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String 应用描述 app_image String 应用镜像 app_commands Array of strings 任务使用到的应用自带的命令信息 app_input_parameters Array of AppInputParameterDto objects 任务使用到的应用自带的输入参数信息
查看运行结果。 输出每对配体的相对结合自由能、分子图、相似性等。也可以单击右边“查看轨迹”,下载运动轨迹。结果页面支持Pair和Ligand两种查看方式。 也可以下载输出结果文件包含小分子的基本信息和属性。 下载操作将会产生流量费用,具体可参考计费说明。 图6 查看结果(1) 图7 查看结果(2)
以在本地编辑完成后上传至平台进行使用,数据库模板支持yaml或yml格式,且文件大小不能超过10M。 导入方式选择“上传”,单击“下载示例文件”下载数据库模板示例,编辑后上传模板文件至平台,单击“确定”。 图2 上传模板 模板示例如下: database: name: demo
labels Array of strings 应用标签 image String 应用镜像 commands Array of strings 应用命令 resources ResourceDto object 应用申请资源 inputs Array of AppInputParameterDto
提交成功后,可以在“作业中心”查看执行结果。 查看运行结果。 可以单击“下载”,下载分子属性预测结果信息。单击“操作”列的“查看”,查看分子信息。分子属性预测对应的下游分析为分子优化和合成路径,通过单击“下游分析”可以进行创建。 下载操作将会产生流量费用,具体可参考计费说明。 图2 查看结果(1)
AK/SK,请妥善保管AK/SK信息。 图2 访问密钥 每个用户仅允许新增两个访问密钥。 为保证访问密钥的安全,访问密钥仅在初次生成时自动下载,后续不可再次通过管理控制台页面获取。请在生成后妥善保管。 父主题: 数据管理
8g,高优先级的先投递。 图1 新建作业 单击“确定”,进入启动作业页面。 (可选)在启动作业页面,可以通过,添加作业相关参数。 上传参数的模板可以通过单击进行下载。 如果流程设置了参数,作业上传的参数将会覆盖流程设置的参数。 单击“启动作业”。 父主题: Nextflow
String 应用描述 app_image String 应用镜像 app_commands Array of strings 任务使用到的应用自带的命令信息 app_input_parameters Array of AppInputParameterDto objects 任务使用到的应用自带的输入参数信息
count Integer 作业日志条数 logs Array of strings 日志内容列表 download_url String 日志下载链接 请求示例 无 响应示例 状态码: 200 OK { "count" : 1, "logs" : [ "Nextflow log"
状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String task id command String task执行命令 status String task状态 error_action String task失败后的策略 exit Integer task退出状态码
count Integer 任务日志条数 logs Array of strings 日志内容列表 download_url String 日志下载链接 请求示例 无 响应示例 状态码: 200 OK { "count" : 1, "logs" : [ "Nextflow task
流程参数列表文件,取值范围[0, 10M] 响应参数 无 请求示例 更新Nextflow流程,修改流程描述为description,标签为labelA,labelB,流程主文件为main.nf https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{proj
缺省值:0 create_time String 创建时间 content String 文件内容 download_url String 下载链接 allowed_operate Boolean 可操作标记 缺省值:true deletable Boolean 可删除标记 缺省值:true
参数 参数类型 描述 name String 报告文件名 最小长度:1 最大长度:1024 download_url String 报告文件下载地址 最小长度:1 最大长度:1024 请求示例 无 响应示例 状态码: 200 OK { "report_files" : [ {
FOLDER size Long 大小 缺省值:0 create_time String 创建时间 download_url String 下载链接 请求示例 查询审计日志详情 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{pr
提交成功后,可以在“作业中心”查看执行结果。 图1 设置靶点口袋发现文件 查看靶点口袋发现结果。 单击作业名称,在输出结果页面,可以单击“查看轨迹”,下载运动轨迹。可以单击”下游分析”,将发现的口袋作为对接口袋进行分子对接。也可以在右边口袋列表中查看口袋信息。 图2 查看靶点口袋发现结果 图3
fastq-extend string fastq文件后缀<extend>,适配不同的后缀。 read-cmd string 读取输入文件时使用的命令,如读取.gz文件使用zcat,文本文件使用cat。 para-str string 对扩展参数的支持,可以不填。 genome-dir directory
FOLDER size Long 大小 缺省值:0 create_time String 创建时间 download_url String 下载链接 请求示例 查询审计日志列表 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{pr
timeline, report,,trace配置,医疗智能体(EIHealth)平台会默认开启并且指定相关路径,会覆盖用户侧配置,可以在作业详情页面查询和下载相关信息。相关信息可参考https://www.nextflow.io/docs/latest/tracing.html 对于pod配置,
图4 引用的数据 引用OBS类型数据时,如果数据在OBS中的存储类型为“归档存储”,则将该数据引用过来后,该数据不能用于创建作业,并不可下载。 平台系统管理员在自己的所有者、管理员、操作者项目可以引用OBS类型数据。平台系统管理员在自己的所有者、管理员、操作者项目可以解除引用O