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数据管理 如何获取AK/SK 几种不同类型的归档,区别是什么
流程、作业 应用的参数和镜像启动命令如何设置 直接挂载OBS目录进行大规模计算,如何解决偶现报错
盘古辅助药物 为什么下载的部分靶点文件,显示不完整 CSS常见问题
两部分,华为云通过AK识别用户的身份,通过SK对请求数据进行签名验证,用于确保请求的机密性、完整性和请求者身份的正确性。 您在使用命令行工具时,需要使用AK/SK进行身份验证。 操作步骤 登录华为云管理控制台,鼠标指向页面右上角的用户名,在下拉列表中单击“我的凭证”。 图1 我的凭证入口
基本概念 应用 医疗智能体应用是生物信息软件的镜像封装,应用既可以独立使用,也可以将多个应用编排入流程串联使用。用户可以制作自定义应用,创建分析流程。 流程 医疗智能体流程包含基因组学分析过程所需应用的执行先后信息以及数据输入输出等定义。分析流程由至少一个应用组成,流程中的各个应
导入镜像 使用import命令从源项目导入镜像到当前项目。 只支持导入私有镜像,导入镜像和订阅的镜像不支持再次导入到别的项目。 命令结构 health docker import <project-name/image-name:tag-name> [flags] 表1 参数说明
更新镜像 使用update命令更新当前项目中的某个镜像仓库的描述信息或者类型。 命令结构 health docker update <project-name/image-name> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 project-name 无 否 要
创建子用户 使用管理员账户登录盘古辅助制药平台。 在右上角用户名中选择“用户管理”。 在用户管理页面,单击左上角“创建用户”,进入“创建用户”页面。 填写用户信息,分配子用户权限。 创建完成后,单击“确认”。 父主题: 用户管理
如何进行实名认证 实名认证入口 使用已注册的华为账号登录“华为云”。 单击账号名下拉框中的“账号中心”。 进入“账号中心”页面。 单击左侧导航中的“实名认证”,选择认证类型(个人认证/企业认证),根据页面提示进行实名认证。 实名认证类型介绍 表1 实名认证详细介绍 账号类型 认证类型(任选一种类型)
获取示例数据 本示例中使用小分子化合物SMILES结构式文件和蛋白3D结构PDB文件作为输入数据,可通过如下方式获取。 登录医疗智能体平台,在“资产市场”中订阅“docking summary测试数据”至所需的项目中。 图1 示例数据 父主题: 新型冠状病毒(COVID-19)虚拟药物筛选
查询镜像 使用health docker images命令查询项目中的镜像。 命令结构 health docker images [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --name -n 否 查询指定镜像名下的所有tag信息,支持模糊查找。 --type -t
更新项目 使用update或edit命令更新项目描述信息、标签或状态。 命令结构 health update project <project-name> [flags] 或 health edit project <project-name> [flags] 表1 参数说明 参数
配额管理 为防止资源滥用,平台限定了各服务资源的配额,对用户的资源数量和容量做了限制。如果当前资源配额限制无法满足使用需要,您可以联系技术支持工程师申请扩大配额。 怎么查看我的配额 在平台右上角用户名中选择“配额管理”,查看配额。 图1 配额管理 父主题: 用户指南(基因平台)
数组长度:0 - 64 io_acc_id 否 String 作业使用的IO加速实例id,不填表示不使用 最小长度:0 最大长度:128 io_acc_expected_usage 否 Integer 作业使用的SFS-Turbo实例预期占用存储量,单位G,用于投递作业时评估当前加速实例余量是否充足
中的文件或文件夹。 文件或文件夹删除完成后,需单击右上角的刷新按钮刷新页面,清除缓存文件。 图4 删除 使用Notebook Terminal功能 对于习惯编码的开发者可以使用Terminal功能进行开发、调试和运行分析任务。 在“Files”页签下,单击右上角“Open Jup
最大长度:2000 响应参数 状态码: 202 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 数据作业ID 请求示例 复制项目数据,使用覆盖模式,复制到目标目录为test。 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{
1],单个标签最大长度63字符 最小长度:1 最大长度:63 数组长度:0 - 1 io_acc_id 否 String 自动作业使用的IO加速实例id,不填表示不使用 最小长度:0 最大长度:128 tasks 否 Array of JobTaskDto objects 自动作业依赖的流程信息
等工作,只需聚焦于科研工作,从而加快科研进展。 关于Jupyter Notebook的详细操作指导,请参见Jupyter Notebook使用文档。 支持的AI引擎 Notebook提供的AI引擎是Python 3,适配CPU/GPU芯片。 父主题: 开发环境(Notebook)
上传镜像前,您需要安装容器引擎并完成镜像的制作,详细操作请参考安装容器引擎、制作Docker镜像。如果您已经安装了容器引擎,请跳过该步骤。 下载命令行工具并进行初始化配置。 使用health switch project命令进入到所需的项目中。 # 命令结构 health switch project <project-name>
约束限制 当前Nextflow相关特性仅为公测版本,部分功能暂不支持,因此存在如下限制约束。 流程使用的镜像和数据需要按照医疗智能体(EIHealth)平台的规范进行上传 推荐通过eihealth-toolkit进行上传。eihealth-toolkit介绍详见什么是医疗智能体e