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设置picard-insertsize输入数据 若是想查看已经设置好的参数，可以按照下图步骤进行查看，同时若发现指定的参数有问题，也可再此处进行删除参数。 图11 删除参数 配置好参数后变可以单击右上角“启动作业”按钮进行启动作业，同时会跳转回作业列表。 图12 作业列表 步骤4：查看作业运行状态、获取作业结果 在
网络下载链接对应的md5列表，值用; 分隔，和网络数据链接一一对应。值用于下载完后对文件进行md5校验。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。
CANCELLED lmx-test-01 2021-02-01 11:11:27 lmx-database-01 data DATABASE_IMPORT xxx PROCESSING lmx-test-01 2021-02-01
分子SMILES表达式。 最小长度：1 最大长度：512 params SynthesisParamDto object 合成路径规划作业配置。 表4 DrugJobDto 参数 参数类型 描述 id String 作业id。 name String 作业的名称，取值范围：[1,
快照方式制作镜像（偶尔制作的镜像）：在基础镜像上，比如Ubuntu，先登录镜像系统并安装Docker软件，然后整体制作快照，即可得到所需软件的Docker镜像。 Dockerfile方式制作镜像（经常更新的镜像）：将软件安装的流程写成DockerFile，使用Docker build构建成Docker镜像。
有不同的版本和软件包，安装、使用过程复杂。将生物信息学软件封装成Docker镜像，可以使程序在不同的环境中运行，并通过EIHealth平台的镜像管理，实现高效的调用，极大方便了软件的安装和运行。 Docker镜像是一个模板，是容器应用打包的标准格式，在部署容器化应用时可以指定镜像
修改为空，实际作业输出结果依然默认存在该路径。最终输出结果路径按照“流程输出路径/作业名称-UUID/Task输出路径/应用输出路径”规则生成。 单击界面上方按钮，保存流程。并提示“流程保存成功”。 创建好的流程，将显示在流程列表中。 父主题： 工具管理
Summary 对一组小分子化合物配体和一组蛋白受体进行分子对接，汇总分子对接结果，用于可视化展示。 该流程主要完成的功能包括：整合分子对接结果，生成结合能矩阵、整合受体与分子对接产生的配体构象，进行可视化展示、对配体分子进行注释，包括：DrugBank编号、分类、化学式、XLOGP3、
有不同的版本和软件包，安装、使用过程复杂。将生物信息学软件封装成Docker镜像，可以使程序在不同的环境中运行，并通过EIHealth平台的镜像管理，实现高效的调用，极大方便了软件的安装和运行。 Docker镜像是一个模板，是容器应用打包的标准格式，在部署容器化应用时可以指定镜像
最小长度：1 最大长度：1024 scaffold String 分子骨架表达式。 最小长度：1 最大长度：1024 top_n Integer 生成分子数量。 最小值：0 最大值：1000 databases Array of strings 可供搜索分子的公共数据库名称列表。 最小长度：1
--downloadPath -d 否 获取应用详情时，将内容下载到的指定文件夹路径（文件夹需要存在）。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 --label -l 否 根据label标签搜索应用。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-tool
请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 smiles 是 String 分子SMILES表达式 num_trials 否 Integer 生成分子数量 strong_constraints 否 Array of MoleculeConstraint objects 强约束集合 weak_constraints
[flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 --type -t 是 名称，支持computing、performance、database、storage，分别代表计算资源、性能加速资源、数据库资源和存储资源。 --action -a 否 查询计算节点方式。 取值范围：
-b 否 列举结果中字节数的显示格式。取值范围[human-readable, raw]。 如果未设置该参数，则列举结果中字节数的显示格式由配置文件中的humanReadableFormat参数决定。 --format -F 否 指定以自定义格式打印列举结果。当前仅支持值[default]，指定列举结果在一行显示。
导入方式选择“上传”，单击“下载示例文件”下载数据库模板示例，编辑后上传模板文件至平台，单击“确定”。 图2 上传模板 模板示例如下： database: name: demo # 模板名称，必填，长度范围[3,32]，只能包含字
标记镜像 使用health docker tag命令给待上传的镜像打标签。 执行镜像相关命令，请在本地搭建Docker环境，要求安装的容器引擎版本必须为1.11.2及以上。 默认标记到当前所在项目，需先使用切换项目命令进入想要上传镜像的项目。 命令结构 health docker
Nextflow 简介 安装/卸载Nextflow 新建流程 管理流程 新建作业 管理作业 约束限制 作业执行失败排查思路 父主题： 用户指南（基因平台）
导入网络数据。导入网络数据时给予消息提示，导入结果给予消息提示。 SUBSCRIBE_DATA 订阅数据。订阅数据时给予消息提示，订阅结果给予消息提示。 DATABASE_IMPORT 导入数据库。导入数据时给予消息提示，导入结果给予消息提示。 JOB_STATUS 作业状态。作业的状态发生跳变时给予消息提示。
Notebook 如何使用Notebook的Terminal功能 如何将Notebook中的数据下载至本地 如何在Notebook中安装外部库
Notebook常用操作 数据的上传和下载 自定义镜像创建Notebook样例 JupyterLab简介及常用操作 url获取方法 Notebook安装Conda指导 父主题： 用户指南（基因平台）
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