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3D Viewer工具支持查看蛋白质和小分子的3D结构。单击“功能模块 > 通用工具 > MOL 3D Viewer”，进入MOL 3D Viewer页面即可操作。 主要功能包括： 本地分子结构的3D可视化，支持多种显示样式，支持本地文件拖拽进画布区域进行渲染。 大分子支持PDB编号自动下载。
靶点口袋发现 靶点口袋发现实现全新元动力学算法，高效遍历柔性蛋白表面，找到潜在口袋位置。 单击“靶点口袋发现”功能卡片，进入配置页面。 在配置页面，选择靶点文件、探针文件，配置相关参数信息。 靶点文件：支持PDB格式文件。 探针文件：探针分子建议原子数不超过400，分子量过大可以
genomeagent镜像功能点介绍 此章节介绍genomeagent镜像的基本功能。 功能点1：自动生成任务计划、自动生成子步骤代码 功能点2：自动提交EIFlow代码任务 功能点3：报错时自动修正 报错时自动修正 报错时用户介入修正。 功能点4：特定步骤中断（人为or非人为），前序步骤状态继承，重新执行中断步骤
令模式。 删除文件或文件夹 如果需要在Notebook中删除文件或文件夹，您可以在“Files”列表中勾选待删除的文件或文件夹，然后单击上方的红色删除按钮，即可删除选中的文件或文件夹。 文件或文件夹删除完成后，需单击右上角的刷新按钮刷新页面，清除缓存文件。 图4 删除 使用Notebook
仅可以使用字母、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格；首位只能以数字或字母开头。 标签：设置任务标签。 功能调用消耗：每一对会消耗一次功能调用，因此计算几条路线就显示调用几次。 图5 设置FEP参数 单击“提交”，可在作业中心查看该作业的运行情况。 查看运行结果。 输出每对配
聚类分析工具可以通过骨架聚类方法，将大型小分子数据库中结构相似的化合物聚成一类，从而找到有效骨架 ，辅助苗头化合物发现。 单击“功能模块 > 通用工具 > 聚类分析”功能卡片，进入配置页面。 图1 聚类分析配置页面 输入方式：选择文件和手动输入类型。 上传分子文件：选择可上传的分子文件。分
inding_energy 您可以通过“上传靶点”，将受体文件上传。受体文件仅支持pdb格式的文件，提交任务时系统会自动删除受体中包含水、配体和金属离子。删除受体文件后，运行任务时会跳过靶点设置步骤。 口袋设置。 原始配体： 将原始配体作为口袋位置，也可以通过上传配体文件来进行口袋设置。
单个受体对多个配体的结果页面有列表视图、卡片视图，支持搜索、高级筛选，排序等功能。每个小分子支持“查看详情”可以进入小分子的属性详情页；支持“下游分析”，可以进行分子属性预测、分子搜索、分子优化、合成路径规划分析。支持收藏功能，单击按钮，即可收藏CPI预测结果，收藏后可直接在收藏夹页查看。 图5
项目内的数据支持精细化的权限控制，可对数据分享、下载、删除进行设置。您可以在项目的“设置”页面设置数据权限。数据权限仅可以有项目所有者设置。 分享：关闭分享后，项目内数据不允许分享给其他项目，包括拷贝、引用两种方式。 下载：关闭下载后，项目内数据不允许下载至本地。 删除：关闭删除后，项目内数据不允许通过平台、命令行工具删除。
如何使用Notebook的Terminal功能 对于习惯编码的开发者可以使用Terminal功能进行开发、调试和运行分析任务。 在“Files”页签下，单击右上角“Open JupyterLab”，然后选择“Terminal”，进入Terminal界面。 图1 Terminal
inding_energy 您可以通过“上传靶点”，将受体文件上传。受体文件仅支持pdb格式的文件，提交任务时系统会自动删除受体中包含水、配体和金属离子。删除受体文件后，运行任务时会跳过靶点设置步骤。 口袋设置。 原始配体： 将原始配体作为口袋位置，也可以通过上传配体文件来进行口袋设置。
靶点口袋分子设计 基于盘古药物分子大模型，靶点口袋分子设计功能主要是能够根据给定的口袋和小分子利用AI的预测出更优小分子。 单击“靶点口袋分子设计”功能卡片，进入配置页面。 在配置页面上选择设计方式 设计方式：支持侧链修饰、骨架跃迁、片段生长和从头生成四种方式。 侧链修饰：会在不
在项目设置页面，可以查看项目名称，该项目的数据存储OBS桶名称。所有者可以修改项目描述，转移项目，删除项目。管理员可以修改项目描述，退出项目。操作员可以退出项目。 删除项目后数据、作业会同步删除，删除项目不可逆，请谨慎操作。 成员管理 在成员管理页面可以添加或者移除访问该项目的成员。 图3
管理用户 删除子用户 管理员用户包含子管理员，均具备删除权限。但子管理员不可将管理员删除。删除用户只能删除来源为本平台的用户，如果来源为IAM，则只支持移除。 项目是存储数据、镜像、分析作业等的工作空间，执行删除用户操作时，只有在该用户名下没有项目时，才可以被删除。在用户的操作列，单击“删除”，删除对应的用户。
作业名称：设置作业名称。长度为5~64个字符，仅可以使用字母、数字、下划线“_”、中划线“-”和空格，首位只能以数字或字母开头。 标签：设置任务标签。 功能调用消耗：20000个小分子记一次功能调用。 引用外部桶时，需要确保所引用的数据不超过45层级的目录。 配置完成后，单击“提交”。 提交成功后，可以在“作业中心”查看执行结果。
流程设计器界面由工具栏、资源栏和画布三部分构成。 图1 流程设计器界面 表1 界面说明 区域 说明 工具栏 上方的工具栏显示设计器的快捷控制操作。 由设置、新建作业、保存、另存为、删除、自动保存构成。 资源栏 左侧的资源栏显示项目中可以使用的应用和流程。 画布 中间区域为搭建流程的操作界面。 可以将应用拖拽至画布中，并进行编排创建。
通用工具 MOL 3D Viewer MOL Editor 聚类分析 父主题： 功能模块
作业执行克隆、删除操作。支持对等待中的作业进行取消操作，取消后作业不计费，运行中的作业不能取消。 删除单个作业 选择需要删除的作业，单击“操作”列“删除”即可。 图1 删除单个作业 批量删除作业 一次选中多个作业，单击“作业中心”页面上方的“删除”。 图2 批量删除作业 父主题：
单击“确定”，标签添加完成。系统最多可添加100个标签。 删除标签 标签删除后不可恢复，请谨慎操作。 在“标签管理”页面，单击操作列的“删除”。 在“删除标签”弹窗中，单击“确定”。 图3 删除标签 批量删除标签 您可以一次选中多个标签，单击页面左上角的删除按钮即可。 图4 批量删除标签 查找标签 在搜索框中输入标签名称关键字，单击按钮进行查找。
靶点发现 靶点口袋发现 靶点优化 父主题： 功能模块
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