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HPC断点续算计算方案 操作场景 在HPC领域很多应用本身是支持断点续算功能的,例如LAMMPS, GROMACS。同时HPC常用的调度软件也对断点续算有集成支持,如PBS、Slurm与LSF等。 本节以LAMMPS为例,介绍如何在HPC进行断点续算。 步骤1 安装FFTW 依次执行以下命令,安装FFTW软件。
社区OpenMPI 操作场景 本节指导用户安装和使用社区OpenMPI(以3.1.1版本的OpenMPI为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 安装HPC-X工具套件。 下载需要的HPC-X工具套件以及OpenMPI。 使用社区OpenMPI时,需要同时使用Mellanox的HPC-X
配置ECS集群互相免密登录 操作场景 该任务指导用户在ECS集群上进行相关设置,并使其可以相互免密登录。仅支持在使用密钥登录弹性云服务器的情况下配置ECS集群互相免密登录。 背景信息 $:表示在普通用户下,执行相关操作。 #:表示在管理员用户下,执行相关操作。 普通用户切换至管理员用户,请使用命令sudo
附录 常见问题 主要概念 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
Spectrum MPI 操作场景 本节指导用户安装和使用IBM Spectrum MPI(以IBM Spectrum MPI v10.1为例)。 其中,IBM Spectrum MPI v10.1版本当前支持的操作系统列表如下: IBM Spectrum MPI 10.1.0.1
基于STAR-CCM+部署HPC集群 方案概述 资源和成本规划 STAR-CCM+部署HPC集群流程图 实施步骤 附录 父主题: 弹性云服务器场景最佳实践
集群创建任务提交失败,提示“Insufficient EIP quota”怎么办? 问题描述 集群创建任务提交失败,提示“Insufficient EIP quota”。 处理方法 您可以选择以下任一处理方法: EIP配额不足,创建集群时“弹性公网IP”可选择“使用已有”项。 E
实施步骤 创建HPC私有镜像 创建弹性云服务器 配置节点互信 创建SFS Turbo 挂载共享目录 通讯录安装 MPI安装 STAR-CCM+安装与运行 父主题: 基于STAR-CCM+部署HPC集群
安装和使用MPI(X86 BMS场景) 该任务指导以CentOS7.3的OS为例在单节点上运行MPI应用。 裸金属服务器场景支持使用的MPI 安装和使用IB驱动自带的Open MPI 安装和使用社区OpenMPI 安装和使用Spectrum MPI 安装和使用Intel MPI 安装和使用Platform
方案概述 方案应用 HPC提供了超高浮点计算能力解决方案,可用于解决计算密集型、海量数据处理等业务的计算需求,如科学研究、气象预报、计算模拟、军事研究、CAD/CAE、生物制药、基因测序、图像处理等,缩短需要的大量计算时间,提高计算精度。 方案架构 方案优势 降低TCO 可以按需
在HPC集群上运行MPI应用 在HPC集群上运行IB驱动自带的OpenMPI 在HPC集群上运行社区OpenMPI 在HPC集群上运行Spectrum MPI 在HPC集群上运行Intel MPI 在HPC集群上运行Platform MPI 父主题: 弹性云服务器场景典型应用
主要概念 RDMA RoCE 父主题: 附录
IB驱动自带的OpenMPI 操作场景 本节指导用户安装和使用IB驱动自带的OpenMPI(以版本3.0.0rc6为例)。 前提条件 已配置弹性云服务器免密登录。 操作步骤 检查是否已安装IB驱动。 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 执行以下命令,切换为root
资源和成本规划 所需资源如表1所示,具体资源的实际费用请以对应官网价格显示为准。 表1 资源和成本规划 序号 资源 资源说明 获取路径 数量 费用 1 STAR-CCM+ 使用STAR-CCM+15.02版本。 建议从官方网站获取 1 以官网显示价格为准。 2 MPI(可选) Plateform
常见问题 RoCE网络问题 STAR-CCM+启动相关问题 父主题: 附录
RDMA RDMA概念 远程直接内存访问(即Remote Direct Memory Access)是一种直接内存访问技术,它将数据直接从一台计算机的内存传输到另一台计算机,无需尤其是面对高性能计算HPC、大数据分析和浪涌型IO高并发、低时延应用,现有TCP/IP软硬件架构和应用
安装和使用MPICH 操作场景 本节指导用户在鲲鹏BMS集群上安装和使用MPICH应用(以版本mpich-3.3.2为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 前提条件 已配置BMS集群间互相免密登录。 操作步骤 安装MPICH。 下载MPICH。 下载地址:https://aur
RoCE RoCE概念 RDMA over Converged Ethernet (RoCE)是一种网络协议,允许应用通过以太网实现远程内存访问。目前RoCE有两个协议版本,v1和v2。其中RoCE v1是一种链路层协议,允许在同一个广播域下的任意两台主机直接访问。而RoCE v
挂载共享目录 安装软件 yum install nfs-utils 挂载SFS Turbo 将SFS Turbo挂载到/opt/Siemens目录 mkdir /opt/Siemens # 在/etc/fstab中添加开启自动挂载 echo "192.168.0.15:/ /opt/Siemens
MPI安装 Platform MPI安装 PlatformMPI使用STAR-CCM+自带的,不需要安装。 OpenMPI安装(可选) 若使用STAR-CCM+自带的,可不用安装。 cd /root tar zxvf openmpi-4.0.1.tar.gz cd openmpi-4