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文件进行md5校验。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 从医疗项目中引用数据 health import
流程。 使用流程 EIHealth提供了个性化分析流程的搭建和管理操作。您可以将生物信息学软件封装为应用，并将其编排调度，形成自定义分析流程。 同时集成了基于开源的Jupyter Notebook，可为您提供在线的开发和调试工具，用于编写和调测模型训练代码。 图1 使用流程 服务声明
如果当前目录为health所在目录，可以使用./health命令使用命令行工具。 如果当前目录不是health所在目录，需要使用绝对路径。如当前目录为/opt，假设health存放在/root/health-toolkit/下，需要指定/root/health-toolkit/health路径进行使用。 如果无法运行，提示Permission
CSS常见问题 如果子用户看不到“CSS资源列表”，需要授权子用户CSS权限。 如果在创建和追加数据库的过程，显示资源不足，需要扩容CSS集群。 若CSS集群显示“不可绑定”。 检查购买的CSS资源状态是不是正常的。 检查购买的CSS资源是不是绑定了公网IP。 已绑定的集群修改了密码或者公网IP。
欢迎使用盘古辅助制药平台 盘古辅助制药平台是以盘古药物大模型为基础打造的一站式药研平台，助力药物研发效率提升60%+。平台提供靶点发现，苗头化合物发现，先导化合物优化全流程药研所需功能。同时基于云原生的软硬件一体化加速，大大提升虚拟筛选和分子动力学模拟计算效率。 全平台无需软硬件
org/10.1021/acs.jcim.0c00821 查看“神农项目”药物筛选结果 登录EIHealth平台，可在“专题”页签中查看“神农项目”药物筛选结果。可参考视频介绍了解详细的使用指导。 在图2中，页面最右侧显示结合能的最大值和最小值，以及对应的列名称、行名称。 单击列
取、删除、恢复归档数据，也可以对数据作业执行获取、删除、重试、取消操作。 数据库管理 您可以使用该工具创建、获取、删除和导入数据库模板，创建、获取和删除数据库实例，也可以引用数据库。 镜像管理 您可以使用该工具对镜像执行标记、上传、下载、查询、导入、更新和删除标签等操作。 应用管理
受体蛋白：受体蛋白文件，支持PDB格式。 图2 选择配体分子和受体蛋白 设置数据库。 数据库功能可以将任务运行过程中产生的数据文件按照模板生成数据库。 数据库名称：数据库的名称。 输出文件格式：可以将流程生成的分子对接结果，保存为.txt、.csv或.vcf格式。使用“Docking Summary”流程时，保存格式为
聚类分析 聚类分析工具可以通过骨架聚类方法，将大型小分子数据库中结构相似的化合物聚成一类，从而找到有效骨架 ，辅助苗头化合物发现。 单击“功能模块 > 通用工具 > 聚类分析”功能卡片，进入配置页面。 图1 聚类分析配置页面 输入方式：选择文件和手动输入类型。 上传分子文件：选择
最大长度：128 template_id 否 String 数据库模板id 最小长度：1 最大长度：128 database_name 是 String 数据库名称 最小长度：3 最大长度：32 relative_path 是 String 生成数据库实例的文件相对路径 最小长度：0 最大长度：1024
test # 返回结果如下 create archive h-test2 successfully! Linux和macOS使用时，多个路径使用;进行分隔，整个路径使用''引起。例如： ./health create archive lmx-test-cli --path 'newjob/;output/'
read-cmd string 读取输入文件时使用的命令，如读取.gz文件使用zcat，文本文件使用cat。 para-str string 对扩展参数的支持，可以不填。 genome-dir directory 输入的参考基因组序列，已经使用STAR构建了index。 sample-name
Source database {0} does not exist. 检查引用的数据库id是否正确。 500 eihealth.01040037 Database service is not available now. Please check the database resource
entational State Transfer）风格API，支持您通过HTTPS请求调用。 调用方法请参见如何调用API。 父主题： 使用前必读
用户管理 用户管理介绍 创建子用户 导入用户 登录平台方式 管理用户 父主题： 用户指南（基因平台）
获取EVS配额及使用情况 功能介绍 获取EVS配额及使用情况 URI GET /v1/{project_id}/system/computing-resources/evs-quota 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID，您可以从获取项目ID中获取。
约束与限制 您能创建的EIHealth资源的数量与配额有关系，具体请参见服务配额。 更详细的限制请参见具体API的说明。 父主题： 使用前必读
获取当前系统配额及资源使用情况 功能介绍 获取当前系统配额及资源使用情况 URI GET /v1/{project_id}/quotas 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID，您可以从获取项目ID中获取。 最小长度：1
template_id String 生成study作业结果的模板id database_name String study作业结果的数据库实例名称 database_id String study作业结果的数据库实例id relative_path String 生成study作业结果的文件的相对路径
在使用Nextflow时，作业运行失败的可能原因 由于Nextflow支持的特殊字符继承了Nextflow原有特性，因此请排查参数值，或者选择的数据名称，或者路径中带的特殊字符是否符合Nextflow原有特性。 建议启动并发作业数最多为8个。 父主题： Nextflow
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