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SDF、PDB、MOL2格式。 受体蛋白：受体蛋白文件，支持PDB格式。 图2 选择配体分子和受体蛋白 设置数据库。 数据库功能可以将任务运行过程中产生的数据文件按照模板生成数据库。 数据库名称：数据库的名称。 输出文件格式：可以将流程生成的分子对接结果，保存为.txt、.csv或.vcf格式。使用“Docking
将生物信息学软件封装成Docker镜像，可以使程序在不同的环境中运行，并通过EIHealth平台的镜像管理，实现高效的调用，极大方便了软件的安装和运行。 Docker镜像是一个模板，是容器应用打包的标准格式，在部署容器化应用时可以指定镜像。例如一个Docker镜像可以包含一个完整的Ubuntu操作系统环境，里面仅安装了用户需要的应用程序及其依赖文件。
template1 project-02 EIHealth 347 xxx xxx 获取模板详情 health get db instance 12345 # 返回结果如下 { "id": "xxxx", "name": "job-1622803262953"
服务即表示您同意自行承担因第三方API使用可能产生的风险，包括但不限于数据泄露、服务中断或结果不准确。 # 对于因使用第三方服务而导致的任何直接或间接损失，我们不承担任何法律责任。 # 如您调用的第三方大模型API服务需要设置APIKEY或者headers，请参考https://platform
your-job -n your-instance # 返回结果如下 { "kind": "Pod", "apiVersion": "v1", "metadata": { ... } 获取事件 health get task
作，只需聚焦于科研工作，从而加快科研进展。 关于Jupyter Notebook的详细操作指导，请参见Jupyter Notebook使用文档。 支持的AI引擎 Notebook提供的AI引擎是Python 3，适配CPU/GPU芯片。 父主题： 开发环境（Notebook）
的基于GPU加速的对接方法，支持全局对接。 如果对接引擎选择Similar Docking，不需设置口袋信息，但需要为每一个靶点上传一个“模板配体文件”。 配置受体口袋位置，如果包含多个受体文件，需要每个受体都进行口袋设置，才能单击提交。 原始配体 将原始配体作为口袋位置，也可以通过上传配体文件来进行口袋设置。
联系技术支持开通白名单。 需要提供账号名，账号ID，项目ID等信息。相关信息获取方式如下： 使用华为云账号登录后，在右上角账号下选择“我的凭证”。 在API凭证中可以查看相关信息。 购买服务 盘古辅助制药平台提供包年包月、按需两种计费方式，您可以按需求进行选择。 关于计费模式的详细介绍，请参见计费说明。
进入JupyterLab页面后，自动打开Launcher页面，如下图所示。您可以使用开源支持的所有功能，详细操作指导可参见JupyterLab官网文档。 图2 JupyterLab主页 新建并打开Notebook 进入JupyterLab主页后，可在“Notebook”区域下，选择适用的
删除数据库和追加数据 可以通过“追加数据”到数据库来增加数据条数。每次追加最多追加500万条数据。 图3 追加数据 CSS相关常见问题请参考常见问题文档中的CSS章节。 父主题： 用户指南（盘古辅助制药）
菜单栏中有File、Edit、View、Insert、Cell、Kernel、Help等丰富功能。详细说明建议参考Jupyter Notebook使用文档，下方工具栏提供了常用的功能，能够满足常见的Python运行文件编写。 3 工具栏 工具栏罗列了支持的常用快捷操作，从左到右分别为：保存文
您可以直接使用该Notebook，编写和调测模型，进行开发工作。关于Jupyter Notebook的详细操作指导，请参见Jupyter Notebook使用文档。 图2 Notebook 父主题： 开发环境（Notebook）
设置靶点口袋发现文件 查看靶点口袋发现结果。 单击作业名称，在输出结果页面，可以单击“查看轨迹”，下载运动轨迹。可以单击”下游分析”，将发现的口袋作为对接口袋进行分子对接。也可以在右边口袋列表中查看口袋信息。 单击口袋列表的，可以收藏靶点口袋发现结果，收藏后可在收藏夹页进行查看。 图2 查看靶点口袋发现结果
时间会加长。 图3 靶点设置 图4 Target1设置 图5 Target2设置 图6 靶点设置完成 通过“靶点设置”上传靶点，并且设置对接口袋。 此处靶点设置为可选参数，如果选择靶点设置，可以将对接活性作为一个约束条件进行分子优化。靶点1对应的约束条件是target1_bind
最多可添加2个靶点。 如果不需要设置靶点，此步骤可以进行省略，如果设置了靶点，作业运行时间会加长。 通过“靶点设置”上传靶点，并且设置对接口袋。 此处靶点设置为可选参数，如果选择靶点设置，可以将对接活性作为一个约束条件进行分子生成。靶点1对应的约束条件是target1_bind
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