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传文件夹时必选。 --force -f 否 强制操作，不进行询问提示，上传文件夹时可选。 --flat -l 否 上传文件夹时，只上传该文件夹下的所有内容，上传文件夹时可选。 --update -u 否 增量上传操作，设置该参数后上传每个文件时会比对平台数据路径中的文件，仅在以下情况时上传数据：
名称：设置作业名称。 标签：设置作业标签。 功能调用消耗：运行一次功能会消耗一次。 图2 设置靶点优化MD配置页面 查看靶点优化结果 单击作业名称，进入作业结果页面，拟时结果根据构象RMSD聚类。 单击“查看轨迹”，下载运动轨迹。 单击“下游分析”，将聚类之后的不同构象进行分子对接。
2021年3月 序号 功能名称 功能描述 阶段 相关文档 1 医疗智能体EIHealth平台迭代更新 支持消息、邮件、安全、商标设置。 支持通过命令行工具对平台进行管理和使用，支持Windows、Linux系统。 开放API 优化 优化流程的搭建和运行过程。 商用 用户指南 命令行工具
“作业名称”、“标签”、和“描述”，设置“输出路径”、“优先级”、“计算节点标签”、“超时时间”和“加速类型”。 基本信息：包含作业名称、标签、描述。 输出路径：存放输出结果的路径，格式以/开头。例如项目中的output文件夹，输出路径可设置为/output。 不填写路径时，默认
管理作业 在“作业中心”页签，您可以查看已创建的作业。在操作列，您可以对已创建的作业执行克隆、删除操作。支持对等待中的作业进行取消操作，取消后作业不计费，运行中的作业不能取消。 删除单个作业 选择需要删除的作业，单击“操作”列“删除”即可。 图1 删除单个作业 批量删除作业 一次
本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 当前目录，不进行跳转。 health cd . 切换到上一级路径。 health cd .. 切换到指定的路径，如切换到src1。 health cd /src1
--force -f 否 强制操作，不进行询问提示，复制文件夹时该参数可选。 不加-f，会被询问是否执行操作，需选择yes或no。 --flat -l 否 复制文件夹时，只复制文件夹下的所有内容，复制文件夹时该参数可选。 --update -u 否 增量复制，设置该参数后，复制时会判断是否有
查看执行结果 分析作业的执行时间与环境资源类型、环境资源大小、处理数据大小等相关。您可以在“作业”页面查看执行结果或进行操作。提供了作业的执行状态的查看，并可对作业执行取消、删除、重试、克隆、导出操作。勾选多个作业，可以批量取消、批量删除、批量重试、批量导出。 作业执行状态如下所示。
、已运行时间、预计还需时间。对于列表中的作业，支持通过作业名称、状态、类型、标签、创建时间和完成时间进行快速搜索。也可以根据创建时间顺序、总时间顺序、总时长顺序、完成时间顺序等进行排序。 图1 作业中心 父主题： 作业管理
编辑应用 您可以对已经创建的应用进行编辑，修改对应参数信息。 在应用列表页面，选择需要修改的应用，单击操作列“编辑”。 图1 编辑应用 在编辑应用页面，可以修改相关的参数。相关参数描述可参考新建应用。 如果更改了版本号，相当于新建一个应用。 父主题： 工具管理
删除项目 使用delete命令删除项目。项目的所有者有权限执行该操作。 为了防止项目误删，执行项目删除命令后工具会提示用户进行二次确认输入要删除的项目，只有二次输入的项目名称和命令中的项目名称一致，命令行工具才会执行删除动作。 命令结构 health delete project
图4 拖拽应用 设置输入、输出关系。 fastp的两个输出参数fq-file1和fq-file2是bwa-mem算法的输入参数，bwa-mem的sorted-bam参数是bamqc与picard-insertsize输入参数，参考图进行连接。 图5 设置输入、输出关系 若想修
指定的资源节点上，标签设置方法请参见计算资源标签管理。 图4 CPU、内存、GPU 填写参数。 通过阅读FastQC命令说明，了解命令。 图5 FastQC命令 填写所需的输入参数。 图6 输入参数 填写所需的输出参数。 因镜像启动命令中指定了输出参数，设置输出参数时，需勾选“必
框架语言，它能够很好的管理生信流程，并且将其与Conda、Docker、Singularity结合起来使用，可以很好的将流程在不同平台之间进行迁移，并且能够保证结果的可重复性。Nextflow最大的优点是它是基于数据流的程序模型，因此不用自己去写复杂的并行化的程序，只需要关注“数
对于发布成功的资产，可以进行下线操作，下线后已经订阅的资产将不可使用。 图3 下线资产 对于发布失败或者下线的资产，可以进行编辑，删除，发布等操作。 在“我的发布”中，只能下线发布账号发布的资产。管理员可以下线“组织共享”中发布的所有资产。 发布资产前，需要先设置商标。详细可参考商标设置。 父主题：
按指定的对象名前缀批量下载，批量下载时必选。 --force -f 否 强制操作，不进行询问提示，批量下载时可选。 --flat -l 否 批量下载时，不包含上一级父对象名前缀，批量下载时可选。 --update -u 否 增量下载操作，设置该参数后，下载每个文件时会比对本地的文件，仅在以下情况时下载数据：
中科院北京基因组研究所迅速成立联合团队，从新冠病毒蛋白序列开始，针对所有21个靶点蛋白进行同源建模、分子动力学模拟优化，获取靶点蛋白的3D结构，对超过8500个已上市、进入临床的小分子药物进行了约18万种药物-靶点配对情况的计算评估，让研究人员可以同时从21个蛋白的角度，综合、无
Viewer”，进入MOL 3D Viewer页面即可操作。 主要功能包括： 本地分子结构的3D可视化，支持多种显示样式，支持本地文件拖拽进画布区域进行渲染。 大分子支持PDB编号自动下载。 相互作用的可视化。 支持分子的编辑、标注。 测量、测量距离、角度、二角面等。 结构叠合，将不同结构叠合在一起，用于比较结构差异。
页面左上角单击“编辑”按钮。 在需要修改的数据行的操作列单击“编辑”，修改数据。 编辑时，主键内容不能修改，编辑的值，需要对照数据库模板值进行填写。 对于空的数据库，编辑时，只允许新增行。 图1 编辑数据 修改完成后，单击“保存”。 删除 数据库创建完成后，单击数据库名称进入数据
\ && apt-get install -y default-jre perl wget zip # 下载FastQC，解压缩，设置FastQC可执行权限 RUN wget https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/fastqc_v0
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