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导出作业 - 医疗智能体 EIHealth
未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。
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获取流程详情 - 医疗智能体 EIHealth
对于应用,不填默认0;对于流程和作业,不填默认使用前一级的配置,填值会覆盖更新。
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删除镜像标签 - 医疗智能体 EIHealth
未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 假设当前所在项目为lmx-project-01,命令及返回结果示例: 删除其他项目lmx-project-02的导入镜像tag。
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导入应用 - 医疗智能体 EIHealth
未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。 从源项目lmx-project-01导入应用,并重命名应用。
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获取项目ID - 医疗智能体 EIHealth
响应示例如下,例如EIHealth部署的区域为"cn-north-4",响应消息体中查找“name”为"cn-north-4",其中projects下的“id”即为项目ID。
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创建notebook - 医疗智能体 EIHealth
未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。
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修改流程 - 医疗智能体 EIHealth
未填写则使用配置文件中的项目名。 对于可选参数,如果命令中包含了特殊字符,Windows系统下需使用""括起来,Linux系统下需使用''括起来。
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查询自动作业模板 - 医疗智能体 EIHealth
对于应用,不填默认0;对于流程和作业,不填默认使用前一级的配置,填值会覆盖更新。
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修改数据库实例 - 医疗智能体 EIHealth
未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。
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查看执行结果 - 医疗智能体 EIHealth
作业的基本配置信息,以yaml文件导出,包含作业名称,依赖的workflow名称/版本,基本的CPU/Memory配置,输入输出参数等信息。 作业的运行信息,包括每个任务的启动、停止时间、运行状态,日志链接等。
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使用RNA-Seq Analysis Based on STAR流程 - 医疗智能体 EIHealth
当应用也配置了标签,如果应用和作业的计算节点标签在同一计算节点上,则应用调度至该计算节点上;应用和它的作业,不管节点标签是否一致,都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。 如果设置了不存在的计算节点标签,作业会进入等待,直至配置了相应的标签。
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获取notebook信息 - 医疗智能体 EIHealth
未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。
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导入用户 - 医疗智能体 EIHealth
配置完成后,单击“确定”。 等待导入成功后,单击“关闭”。可以在用户管理页面查看导入成功的用户信息。 导入的用户,不支持删除,只支持移除,移除后不影响该用户操作其他服务。
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获取任务实例 - 医疗智能体 EIHealth
未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。
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方式1:使用预置的NGS流程 - 医疗智能体 EIHealth
图11 删除参数 配置好参数后变可以单击右上角“启动作业”按钮进行启动作业,同时会跳转回作业列表。 图12 作业列表 步骤4:查看作业运行状态、获取作业结果 在作业列表中,单击对应的作业名称,可查看作业运行状态,运行时间等信息。
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方式2:使用预置应用搭建NGS流程 - 医疗智能体 EIHealth
配置好参数后,单击右上角“启动作业”按钮启动作业,同时会跳转回作业列表。 图7 作业列表 步骤4:查看作业运行状态、获取作业结果 查看方法与方式1相同。 父主题: 运行作业
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项目管理常用操作 - 医疗智能体 EIHealth
设置项目存储容量 平台支持项目管理员以上角色,配置项目的最大存储量。 单击项目名称,在项目页面选择“设置”。 在项目详情页面,单击“已用存储量”后面的。 图6 设置存储容量 开启容量限制开关后,设置最大存储量。 图7 容量限制 设置成功后,单击“确定”。
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使用Variant Calling Based On NGS流程 - 医疗智能体 EIHealth
当应用也配置了标签,如果应用和作业的计算节点标签在同一计算节点上,则应用调度至该计算节点上;应用和它的作业,不管节点标签是否一致,都会被调度到应用的节点标签所对应的计算节点上。 如果设置了不存在的计算节点标签,作业会进入等待,直至配置了相应的标签。
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导入用户 - 医疗智能体 EIHealth
配置完成后,单击“确定”。 等待导入成功后,单击“关闭”。可以在用户管理页面查看导入成功的用户信息。 导入的用户,不支持删除,只支持移除,移除后不影响该用户操作其他服务。
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修改应用 - 医疗智能体 EIHealth
未填写则使用配置文件中的项目名。 如果同时使用yaml模板和参数命令对描述、标签等参数进行了修改,最终修改结果以参数命令为准。 对于可选参数,如果命令中包含了特殊字符,需使用""括起来。