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上传镜像时如果上传命令中未指定镜像类型,新上传的镜像默认显示为“OTHER”,您可以将镜像标记为“APP”或“NOTEBOOK”。 APP:用于创建应用的镜像。 NOTEBOOK:用于创建Notebook的镜像。
health get quota # 执行成功返回结果如下 Name Used Total Unit Total projects 27 100 NUM Applications per
SFS表示使用io加速,EVS表示使用本地盘加速 - task_name: app1-2 inputs: - name: input-dir values: - '${app1-1.output-dir}' resources:
当应用也配置了标签,如果应用和作业的计算节点标签在同一计算节点上,则应用调度至该计算节点上;应用和它的作业,不管节点标签是否一致,都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。 如果设置了不存在的计算节点标签,作业会进入等待,直至配置了相应的标签。
应用场景 靶点发现 在靶点发现阶段,提供蛋白质结构预测、靶点口袋发现功能。 苗头化合物发现 在苗头化合物发现阶段,提供分子对接、口袋分子设计,分子属性预测功能,在分子对接中,预置了大量的分子库可供选择。
下载应用或流程 在“工具”页面选择“流程”或“应用”。 选择需要发布的流程,单击“操作”列“更多”>“下载”。 图1 下载应用 下载内容不包含应用和流程的id,所有引用关系通过名称和版本来指定。 父主题: 工具管理
获取项目审计日志追踪器 功能介绍 获取项目审计日志追踪器 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI GET /v1/{project_id}/eihealth-projects
//xxx/huo/ LastModified: 2022-08-30T11:13:48Z Size: 0B StorageClass: standard ETag: 6c2d85292e26b513c2670998ecf8427e ContentType: application
工具管理简介 EIHealth中的每一个分析作业都依托于应用运行。应用可以组合形成分析流程。 应用是生物信息学软件的镜像封装。您可以将软件制作成镜像,并将镜像上传至EIHealth平台,通过应用引入镜像。制作好的应用可以单独使用,也可以将多个应用编排入流程串联使用。
400 eihealth.01050006 Unable to update the subscribed app {0}. 订阅的应用不支持修改,请检查该应用是否为订阅应用。
步骤1:订阅应用 进入资产市场,分别订阅fasp,bwa-mem,bamqc,picard-insertsize应用。 图1 订阅应用 可以在“工具 > 应用”列表可以看到刚刚订阅的应用。
应用的参数和镜像启动命令如何设置 创建应用时,需要设置应用的输入、输出参数和镜像的启动命令。需要您熟悉所制作的生物信息学软件的使用并具备一定的开发经验。 例如,设置FastQC应用的参数和镜像启动命令时,首先通过阅读FastQC介绍和FastQC命令说明了解软件的使用。
文件中 health get db template --sample > app.yaml 父主题: 数据库管理命令
更新项目审计日志追踪器配置 功能介绍 更新项目审计日志追踪器配置 调试 您可以在API Explorer中调试该接口,支持自动认证鉴权。API Explorer可以自动生成SDK代码示例,并提供SDK代码示例调试功能。 URI PUT /v1/{project_id}/eihealth-projects
strings OK 请求示例 查询资产属性列表 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/assets/properties 响应示例 状态码: 200 OK [ "IMAGE", "DATASET", "APP
Array of QuotaRsp objects 配额信息列表 count Integer 配额列表个数 表4 QuotaRsp 参数 参数类型 描述 name String 配额项名称,支持USER,PROJECT,USER_PROJECT,STORAGE,PROJECT_APP
删除作业 功能介绍 删除作业 URI DELETE /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/jobs/{job_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id
删除流程 功能介绍 删除流程 URI DELETE /v1/{project_id}/eihealth-projects/{eihealth_project_id}/workflows/{workflow_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id
工具管理 工具管理简介 新建应用 导入应用 上传应用 发布应用 编辑应用 创建FastQC应用样例 新建流程 流程设计器 导入流程 上传流程 发布流程 添加分类标签 下载应用或流程 父主题: 用户指南(基因平台)
默认值:application/json; charset=UTF-8 是 对于获取用户Token接口,返回如图1所示。 其中“x-subject-token”就是需要获取的用户Token。有了Token之后,您就可以使用Token认证调用其他API。