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数据管理 数据管理简介 添加数据 数据管理常用操作 父主题： 用户指南（盘古辅助制药）
用户指南（基因平台） 欢迎使用医疗智能体服务 关键概念 准备工作 用户管理 配额管理 系统设置 项目管理 数据管理 数据库管理 镜像管理 工具管理 作业管理 Nextflow 资产市场 开发环境（Notebook） 大规模药物虚拟筛选
genomeagent镜像 使用genomeagent镜像 genomeagent镜像功能点介绍 父主题： 资产市场
图解医疗智能体 AI药物研究 AI基因组研究
AI药物研究 父主题： 图解医疗智能体
资产市场，提供官方发布的镜像、数据、应用、流程资产。 提供了数据库的创建、查询和管理能力。 支持药物虚拟筛选能力。 命令行工具迭代更新。 开放镜像管理类API。 商用 用户指南 命令行工具 API参考 2021年3月 序号 功能名称 功能描述 阶段 相关文档 1 医疗智能体EIHealth平台迭代更新 支持消息、邮件、安全、商标设置。
自行承担因第三方API使用可能产生的风险，包括但不限于数据泄露、服务中断或结果不准确。 # 对于因使用第三方服务而导致的任何直接或间接损失，我们不承担任何法律责任。 # 如您调用的第三方大模型API服务需要设置APIKEY或者headers，请参考https://platform
上传数据 NGS流程中需使用二代测序得到的原始fastq文件、参考基因组序列、参考Variants数据集。 本示例中以Windows系统命令行工具为例，介绍如何将本地数据上传到EIHealth平台。更多的命令介绍请参见命令行工具。 使用命令行工具，用switch命令进入待操作的项目。
创建项目 新用户进入平台后需要自己创建项目，单击“创建项目”按钮，填写项目名称以及选择对应的数据保护策略，数据保护策略参考下面配置。 图1 创建项目 单击项目名称可进入到对应的项目中。 图2 进入项目
境使用方法基本相同，可参考。 获取json格式实例详情 health get task your-task -j your-job -n your-instance # 返回结果如下 { "kind": "Pod", "apiVersion": "v1"
在资源中心可以查看功能调用套餐包和存储套餐包的使用情况、购买记录以及购买套餐包，也可以绑定CSS资源详细的购买步骤可以参考购买资源，此功能只支持专业版。 绑定CSS资源 使用自定义数据库之前需要先购买和绑定CSS资源，购买步骤参考购买资源，绑定具体操作如下： 在盘古辅助制药平台单击右上角“账号名>资源中心”进入CSS资源界面。
件中通过recordMaxLogSize和recordBackups分别配置。 当涉及多文件/文件夹时，如需确认失败任务的具体错误信息，可参考结果清单文件夹下的失败结果清单文件“rm_failed_report_时间_TaskId.txt”及日志路径下的日志文件。 --e -P 否
配体文件：小分子化合物SMILES结构式文件。 受体文件：蛋白3D结构PDB文件。 RNA-Seq测试数据及参考基因组数据集 RNA-Seq-Dataset数据集包含RNA-Seq分析流程的测试数据（fastq）和流程包含软件STAR依赖的参考基因组。 流程 Variant Calling Based On NGS
lkit介绍详见什么是医疗智能体eihealth-toolkit。数据上传可参考上传数据。。 数据上传成功后可以在数据详情页面查询，创建Nextflow流程时可以通过设置参数指定对应数据。 镜像上传可参考上传镜像。镜像上传成功后可以在镜像详情页面查询，复制其镜像地址填入Nextf
步骤4：查看与执行操作命令 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。配置信息导入后，即可查询命令行工具支持的操作，并执行相关命令，使用EIHealth平台。 详细的操作命令请参见其他章节。 查询操作命令列表。
查看项目的数据权限策略。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 不指定参数。 执行health get project命令获取当前用户有权限访问的项目列表。 指定“project-name”参数。
下载数据 在EIHealth平台下载数据 下载数据操作会产生流量费用，计费方式为按需计费，计费详情请参考OBS数据下载费用。 以下操作步骤是在“数据”页面下载数据至本地。您也可以使用命令行工具实现数据的下载。 在EIHealth平台“项目 > 数据”页面，展开数据文件夹，选择待下载的数据。
id）启动作业时，必选。 --io-acc-id -c 否 IO加速实例id，为空则不开启IO加速，设置相应加速包id将会开启加速。实例id可参考“系统设置命令>获取系统资源”章节获取。当id设置为：auto_schedule，则会自动调度加速包，当id设置为local_disk，则开启本地盘加速。
药物数据输入格式说明 药物虚拟筛选平台的输入数据，需要输入蛋白质和配体小分子数据。参考以下数据要求，将数据上传至项目中。 输入蛋白质，pdb格式，将要进行对接的所有靶标蛋白放在一个文件夹内。 输入配体小分子，配体小分子为如下格式的txt文件。 第一列为smiles字符串，第二列为smiles名称，中间用tab键分割。
待恢复的下载任务会从结果清单的文件夹中查找，结果清单文件夹的路径参考附加参数--o。 命令示例 本节以Windows为例介绍eihealth-toolkit的使用过程，Linux和macOS环境使用方法基本相同，可参考。 列举路径中的文件夹对象时，需使用/xxx/格式，如示例中的/src/。
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