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单击“立即创建”,完成fastqc应用的创建。 创建完成后的应用,将显示在应用列表中,您可以使用该应用创建分析作业。 图5 查看应用 步骤4:搭建流程、运行作业 进入“工具 > 流程”页面,点击“新建流程”进行新建流程,填写好流程名称,流程版本等信息。 图6 新建流程 将fastqc应用拖拽至画布中,并添加输入参数,操作方法请参见方式2。
图2 选择成员 单击“确定”,将用户添加至项目中。 移除、修改项目成员 单击项目名称后面,进入项目设置页。 选择“成员管理”,在“权限”列重新设置项目成员角色。 详细项目成员角色和权限介绍请参见成员角色和权限。 图3 移除、修改项目成员 选中成员,单击操作列“移除”,将成员从项目中移除。
ng|Cancelled|Unknown) tool_name 否 String 作业依赖的组件名称(有可能是Workflow,有可能是app), 取值范围:长度为[1,56],以小写字母开头,允许出现中划线(-)、小写字母和数字,且必须以小写字母或数字结尾。 最小长度:1 最大长度:128
最大长度:128 tag 是 String 镜像版本 最小长度:1 最大长度:64 type 否 String 镜像类型。枚举值:APP、NOTEBOOK 枚举值: APP NOTEBOOK chip_type 否 String 镜像芯片类型。枚举值:X86、ARM 枚举值: X86 ARM
--description -d 否 项目描述。 只有项目所有者和管理员能修改。 --tags -t 否 项目标签,多个标签使用分号(;)分隔。 只有项目所有者和管理员能修改。 --policy -p 否 设置项目级数据权限策略。只有项目所有者能修改。 用数字0和1表示关闭和打开,以data-shar
设置消息清理规则 功能介绍 设置消息清理规则,支持修改记录数(1W-1000W) URI PUT /v1/{project_id}/messages/rules 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。
导入。 在左侧导航栏选择“模板”页签,单击“导入模板”。 导入方式选择“项目”,选择项目名称,勾选需要导入的模板,可以在“导入模板名称”中修改模板名称,单击“确定”。 图1 从其他项目导入模板 平台也提供了yaml格式的数据库模板,您可以在本地编辑完成后上传至平台进行使用,数据库
时填写。 最小长度:1 最大长度:128 响应参数 无 请求示例 数据库追加文件,追加数据为project:/file/test.csv,修改描述为simple database。 https://{endpoint}/v1/{project_id}/drug/drug-database/{database_id}
【可选】单击“镜像类型”,对上传的镜像进行分类。 上传镜像时如果上传命令中未指定镜像类型,新上传的镜像默认显示为“OTHER”,您可以将镜像标记为“APP”或“NOTEBOOK”。 APP:用于创建应用的镜像。 NOTEBOOK:用于创建Notebook的镜像。 为了保证平台业务安全,您在平台内购买的计算资源,将部
String 新密码 最小长度:8 最大长度:32 响应参数 无 请求示例 重置新用户密码,校验码为string,校验方法为string,修改原始密码Original_Password@为New_Password@ https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud
StorageClass: standard ETag: 6c2d85292e26b513c2670998ecf8427e ContentType: application/x-directory Type: folder Metadata: mtime=1661858028 mode=16832
、更新和删除标签等操作。 应用管理 应用是生物信息学软件和运行该软件所依赖的运行环境的镜像封装。 您可以使用该工具创建应用,并进行修改、删除、查询、导入操作。 流程管理 流程包含分析过程中所需应用的执行信息和数据的输入、输出等参数定义,流程至少由一个应用组成。 您可以使用该工具创
作业依赖的组件名称 tool_version String 作业依赖的组件版本 tool_type String 作业依赖的组件类型,取值范围app|workflow 请求示例 无 响应示例 状态码: 200 OK { "auto_jobs" : [ { "id" : "b
999068426240,-1表示无容量限制 最小值:-1 最大值:11258999068426240 响应参数 无 请求示例 更新项目,修改项目描述、标签,将项目更新为可用状态 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{
labels 否 Array of strings 标签列表 最小长度:1 最大长度:32 数组长度:0 - 5 响应参数 无 请求示例 修改资产信息,更新短描述、长描述、封面图、标签 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v
、gatk-markduplicates、gatk-bqsr、gatk-applybqsr、gatk-haplotypecaller、gatk-mergevcfs和discvrseq-variantqc应用构成。NGS流程执行步骤如表1所示。 表1 NGS执行步骤 步骤 描述 Read
String cpu申请使用量,取值范围[0.1-128],单位C,支持一位小数。对于应用,不填默认1C;对于流程和作业,不填默认使用前一级的配置,填值会覆盖更新。覆盖关系:作业->流程->应用 最小长度:0 最大长度:24 cpu_type 否 String cpu架构类型,不填默认X86
设置作业配置 功能介绍 设置作业配置,目前支持修改作业保存条数(1万条-1000万条),默认设置为500万条; URI PUT /v1/{project_id}/system/job-config 表1 路径参数 参数 是否必选 参数类型 描述 project_id 是 String
因为该请求被设置为拒绝访问,建议直接修改该请求,不要重试该请求。 404 Not Found 所请求的资源不存在。 建议直接修改该请求,不要重试该请求。 405 Method Not Allowed 请求中带有该资源不支持的方法。 建议直接修改该请求,不要重试该请求。 406 Not
com/v1/{project_id}/assets/properties 响应示例 状态码: 200 OK [ "IMAGE", "DATASET", "APP", "WORKFLOW" ] 状态码 状态码 描述 200 OK 错误码 请参见错误码。 父主题: 资产管理