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048。 图2 靶点配置选择文件 输入PDB ID,最多输入100个PDB ID,用逗号或换行方式隔开;不区分大小写;如果输入多聚体靶点,仅解析第一条链;每个靶点的氨基酸序列长度不超过2048。 图3 靶点配置输入PDB ID 在配置页面输入分子信息,及配置相关参数。 输入方式:支持绘制分子、选择文件、手动输入。
获取项目ID、项目、账号信息 项目ID、项目名称、账号名(domain name)、账号id(domain id)可登录控制台“我的凭证”页面获取。 父主题: 认证信息
关键概念 盘古药物分子大模型 盘古药物分子大模型是基于华为与中科院上海药物所共同研发、专门面向药物研发领域推出的预训练大模型,旨在帮助医药公司开启AI辅助药物研发的新模式。盘古药物分子大模型学习了17亿个药物分子的化学结构,模型参数上亿,是目前最大的小分子药物模型。华为盘古药物分子大模型
基本概念 盘古药物分子大模型 盘古药物分子大模型是基于华为与中科院上海药物所共同研发、专门面向药物研发领域推出的预训练大模型,旨在帮助医药公司开启AI辅助药物研发的新模式。盘古药物分子大模型学习了17亿个药物分子的化学结构,模型参数上亿,是目前最大的小分子药物模型。华为盘古药物分子大模型
az String 可用区 cpu_detail String CPU物理规格描述信息 disk_detail String 磁盘物理规格描述信息 memory_detail String 内存物理规格描述信息 netcard_detail String 网卡物理规格描述信息 cpu_arch
提供多种AI引擎切换。 应用、流程支持X86、ARM运行。 消息中心:支持异步任务提示。 商用 项目管理 预置流程 数据管理 工具管理 分析作业管理 开发环境 2020年8月 序号 功能名称 功能描述 阶段 相关文档 1 医疗智能体EIHealth平台上线 基于华为云AI和大数据
基因组分析 提供从基因组数据管理、生物信息分析流程到科研分析管理整个流程的服务,快速实现基因组数据分析及AI建模,提供高性能、高可靠性、高性价比的基因测序计算、存储、分析和AI能力支持,让科研过程标准化、可执行。 基因组测序是新型冠状病毒疑似病例确诊的病原学证据之一,基于基因组分
"password": "**********", "domain": { "name": "domainname" } } } }, "scope":
"update_time": "2022-06-30T11:25:53Z", "failed_message": "pod failed for:Unschedulable, message:0/2 nodes are available: 2 Insufficient cpu.", "events":
合成路径规划 合成路径规划基于盘古药物分子大模型,根据给定的目标分子,可以设计出完整且合理的合成路径。 单击“合成路径规划”功能卡片,进入配置页面。 在配置页面,可以在左侧绘制分子,也可以通过上传分子文件方式上传分子或者在白框内输入小分子SMILES表达式。 上传分子文件:支持SDF、MOL2、PDB、SMI格式文件。
流程创建成功后,您可以对流程进行编辑,删除操作。 编辑 选择已创建成功的流程,单击操作列的“编辑”,进入流程编辑页面。除了流程名称不能更改,您可以修改已有流程的其他参数配置项。 删除 通过单击操作列“删除”,可删除对应的流程。 下载流程文件 单击流程名称,进入流程详情页面,单击流程文件后的“下载”,可下载该流程文件。
在“功能模块”页面,选择对应的模块,单击“立即使用”。 在具体的功能模块页面,配置相关参数信息。具体参考功能模块章节。 通过“作业中心”页面创建 新建作业 单击“新建”,在新建作业页面选择对应的模块。 图1 新建作业 单击“确定”,在对应的模块页面配置详细信息,具体请参考功能模块。 克隆作业 克隆已有的作
安装/卸载Nextflow 安装Nextflow Nextflow需要用户自己进行安装,安装的权限只有管理员拥有。 在平台右上角用户名中选择“系统设置”。 在“Nextflow配置”模块,单击“安装”。 图1 安装Nextflow 选择安装方式。目前支持GitHub获取和上传安装包两种方式。
情况,直至购买了计算资源或者任务超时才会停止。 单击平台右上角的账号名称,会出现账号的相关操作,包括系统资源,系统配置等。注意这里只有管理员账号有系统资源,系统配置等操作,具体说明请参见用户管理。 图1 系统资源 父主题: 购买计算资源(主账号操作)
图1 设置靶点优化配置页面 单击“下一步”,配置靶点优化配置参数。 MD引擎:仅支持GROMACS。 时间步长:MD模拟的时间步长,范围支持0<时间步长≤5fs,默认是2fs。 温度:MD模拟的温度,范围支持0<温度≤1000K,默认是300K。 配置MD的计算步骤 Energy
构相似的化合物聚成一类,从而找到有效骨架 ,辅助苗头化合物发现。 单击“功能模块 > 通用工具 > 聚类分析”功能卡片,进入配置页面。 图1 聚类分析配置页面 输入方式:选择文件和手动输入类型。 上传分子文件:选择可上传的分子文件。分子文件支持SMI格式文件;文件大小不超过5G;小分子支持10-10
创建项目 新用户进入平台后需要自己创建项目,单击“创建项目”按钮,填写项目名称以及选择对应的数据保护策略,数据保护策略参考下面配置。 图1 创建项目 单击项目名称可进入到对应的项目中。 图2 进入项目
导出作业 使用export命令导出作业信息。 导出的作业信息会以zip文件格式保存到当前目录,zip文件中包含以下两个文件: jobDetails.zip:保存job的yaml文件 jobInfo.csv:保存job信息 命令结构 # 使用job-id导出作业 health export
add_nodes_for_mem_rule 否 Integer 满足扩容策略中mem分配率时增加的节点数 最小值:1 最大值:50 响应参数 无 请求示例 更新扩容策略配置,更改名称为strategy_4vCPUS_8GB https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.c
排查思路、解决方法请参考查看执行结果章节的说明。 场景4 参数配置的不合理导致的作业执行失败。 解决方法 选择运行失败的分析作业,单击操作列“更多>重试”。 在弹出的提示框中选择“更改参数”。 图6 更改参数 在作业配置页面,修改相关参数后,单击页面右上角的“重试作业”。 图7 重试作业