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ReceptorDrugFile object 靶点文件。 bounding_box BoundingBoxDto object 结合口袋,包含口袋中心位置和尺寸大小。 remove_ion Boolean 去除受体中的离子。 缺省值:true remove_water Boolean 去除受体中的水分子。
表3 请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 asset_id 是 String 资产id。长度1-64,只能包含字母、数字、下划线和中划线 最小长度:1 最大长度:128 asset_version 是 String 资产版本。长度1-128,字母或数字开头,后面跟小写字母、数字、小数点、斜杠、下划线或中划线
sort_key 否 String 排序字段 最小长度:1 最大长度:128 sort_dir 否 String 排序方向,升序或降序,即ASC 和DESC 缺省值:DESC 最小长度:1 最大长度:128 请求参数 表3 请求Header参数 参数 是否必选 参数类型 描述 X-Auth-Token
设置名称匹配模式(include、exclude)和时间匹配模式(timeRange)对对象名以“/”结尾的对象也生效。 --o -o 否 生成结果清单文件的文件夹,命令执行完成后,会在该文件夹下生成结果清单文件(可能包含成功结果、失败结果和警告结果三个文件),默认为运行obsutil命令的用户目录的子文件夹
增量同步 使用sync命令让本地源路径下的所有内容和OBS指定目标对象进行数据同步,使两边内容保持一致。 增量:依次比较源文件和目标对象,只上传存在变化的源文件。 同步:命令执行完成后,保证本地源路径是OBS指定目标桶的子集,即本地源路径下的所有文件均能在OBS指定目标桶中找到对应对象。
认1C;对于流程和作业,不填默认使用前一级的配置,填值会覆盖更新。覆盖关系:作业->流程->应用 最小长度:0 最大长度:24 memory 否 String 内存申请使用量,取值范围[0.1-3072],单位G,支持一位小数。对于应用,不填默认1G;对于流程和作业,不填默认使用
请求Body参数 参数 是否必选 参数类型 描述 asset_id 是 String 资产id。长度1-128,只能包含字母、数字、下划线和中划线 最小长度:1 最大长度:128 asset_version 是 String 资产版本。长度1-128,字母或数字开头,后面跟小写字母、数字、小数点、斜杠、下划线或中划线
用户名,长度1~64之间,首位不能为数字,特殊字符只能包含下划线“_”、中划线“-”和空格 最小长度:1 最大长度:64 password 是 String 用户密码,在8-32位之间支持用户自定义密码长度,至少包含以下四种字符中的两种: 大写字母、小写字母、数字和特殊字符。 最小长度:8 最大长度:32 role
认1C;对于流程和作业,不填默认使用前一级的配置,填值会覆盖更新。覆盖关系:作业->流程->应用 最小长度:0 最大长度:24 memory 否 String 内存申请使用量,取值范围[0.1-3072],单位G,支持一位小数。对于应用,不填默认1G;对于流程和作业,不填默认使用
-t 是 名称,支持computing、performance、database、storage,分别代表计算资源、性能加速资源、数据库资源和存储资源。 --action -a 否 查询计算节点方式。 取值范围: get-labels:获取计算资源标签列表。get-labels要和--node一起组合使用。
TaskInstanceMetadataRsp object 实例元数据信息 spec TaskInstanceSpecRsp object 实例cpu和内存使用率信息 表6 TaskInstanceStatusRsp 参数 参数类型 描述 phase String 实例执行状态 pod_ip
"update"]:直接使用系统调用exec来执行。 RUN yum update && yum install nginx:使用&&符号将多条命令连接在同一条RUN语句中。 EXPOSE 用来指明容器内进程对外开放的端口,多个端口之间使用空格隔开。运行容器时,通过参数-P(大写)即可将E
最小长度:1 最大长度:512 数组长度:10 - 10000 molecule_file DrugFile object 分子文件,分子表达式列表和分子文件二选一,分子文件优先级最高。 num_trials Integer 生成分子数量。 最小值:0 最大值:5000 initial_dataset_size
法实现统一的运维管理。同时,这些软件具有不同的版本和软件包,安装、使用过程复杂。 将生物信息学软件封装成Docker镜像,可以使程序在不同的环境中运行,并通过EIHealth平台的镜像管理,实现高效的调用,极大方便了软件的安装和运行。 Docker镜像是一个模板,是容器应用打包的
于应用,不填默认1G;对于流程和作业,不填默认使用前一级的配置,填值会覆盖更新。覆盖关系:作业->流程->应用 最小长度:0 最大长度:24 gpu_type 否 String gpu架构类型,取值范围 ' '|GPU|Snt9|D310。对于流程和作业,不填默认使用前一级的配置
100000000] 最小值:0 最大值:100000000 缺省值:0 sort_dir 否 String 降序或升序(分别对应desc和asc,默认为desc) 缺省值:desc sort_key 否 String 排序字段(支持type, end_time) 请求参数 表3
以精简格式显示查询结果,返回结果只包含对象名。 --recursive -r 否 递归列举本项目文件夹中的所有文件和子文件夹。 --v -v 否 列举桶内多版本对象,列举结果包含最新版本的对象和历史版本的对象。 --marker -M 否 列举桶内对象的起始位置,返回结果是按照字典序排序后该参数之后的所有对象,具体可参考列举示例。
BindSiteDto object 结合位点。 binding_sites Array of BindSiteDto objects 受体列表和受体是二选一的关系,受体列表优先级最高。 数组长度:0 - 2 weak_constraints Array of WeakConstraintDto
参数确认无误后,单击“立即创建”,创建应用。 表1 fastp、bwa_samtools应用参数说明 应用名称和版本 应用名称:fastp 版本:0.20.1 应用名称:bwa_samtools 版本:0.7.17 镜像和启动命令 镜像:fastp:0.20.1 启动命令: fastp --fix_mgi_id
使用genomeagent镜像 智能体AI Agent,被设计为具有独立思考和行动能力的AI程序,只需提供一个研究目标和数据路径,即可自适应生成一个任务序列执行分析任务。 生信智能体AI Agent可以应对激增的多组学数据分析需求、高成本的生物信息学培训和满足不同应用场景的个性化需求,为多领域生命科学研究提供高效、定制化的数据分析支持。