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购买资源 盘古辅助制药平台购买完成后,单击“进入平台”,在平台右上角单击用户名,选择“资源中心”。 您可以根据实际需求选择购买功能调用套餐包和存储套餐包。在后续使用过程中,也可根据使用情况随时购买资源。 资源中心 在“资源中心>功能调用”中可以查看功能调用套餐包的使用情况。 图1
ulanqab.huawei.com/__nextflow_run__/xxx-xxx-xxx/xx-xxxx-xxxxx/DAG.png?AccessKeyId=ABCDE&Expires=1676759470&Signature=DDDDD" }, { "name" :
"description" : "归档2021" } 响应示例 状态码: 202 ACCEPTED { "id" : "94116a6b-1945-4581-b64c-2cea712988ab" } 状态码 状态码 描述 202 ACCEPTED 错误码 请参见错误码。 父主题: 数据归档
4bb8df9a71a" } 响应示例 状态码: 202 ACCEPTED { "id" : "94116a6b-1945-4581-b64c-2cea712988ab" } 状态码 状态码 描述 202 ACCEPTED 错误码 请参见错误码。 父主题: 数据归档
资源中心 在资源中心可以查看功能调用套餐包和存储套餐包的使用情况、购买记录以及购买套餐包,也可以绑定CSS资源详细的购买步骤可以参考购买资源,此功能只支持专业版。 绑定CSS资源 使用自定义数据库之前需要先购买和绑定CSS资源,购买步骤参考购买资源,绑定具体操作如下: 在盘古辅助
"SUCCEEDED", "message" : "string" } ] 状态码: 207 MULTI_STATUS [ { "id" : "baabcb56-5bb6-11eb-8a0d-fa163e3ddba1", "status" : "SUCCEEDED"
上传数据 NGS流程中需使用二代测序得到的原始fastq文件、参考基因组序列、参考Variants数据集。 本示例中以Windows系统命令行工具为例,介绍如何将本地数据上传到EIHealth平台。更多的命令介绍请参见命令行工具。 使用命令行工具,用switch命令进入待操作的项目。
oken。 最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 无 请求示例 无 响应示例 无 状态码 状态码 描述 200 OK 202 ACCEPTED 错误码 请参见错误码。 父主题: Nextflow引擎生命周期管理
作业配置文件说明 流程创建完成后,可基于已创建的流程运行分析作业。 在EIHealth平台,运行分析作业的过程通过图形化的界面操作完成。在命令行工具中,该过程以配置文件的形式给出。您可以基于已获取到的模板使用命令行工具启动分析作业,运行的分析作业将同步显示到EIHealth平台。
切换路径 使用cd命令在EIHealth项目中切换数据路径。 命令结构 health cd <path> 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 当前目录,不进行跳转。 health cd
获取项目 使用get命令获取当前用户有权限访问的所有项目列表,以及项目信息,包含项目名称、ID、所有者、项目角色、存储大小、状态、创建时间、更新时间。 在使用该命令前,您需要通过平台创建项目。 命令结构 health get project <project-name> [flags]
myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/nextflow/clean-cache 响应示例 无 状态码 状态码 描述 202 ACCEPTED 错误码 请参见错误码。 父主题: Nextflow引擎生命周期管理
获取系统标签 使用get命令获取系统标签库列表。 命令结构 health get label [flags] 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 health get label #
安装/卸载Nextflow 安装Nextflow Nextflow需要用户自己进行安装,安装的权限只有管理员拥有。 在平台右上角用户名中选择“系统设置”。 在“Nextflow配置”模块,单击“安装”。 图1 安装Nextflow 选择安装方式。目前支持GitHub获取和上传安装包两种方式。
OK { "version" : "1.0.0", "workspace" : 1024000, "status" : "success", "progress" : 0.75 } 状态码 状态码 描述 200 OK 错误码 请参见错误码。 父主题: Nextflow引擎生命周期管理
显示当前目录 使用pwd命令显示当前所在的EIHealth项目中的目录。同时,该命令支持显示引用项目的目录。 命令结构 health pwd 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 health
查看对象属性 查看对象属性。 命令格式 health stat <obj> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 obj 不涉及 是 查看的文件、文件夹对象。 注意: 如果为引用数据,必须要使用绝对路径(文件夹最后要加/)。未引用的数据不能查看。 --bf -b
获取归档数据 使用get命令查看归档列表或者下载归档的全部数据清单。 命令结构 health get archive <archive-id> [flags] # 命令中的archive可替换为backup 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 archive-id 无 否