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--crr -c 否 复制时使用客户端跨区域复制模式,从通过数据流的方式从源桶直接复制数据到目标桶,且两个桶可以是任意两个OBS服务的桶。 若设置了该参数,必须确保更新了配置文件中客户端跨区域复制的相关配置信息,具体可参考更新配置文件。复制时源桶对应的配置信息为配置文件中的:akCr
最大长度:63 响应参数 状态码: 201 表4 响应Body参数 参数 参数类型 描述 id String 项目id 请求示例 创建项目,设置描述、名称、标签 https://eihealth.cn-north-4.myhuaweicloud.com/v1/{project_id}/eihealth-projects
最小长度:0 最大长度:10000000 add_hydrogen 否 Boolean 增加氢原子。 缺省值:true 响应参数 无 请求示例 设置受体蛋白文件为1TQN.pdb,配体小分子为1TQN.pdb,拼接成复合物结构。 https://{endpoint}/v1/{proje
health mkdir <name> 表1 参数说明 参数 简写 是否必选 说明 name 无 是 子目录的名称。 --e -P 否 指定终端节点。 --i -i 否 指定用户的AK。 --k -k 否 指定用户的SK。 --t -n 否 指定用户的securitytoken。 命令示例
您可以通过单击作业名称,进入详情页面,查看详细的运行信息。包括运行状态、标签、描述、创建时间、完成时间、运行时间、计算节点标签、加速类型、优先级等。单击“概述”列按钮,在展开的信息栏中查看作业的输入&输出、节点参数、应用;在作业的子任务中可以查看日志、事件;在事件页签,可以查看实例的事件详情、下载YAM
强制操作,不进行询问提示,上传文件夹时可选。 --flat -l 否 上传文件夹时,只上传该文件夹下的所有内容,上传文件夹时可选。 --update -u 否 增量上传操作,设置该参数后上传每个文件时会比对平台数据路径中的文件,仅在以下情况时上传数据: 文件不存在。 待上传文件大小不与平台文件大小一致。 文件的最后修改时间不一致。
运行中。后续task运行成功或失败,作业状态都显示失败。可参考作业投递后处于运行中,运行过程正常,但是最后超时失败进行处理。 如果性能加速节点不可用或作业配额不足,重试作业时,超过配额的作业会重试失败。 图1 分析作业 图2 作业搜索 父主题: 作业管理
强制操作,不进行询问提示,批量下载时可选。 --flat -l 否 批量下载时,不包含上一级父对象名前缀,批量下载时可选。 --update -u 否 增量下载操作,设置该参数后,下载每个文件时会比对本地的文件,仅在以下情况时下载数据: 文件不存在。 下载文件大小与本地文件大小不一致。 文件的最后修改时间不一致。
MD:平衡步骤模拟的时长,范围支持0<时长≤50ns,默认是50ns。 配置作业配置,单击“提交”。 名称:设置作业名称。 标签:设置作业标签。 功能调用消耗:运行一次功能会消耗一次。 图2 设置靶点优化MD配置页面 查看靶点优化结果 单击作业名称,进入作业结果页面,拟时结果根据构象RMSD聚类。
移除子用户 安全设置 在用户管理页面,可以重置用户的邮箱、手机号和密码信息。在用户操作列,单击“安全设置”,重置用户的相关信息。 图3 重置用户信息 配额设置 您可以对用户管理中的某个用户设置配额。在用户操作列,单击“配额设置”,设置用户资源配额。 图4 用户配额设置 父主题: 用户管理
是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 project_id 是 String 华为云项目ID,您可以从获取项目ID中获取。 最小长度:1
项目简介 项目是EIHealth平台的一个工作空间,可以在项目中存储数据,上传镜像和创建分析作业。也可以将团队成员引入到项目中,并通过设置成员角色实现项目权限的划分。 项目管理是以项目为粒度对数据、分析作业、开发环境和镜像进行分组。以便用户通过项目进行资源的访问、共享和协作。您可
免误删造成损失。 在“数据”页面单击“归档”,进入归档数据页面。 图1 选择归档 填写归档的参数信息。 表1 参数说明 参数 说明 名称 设置归档数据的名称。归档名称长度为1-100。 描述 归档数据描述信息。 归档类型 选择归档数据存储类型。默认为标准存储。 标准存储:适合高性能,高可靠,高可用,频繁访问场景。
移动时,不包含上一级父对象名前缀。批量移动时该参数可选 。 --dryRun -y 否 测试模式运行,不执行实际的移动操作。 --update -u 否 增量移动操作,设置该参数后,移动每个源对象时会对比目标桶中对应路径的目标对象,仅在目标对象不存在,或者目标对象大小与源对象大小不一致,或者目标对象的最后修改
Integer 缩容阈值 delay_after_add Integer 扩容后多久再次判断缩容 delay_after_delete Integer 节点删除后多久再次判断缩容 delay_after_failure Integer 缩容失败后多久再次判断缩容 max_nodes_batch_deletion
单击“下一步”,在对接设置页面配置相关参数。 图3 设置参数信息 引擎:对接引擎支持DSDP,AutoDock Vina和Similar Docking。DSDP是由北大高毅勤团队研发的基于GPU加速的对接方法,支持全局对接。 如果对接引擎选择Similar Docking,不需设置口袋信息,
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是否必选 参数类型 描述 eihealth_project_id 是 String 平台项目ID,您可以在平台单击所需的项目名称,进入项目设置页面查看。 最小长度:1 最大长度:128 job_id 是 String 作业id 最小长度:1 最大长度:128 project_id
主键用于唯一地标识数据表中的信息,可通过设置复合主键将数据表中的多个数据设置为唯一,主键至多设置10个。 允许为空 主键所包含的列不允许设置为空。当数据库中某些数据允许没有值时,可设置为空。 是否可查询 依据模板中定义的列信息,给出数据库中可进行查询的数据,可查询至多设置10个。 描述 当参数设置为可查询时,可以添加描述信息。
工作效率的有效方式。 从搭建、执行NGS流程中可以看出,图形化的操作界面提供了友好、便捷的操作体验,但是当面临大批量的测序数据时,需要重复设置输入、输出、执行等步骤。为进一步提高NGS流程的执行效率,本章节介绍如何通过循环读取输入数据,批量运行NGS。同时,您也可以参考本示例,将批量运行的方法复制到其他的分析任务中。