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最小长度:3 最大长度:32 relative_path 是 String 生成数据库实例的文件相对路径 最小长度:0 最大长度:1024 output_file_type 是 String 生成数据库实例的文件类型。枚举值:csv、txt、vcf 枚举值: txt vcf csv 响应参数
简写 是否必选 说明 ID 不涉及 否 流程ID,指定后获取流程ID对应的流程详情。不指定时,获取的是流程列表。 --param-file -p 否 参数文件保存路径,以yaml格式保存。如果没指定,则不会显示和保存参数信息。 命令示例 health nextflow get workflow
ken。 最小长度:1 最大长度:32768 表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 file 是 ReceptorDrugFileReq object 受体文件。 remove_water 否 Boolean 去除水分子。 缺省值:false remove_ion
String 模型数据文件来源。 枚举值: public private url String 文件URL,用户私有数据中心为项目路径、公共数据场景为obs地址。 最小长度:1 最大长度:2000 eihealth_project_id String 模型文件所在项目id,仅文件为数据中心时填写。
否 Boolean 返回文件内容 缺省值:false 响应参数 状态码: 200 表3 响应Body参数 参数 参数类型 描述 path String 对象全路径(项目名称:/路径) name String 名称 type String 枚举值: FILE FOLDER size
ken的值即为Token。 最小长度:1 最大长度:32768 表3 FormData参数 参数 是否必选 参数类型 描述 file 是 File 模板文件 响应参数 状态码: 201 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 模板id 请求示例 上传模板
删除标签 功能介绍 删除标签 URI DELETE /v1/{project_id}/system/labels/{label_id} 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1
最小长度:1 最大长度:32768 响应参数 状态码: 200 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 count Integer 数据(文件夹、文件)总数量 objects Array of BucketObjectDto objects 数据列表 表5 BucketObjectDto
DrugJobDto object 作业基本信息。 receptor ReceptorDrugFile object 受体文件。 ligand ProbeDrugFile object 探针文件。 params PocketDetectionParamDto object 靶点口袋发现设置参数。 表4
String 作业结果存储目录,不指定则在workflow的工作目录下生产job同名子目录,指定则已指定路径为准;输出路径必须以斜杠(/)开头且不能以斜杠(/)结尾,不能包含两个以上相邻的斜杠(/),不能包含以下特殊字符:\ : ; * ? < " > | 。其中单个文件夹名称不能以中划线(-)开头,不能以英文句号(
生的用量。 购买存储套餐包 在“资源中心>存储资源”页面,购买存储套餐包。 根据需求,选择套餐包类型,单击套餐包右下角的,进行支付。 或者单击右上角“更多”,进入购买存储套餐包页面进行购买。 表1 参数说明 参数 说明 资源包类型 支持标准存储单AZ包。 标准存储单AZ包适合数据分享、内容分享、热点对象应用场景。
流程 选择资产市场中订阅的Docking Summary流程。 配体分子 选择上传的配体小分子文件。 受体蛋白 选择上传的受体蛋白文件夹。这里会默认用文件夹里面所有的蛋白质和配体小分子文件里面的小分子进行一一对接。 超时时间 根据受体配体对个数进行调整,一个受体配体对对接大约需要25s。
mplate详情。 --sample -s 否 显示示例yaml文件内容,以yaml格式打印到控制台,需要直接获取示例文件可使用Linux输出流重定向。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealt
启动作业 功能描述 通过引用本地参数文件,启动nextflow作业。 命令结构 health nextflow create job [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --workflow-id -w 是 nextflow作业ID。 --name -n 是
批量删除标签 功能介绍 批量删除标签 URI POST /v1/{project_id}/system/labels/batch-delete 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1
receptors Array of DockingReceptorDto objects 受体文件列表。 数组长度:1 - 20 ligands Array of LigandDto objects 配体文件列表,当前仅支持1个。 数组长度:1 - 1 engine String 引擎。 job_result
作业投递后运行失败,日志显示File name too long。 图12 运行出错的应用日志 排查思路 检查输入文件的路径单级名称长度是否超过255个字符。若单级名称长度未超过255个字符请联系技术支持。 解决方案 单级目录名称长度超过255个字符。 不使用SFS或者EVS加速。 若必
修改权限 修改目录、文件权限。 命令结构 health chattri [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --path -p 附加参数,可选。 修改权限的目录或文件绝对路径。 --delete-policy -d 附加参数,可选。 设置目录或文件是否允许删除。取值包括:allow、deny。
在部署容器化应用时可以指定镜像。例如一个Docker镜像可以包含一个完整的Ubuntu操作系统环境,里面仅安装了用户需要的应用程序及其依赖文件。EIHealth平台使用容器镜像服务(Software Repository for Container,简称SWR)进行简单易用、安全可靠的镜像管理。
获取系统资源 使用get命令获取购买的计算资源、性能加速资源、数据库资源、存储资源列表。 命令结构 health get resource [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --type -t 是 名称,支持computing、performance、d