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a/目录进行归档，a/目录下最深一级的文件 a/xxxx/xxx./.../obj的总长度不能超过987。 执行归档操作时，若包含禁止删除的文件或文件夹，并打开了删除原数据开关，则被设置为禁止删除的文件或文件夹会删除失败，其他文件或文件夹删除正常。 使用obsutil上传数据，必须加full
获取Windows版本的命令行工具，得到health.exe文件，health文件无需安装，放置在任一文件夹中即可。 图1 下载命令行工具 使用win键+R，输入cmd打开windows的cmd窗口。进入工具所在的目录，输入health命令，即可使用。 如果cmd窗口显示目录不是health文件所在目录，请使用cd命令切换路径。例如，切换至D盘：
本示例中以Windows系统为例，介绍安装命令行工具的方法。 获取Windows版本的命令行工具，得到health.exe文件，health文件无需安装，放置在任一文件夹中即可。例如，放到C盘Users文件夹中。 图1 下载命令行工具 使用键盘win键+R，输入cmd，并单击“确定”打开windows的cmd窗口。
pdbqt：将配体的sdf文件转换为pdbqt文件。 task-2-ligand smiles to 3dsdf：将配体的smiles文件转换为3dsdf文件。 task-3-receptor pdb to pdbqt：将受体的pdb文件转换为pdbqt文件。 task-4-qvina-w：分子对接。
数据上传下载请参见数据的上传和下载。 对于非挂载目录以外的目录下的文件，重启Notebook后会消失。例如，上传文件至Notebook的根目录下，该文件并不在被挂载的obs路径中，重启Notebook，该文件会消失。 图3 Upload上传数据 父主题： 资产市场
成“.health”文件夹，文件夹中包含config.ini配置文件，用于存储任务执行所涉及到的配置，如密钥、区域、当前项目等信息。 生成的配置文件不建议直接修改，如需改动请使用命令行工具修改。 配置文件中保存有用户的AK、SK信息，为了避免密钥泄露，会对文件中的SK进行加密以保护密钥安全。
模板名称，带此参数时会覆盖yaml文件里面的模板名称。 --description -d 否 描述，带此参数时会覆盖yaml文件里面的模板描述。 --yaml -y 是 本地模板yaml文件。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以
fastq目录，包含待分析的fastq格式的文件。 fastq-extend string fastq文件后缀<extend>，适配不同的后缀。 read-cmd string 读取输入文件时使用的命令，如读取.gz文件使用zcat，文本文件使用cat。 para-str string
-w 否 本地workflow文件路径，可以是zip或nf文件。 --description -d 否 workflow的详细描述信息。 --labels -l 否 流程标签列表，用","分割，如"a,b,c"。 --main_file -m 否 流程主文件名。 --params -p
source String 文件来源，支持用户私有数据中心、公共数据和源数据。 最小长度：1 最大长度：8 url String 文件URL，用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 format String 文件格式，支持PDB、SD
receptors Array of DockingReceptorDto objects 受体文件列表。 数组长度：1 - 20 ligands Array of LigandDto objects 配体文件列表，当前仅支持1个。 数组长度：1 - 1 engine String 引擎，支持
RESIDUES receptor_file 是 ReceptorDrugFileReq object 受体文件。 ligand_file 否 DrugFile object 配体文件。 residues 否 Array of strings 残基列表，当识别模式为残基时提供。 最小长度：4
数据库文件来源。 枚举值： public private url 是 String 文件URL，用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度：1 最大长度：2000 eihealth_project_id 否 String 数据库文件所在项目id，仅文件为数据中心时填写。
差异计算方法：RMSD、EMD。 枚举值： RMSD EMD file 是 DrugFile object 配体文件。 ref_file 是 DrugFile object 参考的配体文件。 表4 DrugFile 参数 是否必选 参数类型 描述 source 是 String 受体的数据
构建数据库。 数据文件：输入数据库文件，仅支持CSV格式，文件不大于1G，数据条数支持最多5,000,000条，超过5,000,000条将进行截取。文件必须有两列是“SMILES”、“NAME”，不区分大小写。文件不允许有中文，数据库小分子会自动去重。 数据文件列名：选择数据库列
EditedLigand 参数 参数类型 描述 source String 文件来源，仅支持RAW。 最小长度：1 最大长度：6 format String 文件格式，仅支持CIF。 最小长度：1 最大长度：6 data String 文件原始数据，仅数据源为RAW时提供。 最小长度：0 最大长度：10000000
-l 否 标签，多个标签使用;符号分隔开。 --nodeLabels -n 否 用于让应用调度到设置了该标签的节点上。 标签数量取值范围[0,1]。单个标签最大长度为63字符，必须以health.开头。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 如
是否必选 参数类型 描述 file 否 File 文件流对象 part_number 否 Integer 分段序号，表示第几个文件片段 最小值：1 最大值：128 缺省值：1 total_part 否 Integer 分段总数，上传的文件总共分成了几个片段 最小值：1 最大值：128
cannot be empty. 检查上传的模板文件内容是否已填写。 400 eihealth.01040005 The template file name extension can only be yaml or yml. 检查文件后缀名是否为yaml或yml。 400 eihealth
stat <obj> [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 obj 不涉及 是 查看的文件、文件夹对象。 注意： 如果为引用数据，必须要使用绝对路径（文件夹最后要加/）。未引用的数据不能查看。 --bf -b 附加参数，可选 设置是否以人方便阅读方式输出结果。
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