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MMPS, GROMACS。同时HPC常用的调度软件也对断点续算有集成支持,如PBS、Slurm与LSF等。 本节以LAMMPS为例,介绍如何在HPC进行断点续算。 步骤1 安装FFTW 依次执行以下命令,安装FFTW软件。 yum install gcc-gfortran gcc-c++
flavor-list | grep h2 图6 查看H2型规格列表 Curl命令方式 URI GET /v2/{$tenant_id}/flavors/detail 请求样例 curl -g -i -X GET https://iam.eu-de.otc.t-systems.com:4
方法二:使用已有节点部署HPC集群 操作场景 如果用户需要使用已有的ECS节点资源构建HPC集群,可以使用该功能进行集群的部署。下面介绍如何使用已有节点部署HPC集群。 使用已有节点部署集群,首先选择管理节点,再选择计算节点,切换计算节点与管理节点需要有相同的CPU架构,需要在相
STAR-CCM+部署HPC集群流程图 本文档介绍如何通过仿真软件STAR-CCM+部署HPC集群,流程如图1所示。 图1 基于STAR-CCM+部署HPC集群流程图 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装MPICH。 下载MPICH。 下载地址:https://aur.archlinux.org/packages/mpich/ 执行以下命令,解压并安装MPICH。 以mpich-3.3.2
console中获取到的挂载的路径。 第1个1表示备份文件系统,第2个1表示从/分区的顺序开始fsck磁盘检测,0表示不检测,_rnetdev 表示主机无法挂载直接跳过,避免无法挂载主机无法启动。 设置服务开机自启动 systemctl enable rpcbind systemctl enable nfs
创建应用集群 操作场景 您可以在几分钟之内,批量创建多台弹性云服务器。该任务指导用户使用制作的私有镜像创建应用集群,包括管理控制台方式和基于HTTPS请求的API(Application programming interface)方式。 管理控制台方式 登录管理控制台。 选择“计算 >
MPI应用(以版本l_mpi_2018.0.128为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装Intel MPI。 下载Intel MPI。 下载地址:https://software.intel.com/en-us/intel-mpi-library 执行以下命令,解压并安装Intel MPI。
下载安装包“MLNX_OFED_LINUX-4.6-1.0.1.1-rhel7.6alternate-aarch64.tgz”。 下载地址:https://network.nvidia.com/products/infiniband-drivers/linux/mlnx_ofed/ 图2
UEFI图2,否则系统无法启动。 图1 创建系统盘镜像 图2 选择启动方式 为创建的私有镜像打标签 登录到 API Explorer:https://apiexplorer.developer.huaweicloud.com/apiexplorer/doc?product=IMS&api=Up
安装IB驱动。 下载安装包“MLNX_OFED_LINUX-4.3-1.0.1.0-rhel7.3-x86_64.tgz”。 下载地址:https://network.nvidia.com/products/infiniband-drivers/linux/mlnx_ofed/ 图2
IB驱动,执行3。 如果返回值与图1不同,表示弹性云服务器未安装IB驱动,执行2。 下载并安装对应的IB驱动。 在Mellanox官网https://network.nvidia.com/products/infiniband-drivers/linux/mlnx_ofed/,选
对于已完成HPC配置的弹性云服务器,您可以将其作为模板制作私有镜像,便于快速创建集群。该任务指导用户怎样将Linux弹性云服务器转化为私有镜像,包括管理控制台方式和基于HTTPS请求的API(Application programming interface)方式。 前提条件 已确保Linux云服务器网卡设置为DHCP的方式动态获取网络地址。
对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装Intel MPI。 下载Intel MPI。 下载地址:https://software.intel.com/en-us/intel-mpi-library 执行以下命令,解压并安装Intel MPI。
1Eval-rh7_Aug11.x86_64.rpm ibm_smpi-10.01.01.0Eval-rh7_Aug11.x86_64.rpm 下载地址:https://www-01.ibm.com/marketing/iwm/iwm/web/preLogin.do?source=swerpsysz-lsf-3
通讯录安装 Udapl安装和测试 Udapl安装 cd /root wget https://linux.mellanox.com/public/repo/mlnx_ofed/4.1-1.0.2.0/SRPMS/dapl-2.1.10mlnx-OFED.3.4.2.1.0.41102
已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装OpenMPI。 下载社区OpenMPI,版本号为“openmpi-4.0.2.tar.bz2”。 下载地址:https://download.open-mpi.org/release/open-mpi/v4.0/openmpi-4.0.2.tar.bz2
3的HPC-X版本是“hpcx-v2.2.0-gcc-MLNX_OFED_LINUX-4.3-1.0.1.0-redhat7.3-x86_64.tbz”。 下载地址:https://developer.nvidia.com/networking/hpc-x 将下载的软件包拷贝到BMS内(建议在“/home/rhel”目录下)。
3及其之后的版本 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 获取软件包。 获取IBM Spectrum MPI软件包。 下载地址:https://www-01.ibm.com/marketing/iwm/iwm/web/preLogin.do?source=swerpsysz-lsf-3
图1 我的配额 您可以在“服务配额”页面,查看各项资源的总配额及使用情况。 如果当前配额不能满足业务要求,请参考后续操作,申请扩大配额。 如何申请扩大配额? 登录管理控制台。 在页面右上角,选择“资源 > 我的配额”。 系统进入“服务配额”页面。 图2 我的配额 单击“申请扩大配额”。