺省值：1 gpu 是 Float notebook占用的gpu，0.1为使用单卡10%，1为占满单个显卡，1+为使用多个显卡 最小值：0 最大值：16 缺省值：0 memory 是 Float notebook占用的内存,单位为"G" 最小值：2 最大值：512
对情况的计算评估，让研究人员可以同时从21个蛋白的角度，综合、无偏地评估药物效果，从而为后续的药物机制研究、临床试验提供线索。 本案例介绍如何使用EIhealth平台虚拟药物筛选功能复现上述研究成果（https://doi.org/10.1021/acs.jcim.0c00821），并搭建虚拟药物筛选数据库。
com/eihealth/admet:2.0.0' } 暂不支持用户设置部分Nextflow配置项 对于dag， timeline， report,，trace配置，医疗智能体（EIHealth）平台会默认开启并且指定相关路径，会覆盖用户侧配置，可以在作业详情页面查询和下载相关信息。相关信息可参考https://www
最小长度：1 最大长度：120 数组长度：1 - 8 exclusive Boolean 是否排除子结构。 operator String 多个子结构之间的逻辑关系。 枚举值： or and 表13 InteractionConstraintDto 参数 参数类型 描述 interactions
最小长度：1 最大长度：120 数组长度：1 - 8 exclusive 是 Boolean 是否排除子结构。 operator 否 String 多个子结构之间的逻辑关系。 枚举值： or and 表12 InteractionConstraintDto 参数 是否必选 参数类型 描述 interactions
最小长度：1 最大长度：120 数组长度：1 - 8 exclusive 是 Boolean 是否排除子结构。 operator 否 String 多个子结构之间的逻辑关系。 枚举值： or and 表12 InteractionConstraintDto 参数 是否必选 参数类型 描述 interactions
Array of strings 子结构SMILES exclusive 是 Boolean 是否排除子结构 operator 否 String 多个子结构之间的逻辑关系 缺省值：or 枚举值： or and 表6 BindingSite 参数 是否必选 参数类型 描述 protein 否
对于执行失败的作业，鼠标点击作业状态，在弹出的提示框中可以查看“失败信息”和“失败原因”。 作业相关信息 在详情页可以查看作业执行命令、配置参数、流程配置文件、执行日志、报告信息。 图1 作业相关信息 Tasks相关信息 在详情页可以查看每个Tasks的相关信息。单击每个task可以打
NextflowTaskResourceRequested 参数 参数类型 描述 container String 容器名称 queue String 执行队列，使用','分隔多个值 cpus Integer 指定task执行需要的cpu数量 memory String 指定task执行需要的内存大小 disk String
最小值：1 最大值：128 缺省值：1 gpu Float notebook占用的gpu，0.1为使用单卡10%，1为占满单个显卡，1+为使用多个显卡 最小值：0 最大值：16 缺省值：0 memory Float notebook占用的内存,单位为"G" 最小值：2 最大值：512
最小长度：1 最大长度：120 数组长度：1 - 8 exclusive Boolean 是否排除子结构。 operator String 多个子结构之间的逻辑关系。 枚举值： or and 表13 InteractionConstraintDto 参数 参数类型 描述 interactions
用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用 gpu_type: '' # gpu架构类型，取值范围 ' '|GPU|Snt9|D310。对于流程和作业，不填默认使用前一级的配置，填值会覆盖更新。覆盖关系：作业->流程->应用
安装Nextflow 功能介绍 安装Nextflow（file和version参数必须提供其中一种） 调试 您可以在API Explorer中调试该接口，支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例，并提供SDK代码示例调试功能。 URI POST /v1
助您安全地控制平台的访问和使用权限。 表1 用户管理类型 类型 说明 系统级别用户管理 系统级的角色配置，可创建平台的子用户，并为其分配权限。 项目级别用户管理 资源级的角色配置，以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组，以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。详
查看节点执行规则 图7 查看节点伸缩历史 图8 查看关联节点列表 配置缩容策略 缩容策略只支持统一配置，且不会对手动购买的计算资源节点缩容。 在平台右上角用户名中选择“系统资源>计算资源>节点伸缩策略”。 单击“配置缩容策略”。 图9 配置缩容策略 表2 缩容策略参数说明 参数 说明 空置时间
登录盘古辅助制药平台。 单击“进入平台”，进入药物平台操作页面。 单击“功能模块 > 苗头化合物发现 > 分子对接模块”，进入分子对接配置页面。 根据分子对接章节完成参数配置。 分子对接任务完成后，单击“作业中心 > 作业名称”，进入作业在输出结果页面查看。 图1 查看分子对接结果 在输出结果
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