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步骤5:获取分析结果 在“作业”列表中,可单击作业名称查看作业信息和输入输出数据。 图8 查看作业信息 单击输出路径,可跳转至输出文件位置。html文件支持在线预览,zip文件可下载至本地查看。 图9 输出数据 图10 预览html文件 图11 获取zip文件 父主题: 运行作业
3分钟创建一个游戏类容器应用 3分钟创建一个游戏类容器应用 3分钟创建一个游戏类容器应用 06 API EIHealth提供API用于对平台资源进行操作和二次开发。 API文档 API概览 创建容器应用基本流程 快速创建一个kubernetes集群 3分钟创建一个游戏类容器应用 3分钟创建一个游戏类容器应用
your-job -n your-instance # 返回结果如下 { "kind": "Pod", "apiVersion": "v1", "metadata": { ... } 获取事件 health get task
联系技术支持开通白名单。 需要提供账号名,账号ID,项目ID等信息。相关信息获取方式如下: 使用华为云账号登录后,在右上角账号下选择“我的凭证”。 在API凭证中可以查看相关信息。 购买服务 盘古辅助制药平台提供包年包月、按需两种计费方式,您可以按需求进行选择。 关于计费模式的详细介绍,请参见计费说明。
在本地编写模板,模板中的参数与在EIHealth平台启动作业过程一致。模板修改好后,再使用命令行工具上传模板,启动分析作业。 # 详情说明可参考API文档中作业管理-创建作业 job: name: demo-job
在本地编写模板,模板中的参数与在EIHealth平台新建流程过程一致。 修改yaml模板时,详细的命令和参数请参见流程配置文件说明。 # 详情说明可参考API文档中流程管理- 创建流程 workflow: id:
在本地编写模板,模板中的参数与在EIHealth平台新建应用过程一致。 修改yaml模板时,详细的命令和参数请参见应用配置文件说明。 # 详情说明可参考API文档中应用管理-创建应用 app: id: '' # 应用id
在本地编写模板,模板填写好后,再使用命令行工具上传模板,创建流程。示例流程由app1和app2两个应用构成,通过指定输入、输出关系链接两个应用。 # 详情说明可参考API文档中流程管理- 创建流程 workflow: name: 'demo-workflow'
修改模板时,需填写镜像地址,获取方法请参见获取镜像地址。镜像制作和上传方法请参见镜像管理和创建FastQC应用样例。 # 详情说明可参考API文档中应用管理-创建应用 app: name: 'demo-app' # 应用名称
在本地编写模板,模板中的参数与在EIHealth平台创建作业过程一致。 修改yaml模板时,详细的命令和参数请参见作业配置文件说明。 # 详情说明可参考API文档中作业管理-创建作业 job: name: demo-job
设置靶点口袋发现文件 查看靶点口袋发现结果。 单击作业名称,在输出结果页面,可以单击“查看轨迹”,下载运动轨迹。可以单击”下游分析”,将发现的口袋作为对接口袋进行分子对接。也可以在右边口袋列表中查看口袋信息。 图2 查看靶点口袋发现结果 图3 查看靶点口袋发现运动轨迹 查看2D相互作用图。 在
最多可添加2个靶点。 如果不需要设置靶点,此步骤可以进行省略,如果设置了靶点,作业运行时间会加长。 通过“靶点设置”上传靶点,并且设置对接口袋。 此处靶点设置为可选参数,如果选择靶点设置,可以将对接活性作为一个约束条件进行分子生成。靶点1对应的约束条件是target1_bind
时间会加长。 图3 靶点设置 图4 Target1设置 图5 Target2设置 图6 靶点设置完成 通过“靶点设置”上传靶点,并且设置对接口袋。 此处靶点设置为可选参数,如果选择靶点设置,可以将对接活性作为一个约束条件进行分子优化。靶点1对应的约束条件是target1_bind