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e/rhel”目录下)。 执行以下命令,解压软件包。 # tar -xzvf openmpi-3.1.0.tar.gz # cd openmpi-3.1.0 执行以下命令,安装所需要的库文件,安装之前请确保BMS能与外网连通。 执行以下命令,安装依赖包。 # yum install
安装和使用Intel MPI 操作场景 本节指导用户在BMS集群上安装和使用Intel MPI应用(以版本l_mpi_2018.0.128为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装Intel MPI。 下载Intel
执行以下命令,解压并安装Intel MPI。 以l_mpi_2018.0.128.tgz为例: # tar -xvf l_mpi_2018.0.128.tgz # cd l_mpi_2018.0.128/ # ./install.sh 图1 Intel MPI安装成功 配置环境变量。
登录用户为创建弹性云服务器时指定的用户名。 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令,验证参加测试的弹性云服务器之间是否可以免密码互相登录。 $ ssh 用户名@SERVER_IP 执行以下命令,关闭弹性云服务器的防火墙。 # iptables -F
1/lib 执行以下命令,导入配置的MPI环境变量。 # source ~/.bashrc 执行以下命令,查看MPI环境变量是否正常。 # which mpirun 图2 查看社区OpenMPI环境变量 系统回显结果如图2所示,则环境配置正常。 执行以下命令,在单个弹性云服务器上运行Intel
如果选择手动接受IBM Spectrum MPI安装许可协议,执行以下命令: # export IBM_SPECTRUM_MPI_LICENSE_ACCEPT=no 安装License部分。 选择自动接受IBM Spectrum MPI安装许可协议的,执行以下命令: # rpm -ivh ibm_smpi_lic_s-10
处理方法 检查“/etc/ssh/sshd_config”配置文件,确保配置文件中“AuthorizedKeysFile”添加了“/usr/local/.hpccluster/role/.ssh/authorized_keys”配置项。 检查“/usr/local/.hpccluster/role/
登录用户为创建弹性云服务器时指定的用户名。 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令,验证参加测试的弹性云服务器之间是否可以免密码互相登录。 $ ssh 用户名@SERVER_IP 执行以下命令,关闭弹性云服务器的防火墙。 # iptables -F
也对断点续算有集成支持,如PBS、Slurm与LSF等。 本节以LAMMPS为例,介绍如何在HPC进行断点续算。 步骤1 安装FFTW 依次执行以下命令,安装FFTW软件。 yum install gcc-gfortran gcc-c++ wget http://www.fftw
c,关闭所有ECS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令,查看ECS的主机名。 # hostname 图2 查看主机名 依次登录集群中所有ECS,重复执行2.a~2.b,获取所有ECS的主机名。 登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令,添加hosts配置文件。 # vi
登录用户为创建弹性云服务器时指定的用户名。 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令,验证参加测试的弹性云服务器之间是否可以免密码互相登录。 $ ssh 用户名@SERVER_IP 执行以下命令,关闭弹性云服务器的防火墙。 # iptables -F
如果选择手动接受IBM Spectrum MPI安装许可协议,执行以下命令: # export IBM_SPECTRUM_MPI_LICENSE_ACCEPT=no 安装License部分。 选择自动接受IBM Spectrum MPI安装许可协议的,执行以下命令: # rpm -ivh smpi_lic_s-10
3,关闭所有ECS的防火墙。 修改配置文件。 登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令,查看ECS的主机名。 # hostname 图2 查看ECS的主机名 依次登录集群中所有ECS,重复执行步骤2.1~步骤2.2,获取所有ECS的主机名。 登录集群中任意一台ECS。 执行以下命令,添加hosts配置文件。
系统不会定期自动修改弹性云服务器密码。为安全起见,建议您定期修改密码。 高级配置 可选配置,如需使用“高级配置”中的功能,请单击“现在配置”。否则,请单击“暂不配置”。 文件注入 可选配置,主要用于创建弹性云服务器时向弹性云服务器注入脚本文件或其他文件。配置文件注入后,系统在创建弹性云服务器时自动将文件注入到指定目录下。
HPC-S²应用场景 计算资源创建:HPC-S²支持一键式报价和一键式购买HPC集群,并在创建集群时自动部署所配置的调度器、域控制器以及运行时的依赖。 计算资源配置:HPC-S²支持计算资源的多种配置管理,包括集群管理、节点管理、扩容集群节点及资源状态查看等。 HPC-S²使用限制 HPC解
本节操作介绍创建HPC集群的方式,以及创建流程,引导您一站式完成集群的创建、配置,并在HPC-S²上完成高性能计算作业。 部署方式简介 购买高性能计算解决方案:根据实际计算需求购买HPC集群,可以在购买时同时指定管理节点配置与计算节点配置。 图1 购买HPC集群 使用已有节点部署HPC集群:在已有节点资源的前提下,指
STAR-CCM+安装与运行 安装STAR-CCM+ yum install libXt libXext libSM libX11 cd /root unzip siemens.star-ccm15.zip cd Siemens.STAR-CCM+15 tar zxvf STAR-CCM+15
查看已有节点部署集群的进度 操作场景 使用已有节点部署集群的命令下发之后,如需查看集群的部署进度,可进入一站式HPC服务提供的“进度”页查看当前集群部署的具体进展和详细信息。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。 在“集群管理”页面选择要查看的集群,单击操
用户可使用系统自动创建的安全组,也可以根据需要自行创建一个安全组使用,安全组规则的配置会影响弹性云服务器的正常访问与使用。 为确保集群能正常创建/部署,需保证安全组规则22端口开放。具体配置方法请参见:为安全组添加安全组规则 一站式HPC服务使用弹性文件服务SFS作为文件共享
查看集群缩容的进度 操作场景 集群缩容的命令下发之后,如需查看集群的缩容进度,可进入一站式HPC服务提供的“进度”页查看当前集群缩容的具体进展和详细信息 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击左侧的“集群管理”。 在“集群管理”页面选择要查看的集群,单击操作列的“进度”进入查看。