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--name -n 是 流程名称。 --description -d 否 workflow的详细描述信息。 --labels -l 否 流程标签列表。以","分隔,如:"a,b"。 --main_file -m 否 流程主文件名,默认为:main.nf。 --params -p 否
作业的描述,取值范围:输入字符最大长度为255 最小长度:0 最大长度:255 labels Array of strings 作业标签,取值范围[0,5],单个标签最大长度32字符,仅仅包含小写字母或数字或大写字母 priority Integer 作业的优先级,取值范围[0,9],0最低,默认数值0
source String 受体的数据源:外部网络数据(如RCSB在线数据库)、用户私有数据中心、承载租户公共数据(含样例/公共库)。 枚举值: EXTRANET PRIVATE PUBLIC RAW url String 文件URL,当数据源为外部网络数据时为https地址;用户私有数据
取值范围:输入字符最大长度为255 最小长度:0 最大长度:255 labels 否 Array of strings 作业标签,取值范围[0,5],单个标签最大长度32字符,支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线,且不能以空格开头或者结尾。 最小长度:1 最大长度:32 数组长度:0
缺省值:desc sort_key 否 String 排序字段(支持type,create_time) marker 否 String 开始标签 最小长度:0 最大长度:2000 请求参数 表3 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token 是 String
取值范围:输入字符最大长度为255 最小长度:0 最大长度:255 labels 否 Array of strings 作业标签,取值范围[0,5],单个标签最大长度32字符,仅仅包含小写字母或数字或大写字母 最小长度:1 最大长度:32 数组长度:0 - 5 priority 否
本地workflow文件路径,可以是zip或nf文件。 --description -d 否 workflow的详细描述信息。 --labels -l 否 流程标签列表,用","分割,如"a,b,c"。 --main_file -m 否 流程主文件名。 --params -p 否 本地json/yaml格式参数文件路径。
使用AutoGenome镜像 AutoGenome是Notebook镜像,利用AutoML等技术帮助科研工作者在基因组学数据上端到端实现深度学习网络搜索,训练,评估,预测和解释的工具包。 使用AutoGenome镜像的详细步骤如下所示: 步骤1:订阅镜像 步骤2:创建Notebook 步骤3:预览AutoGenome案例
nextflow作业ID。 --name -n 是 作业名称。 --description -d 否 作业的详细描述信息。 --labels -l 否 作业标签列表。以","分隔,如:"a,b"。 --add-command -a 否 作业额外执行的命令,如:--param1 hello。 --params
65535],后续支持markdown文本 最小长度:0 最大长度:65535 labels 否 Array of strings 应用标签 取值范围[0,5],单个标签最大长度32字符,支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线,且不能以空格开头或者结尾。 最小长度:1 最大长度:32 数组长度:0
name String 作业的名称 description String 作业的描述 labels Array of strings 作业标签 priority Integer 作业的优先级,取值范围[0,9],0最低,默认数值0 status String 作业运行状态 has
和中划线(-),只能以数字或字母开头。 最小长度:5 最大长度:64 labels 否 Array of strings 标签,取值范围[0,5],单个标签最大长度32字符,支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线,且不能以空格开头或者结尾。 最小长度:1 最大长度:32 数组长度:0
和中划线(-),只能以数字或字母开头。 最小长度:5 最大长度:64 labels 否 Array of strings 标签,取值范围[0,5],单个标签最大长度32字符,支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线,且不能以空格开头或者结尾。 最小长度:1 最大长度:32 数组长度:0
s。 MD:平衡步骤模拟的时长,范围支持0<时长≤50ns,默认是50ns。 配置作业配置,单击“提交”。 名称:设置作业名称。 标签:设置作业标签。 功能调用消耗:运行一次功能会消耗一次。 图2 设置靶点优化MD配置页面 查看靶点优化结果 单击作业名称,进入作业结果页面,拟时结果根据构象RMSD聚类。
和中划线(-),只能以数字或字母开头。 最小长度:5 最大长度:64 labels 否 Array of strings 标签,取值范围[0,5],单个标签最大长度32字符,支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线,且不能以空格开头或者结尾。 最小长度:1 最大长度:32 数组长度:0
径(文件夹需要存在)。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 --label -l 否 根据label标签搜索workflow 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。
65535],后续支持markdown文本 最小长度:0 最大长度:65535 labels 否 Array of strings 应用标签 取值范围[0,5],单个标签最大长度32字符,支持中文、字母、数字、空格、下划线和中划线,且不能以空格开头或者结尾。 最小长度:1 最大长度:32 数组长度:0
按键盘Esc键,并执行:wq保存退出Dockerfile。 执行docker build -t image:tag .命令,自动完成镜像制作。 命令中image为镜像名称,tag为镜像标签,名称可自定义。 详细镜像制作过程请参见制作Docker镜像和Dockerfile参考。 上传镜像。
图3 购买EIHealth平台 根据实际需求选择计费方式。 图4 选择计费方式 区域:请就近选择靠近您业务的区域,可减少网络延迟,提高访问速度。不同区域云服务产品之间内网互不相通。 平台规格:选择“基因平台”或“药物平台”。 平台计费方式:选择“包年包月”或“按需”计费。 购买时长:
app_resource TaskResourceDto object 应用资源 app_node_labels Array of strings 计算节点标签 表5 TaskResourceDto 参数 参数类型 描述 cpu String cpu申请使用量,取值范围[0.1-128],单位C,