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配置命令行工具 步骤1：获取认证信息 步骤2：获取命令行工具 步骤3：初始化配置
发布流程 您可以将创建的流程发布到资产市场，供其他项目订阅和使用。 发布资产前，需要先设置商标。详细可参考商标设置。 在“工具”页面选择“流程”。 选择需要发布的流程，单击“操作”列“更多”>“发布”。 在发布页面，填写发布流程的相关信息。 表1 发布流程参数说明 参数 说明 名称
发布应用 您可以将创建的应用发布到资产市场，供其他项目订阅和使用。 发布资产前，需要先设置商标。详细可参考商标设置。 在“工具”页面选择“应用”。 选择需要发布的应用，单击“操作”列“更多”>“发布”。 在发布页面，填写发布应用的相关信息。 表1 发布应用参数说明 参数 说明 名称
--help可以替换成任何fastqc的命令，与linux类似。 步骤2：上传镜像至EIHealth平台 配置命令行工具。 若已完成配置，可跳过此步骤。 在命令行工具所在的目录，使用switch命令进入EIHelath平台的项目中。 # 命令结构 health switch project
划线、下划线、小数点和斜线。 如果输出参数为Enum类型，需填写有效值，并在有效值中选择默认值。 单击“立即创建”，创建应用。 父主题： 工具管理
用名称”是选填项，可以使用原有名称，或自定义。 图2 导入应用 单击“确定”，导入应用，导入过程中可以查看每个应用的导入状态。 父主题： 工具管理
通过在本地修改应用的yaml模板，上传应用至项目中。 获取应用yaml模板。 单击“上传应用”，在弹出的页面中下载yaml示例文件。 使用命令行工具，执行health get app -s命令获取创建应用的yaml模板，复制模板并保存到本地。可以保存成.yaml或.txt文件，保存为txt文件时，其内容需为yaml格式。
通过在本地修改流程的yaml模板，上传流程至项目中。 获取流程yaml模板。 单击“上传流程”，在弹出的页面中下载yaml示例文件。 使用命令行工具，执行health get workflow -s命令获取创建流程的yaml模板，复制模板并保存到本地。可以保存成.yaml或.txt文件
”。 图1 编辑应用 在编辑应用页面，可以修改相关的参数。相关参数描述可参考新建应用。 如果更改了版本号，相当于新建一个应用。 父主题： 工具管理
路径在新建流程和运行分析作业时可指定。 新建流程 单击“新建流程”，进入流程设计器页面。 流程设计器是一种用于创建、查看、修改流程的图形化工具，详细介绍请参见流程设计器。新建流程时，自动保存默认打开。 图1 新建流程 填写流程参数信息，填写完成后单击“确定”。 填写流程基本参数，
关键概念 镜像 运行生物信息学软件，往往由于不同的操作系统（Windows、Linux、Mac等）原因，无法实现统一的运维管理。同时，这些软件具有不同的版本和软件包，安装、使用过程复杂。将生物信息学软件封装成Docker镜像，可以使程序在不同的环境中运行，并通过EIHealth平
选择需要引用的项目以及项目中的流程，选择流程的版本。“导入流程名称”是选填项，可以使用原有名称，或自定义。 图2 导入流程 单击“确定”，导入流程。 父主题： 工具管理
流程设计器是一种用于创建、查看、修改流程的图形化工具。借助流程设计器，您可以拖拽工具到画布中，可视化链接各应用，指定应用的先后顺序。 流程设计器界面 流程设计器界面由工具栏、资源栏和画布三部分构成。 图1 流程设计器界面 表1 界面说明 区域 说明 工具栏 上方的工具栏显示设计器的快捷控制操作。
应用或流程。 在“工具”页面左侧，单击图标新建分类标签。 在添加分类标签弹窗中，输入“名称”，勾选需要呈现的标签名称。最多可以勾选5个标签。 图1 添加分类标签 勾选完成后单击“确定”。 页面自动筛选出带有所选标签的应用或流程。 图2 添加完成 父主题： 工具管理
下载应用或流程 在“工具”页面选择“流程”或“应用”。 选择需要发布的流程，单击“操作”列“更多”>“下载”。 图1 下载应用 下载内容不包含应用和流程的id，所有引用关系通过名称和版本来指定。 父主题： 工具管理
update app ID [flags] 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 ID 无 是 可选： 应用的ID（app-id），使用命令行工具创建应用时生成。示例请参见创建应用命令示例。 应用的名称、版本、所在项目名称（app-name:version:srcproject），s
st-3。 获取平台ID 平台ID与“命令行工具 > 步骤3 初始化配置”中的platform-id对应。 登录医疗智能体平台。 在右上角用户名中选择“个人设置”，获取平台ID。 图3 个人设置 图4 平台ID 父主题： 配置命令行工具
images命令查看已有的镜像。 详细的命令介绍请参见“命令行工具 > 镜像管理命令”章节。 登录EIHealth平台，在镜像列表中查看已上传的镜像。 步骤4：创建应用 登录EIHealth平台，在“项目管理”页面“工具”页签中，单击“新建应用”。 图2 新建应用 填写应用的基本信息。
--chip -c 否 芯片类型，只支持X86和ARM。 --project 无 否 指定项目名。未填写则使用配置文件中的项目名。 命令示例 Windows health docker push demo-image:v1.0 -d "this is a desc" -t APP Linux
lmx-project-01/demo-image --type APP --description 'this is a demo' Windows health docker update lmx-project-01/demo-image --type APP --description
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