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到本地。可以保存成.yaml或.txt文件,保存为txt文件时,其内容需为yaml格式。 修改作业yaml模板。 在本地编写模板,模板中的参数与在EIHealth平台创建作业过程一致。 修改yaml模板时,详细的命令和参数请参见作业配置文件说明。 # 详情说明可参考API文档中作业管理-创建作业
000000,yyyyMM等价于yyyyMM01000000。 使用“*-time2”,代表匹配最后修改时间在time2之前的所有文件。 使用“time1-*”,代表匹配最后修改时间time1之后的所有文件。 同步上传文件夹时该参数可选。 --mf -m 否 设置名称匹配模式(i
mirror。您可以在容器中执行如下命令,查看PyPi Mirror。如果您想用其他PyPi Mirror,可将命令中的index-url参数修改为您需要的PyPi mirror。 cat /root/.pip/pip.conf.product [global] index-url =
是 String 流程名称,取值范围[1,56],允许大小写字母、数字、以及特殊字符中划线(-)和下划线(_)。更新流程时,流程名称不支持修改。 最小长度:1 最大长度:56 description 否 String 流程描述 取值范围[0,65535] 最小长度:0 最大长度:65535
)。更新流程时,流程名称不支持修改。 最小长度:1 最大长度:56 version 是 String 流程版本,取值范围[1,24],以小写字母或数字或大写字母开头,允许出现中划线,必须以小写字母或数字或大写字母结尾。更新流程时,流程版本不支持修改。 最小长度:1 最大长度:24
)。更新流程时,流程名称不支持修改。 最小长度:1 最大长度:56 version 是 String 流程版本,取值范围[1,24],以小写字母或数字或大写字母开头,允许出现中划线,必须以小写字母或数字或大写字母结尾。更新流程时,流程版本不支持修改。 最小长度:1 最大长度:24
参考用户指南中的项目成员和权限。 图2 复制数据 引用数据 引用数据可以引用其他项目中或对应的obs桶的数据。引用的数据不能在该项目中进行更改。只能用来运行作业,导入数据到数据库等操作。 图3 引用数据 URL导入数据 以URL导入的方式添加数据类似于linux中的wget操作。
增量下载操作,设置该参数后,下载每个文件时会比对本地的文件,仅在以下情况时下载数据: 文件不存在。 下待载文件大小与本地文件大小不一致。 文件的最后修改时间不一致。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。
health”文件夹,文件夹中包含config.ini配置文件,用于存储任务执行所涉及到的配置,如密钥、区域、当前项目等信息。 生成的配置文件不建议直接修改,如需改动请使用命令行工具修改。 配置文件中保存有用户的AK、SK信息,为了避免密钥泄露,会对文件中的SK进行加密以保护密钥安全。 初始化配置时,如果命令
增量上传操作,设置该参数后上传每个文件时会比对平台数据路径中的文件,仅在以下情况时上传数据: 文件不存在。 待上传文件大小与平台文件大小不一致。 文件的最后修改时间不一致。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程,Linux和macOS环境使用方法基本相同,可参考。
设置完成后,单击“提交”,执行药物虚拟筛选任务。 对于“运行中”的任务,单击图标,允许取消、强制停止或删除。 对于“已取消”、“运行失败”的任务,单击图标,允许修改任务参数,再次提交任务。 图5 运行状态 查看执行结果 药物和蛋白结合能通过热点图呈现,并统计出结合能的均值和标准差。单击热点图,可查看详
eihealth.01020040 The core project can not change to non-core project. 核心项目不可修改为非核心项目。 400 eihealth.01020042 The storage capacity limit must not be less
表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 tasks 是 Array of JobTaskDto objects 步骤的参数修改信息 数组长度:0 - 64 表4 JobTaskDto 参数 是否必选 参数类型 描述 task_name 是 String 子任务实际名称,取值范围[1
在用户的操作列,单击“移除”,移除对应的用户。 图2 移除子用户 安全设置 在用户管理页面,可以重置用户的邮箱、手机号以及系统管理员权限的更改。在用户操作列,单击“编辑”,重置用户的相关信息。 最终租户可以编辑子用户角色、手机号、邮箱。 系统管理员只能编辑角色,非系统管理员无编辑权限。
yaml或.txt文件,保存为txt文件时,其内容需为yaml格式。 在本地编写模板,模板中的参数与在EIHealth平台启动作业过程一致。模板修改好后,再使用命令行工具上传模板,启动分析作业。 # 详情说明可参考API文档中作业管理-创建作业 job: name: demo-job
mirror。您可以在容器中执行如下命令,查看PyPi Mirror。如果您想用其他PyPi Mirror,可将命令中的index-url参数修改为您需要的PyPi mirror。 cat /root/.pip/pip.conf.product [global] index-url =
的动作和状态,单击图标,展开“事件”。 图1 作业详情 如果作业显示运行正常,但实际作业中的某一个应用运行失败,请检查输入数据是否正常,并修改算法程序入口的main函数,保证运行结果有显式的返回值。 故障说明 作业运行时,每个应用称之为一个任务(Task)。部分场景下,任务输入数
是否删除原数据。如果选择删除原数据,系统会在归档完成后统一删除已归档数据。归档后的数据可在归档中心查看或恢复。 在归档过程中请不要对归档的文件或者文件夹进行添加、更改操作,以免造成您的数据损失。 选择归档数据 选择该项目下需要归档的数据。 单击“确认”,进行归档。 归档操作将记录在“归档”页面,您可以在
选择某些残基来作为口袋位置。 自动预测 如果受体口袋位置未知,可以使用自动预测软件来进行口袋位置预测。 全局对接 将整个受体作为口袋位置。 自定义 手动修改口袋位置和大小。 padding 口袋位置放大多少尺寸。 配置成功后,单击“提交”。 查看分子对接结果。 如果是多受体对多配体,打开作业结
应用版本 取值范围:[1,24],以小写字母或数字或大写字母开头,允许出现中划线,必须以小写字母或数字或大写字母结尾。更新应用时,应用版本不支持修改。 最小长度:1 最大长度:24 summary 否 String 应用简述 取值范围[0,128] 最小长度:0 最大长度:128 description