什么是HPC 高性能计算(High-performance computing,HPC)是一个计算机集群系统,它通过各种互联技术将多个计算机系统连接在一起,利用所有被连接系统的综合计算能力来处理大型计算问题,所以又通常被称为高性能计算集群。 HPC的业务特点 科学研究、气象预报、
优化性能 性能比普通云服务器提高30%。 通过虚拟化优化(SR-IOV、PCI直通)等,各类测试报告显示:大规模云化HPC性能损耗不大。 HPC与云服务的关系 表1 所需云服务 云服务 作用 弹性云服务器(ECS) 用于在公有云平台上创建高性能计算服务器。 虚拟私有云(VPC)
组添加安全组规则。 一站式HPC服务使用弹性文件服务SFS作为文件共享存储,更多关于弹性文件系统的信息,请参见《弹性文件服务用户指南》。 操作步骤 登录HPC-S²控制台。 单击管理控制台左上角的,选择区域和项目。 单击“部署HPC集群”。 系统进入部署HPC集群页面。 选择“区域”。
报文。 connected模式具有更好的性能,但是会消耗系统更多的内存。多数系统更关注性能,因此大多数场景下IB网口配置为connected模式。 当前版本的网卡驱动不支持connected模式。 由于网卡驱动性能原因,系统关闭了connected模式,因此,当前版本网卡驱动不支持配置connected模式。
按流量计费:按照实际使用的流量来计费。 选择“镜像”。 公共镜像(推荐) 常见的标准操作系统镜像,所有用户可见,包括操作系统以及预装的公共应用。请根据您的实际情况自助配置应用环境或相关软件。 私有镜像 用户基于弹性云服务器创建的个人镜像,仅用户自己可见。包含操作系统、预装的公共应用以及用户的私有应用。选择私有镜像创
选择“许可证类型”。 在云平台上使用操作系统或软件的许可证类型。如果您选择的镜像为免费的,则系统不会展示该参数。如果您选择的镜像为计费镜像,此时系统会展示该参数。 使用平台许可证 使用云平台提供的许可证,申请许可证需要支付一定的费用。 使用自带许可证(BYOL) 使用用户已有操作系统的许可证,无需重新申请。
创建镜像需选择ECS系统盘镜像。 需修改镜像属性才能在ECS创建界面的C6h规格中选择到相应的镜像。 镜像获取 请联系技术支持进行操作。 创建系统盘镜像 请使用镜像文件创建系统盘镜像,需注意镜像用途选择ECS系统盘镜像如图1,选择启动方式为UEFI图2,否则系统无法启动。 图1 创建系统盘镜像
什么是HPC-S² HPC解决方案服务 高性能计算(High-performance computing,简称HPC)是一个计算机集群系统,通过管理节点对计算任务进行分解,交给不同的计算节点进行计算,以此来解决大型计算问题。在科学研究、气象预报、仿真实验、生物制药、基因测序、图像处理等行业均有广泛的应用。
我的配额”。 系统进入“服务配额”页面。 图1 我的配额 您可以在“服务配额”页面,查看各项资源的总配额及使用情况。 如果当前配额不能满足业务要求,请参考后续操作,申请扩大配额。 如何申请扩大配额? 登录管理控制台。 在页面右上角,选择“资源 > 我的配额”。 系统进入“服务配额”页面。
已使用私有镜像创建多个弹性云服务器。 操作步骤 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 登录用户为创建弹性云服务器时指定的用户名。 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令,验证参加测试的弹性云服务器之间是否可以免密码互相登录。 $ ssh 用户名@SERVER_IP
["password"],"password": {"user": {"name": "$OS_USERNAME","password": "$OS_PASSWORD","domain": {"name”:”$OS_USER_DOMAIN_NAME”"}}}},"scope": {"project": {"name":
检查是否已安装IB驱动。 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录弹性云服务器。 执行以下命令,切换为root 用户。 $ sudo su 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 执行以下命令,查询是否已安装IB驱动。 # rpm -qa | grep mlnx-ofa # ls /u
前提条件 已成功创建BMS,并绑定了弹性IP进行登录。 操作步骤 使用“PuTTY”,采用密钥对方式登录集群中任意一台BMS。 执行以下命令,防止系统超时退出。 # TMOUT=0 将BMS对应的密钥文件(.pem文件)拷贝至.ssh目录下,命名为“id_rsa”。 $ cd ~/.ssh
安装和使用MPI(鲲鹏BMS场景) 该任务指导以CentOS 7.6的操作系统为例在单节点上运行MPI应用。 鲲鹏裸金属服务器支持使用的MPI 安装和使用IB驱动自带的Open MPI 安装和使用社区OpenMPI 安装和使用MPICH 父主题: 裸金属服务器场景典型应用
在华为云控制台搜索“弹性文件服务 SFS”,并在弹性文件服务页面右上角选择“创建文件系统”。 图1 创建文件系统 2.在"创建文件系统"界面的"文件系统类型"选项中,根据业务需要,选择"HPC型"或"HPC缓存型"文件系统类型。 图2 选择文件系统类型 3.在"创建文件系统"界面的"选择网络
Spectrum MPI 操作场景 本节指导用户安装和使用IBM Spectrum MPI(以IBM Spectrum MPI v10.1为例)。 其中,IBM Spectrum MPI v10.1版本当前支持的操作系统列表如下: IBM Spectrum MPI 10.1.0.1
MPI应用(以版本10.01.01为例)。 对于集群中的每台BMS,都需要执行该操作。 背景信息 IBM Spectrum MPI v10.1版本当前支持的操作系统列表如下: IBM Spectrum MPI 10.1.0.1 Eval for x86_64 Linux Red Hat Enterprise
进入弹性云服务器信息页面。 在弹性云服务器列表页,选择待制作镜像的云服务器,确认云服务器为“关机”状态。 如果云服务器为“开机”状态,您可通过单击“操作”列下的“更多 > 关机”将云服务器关机。 单击“操作”列下的“更多 > 制作镜像”,将弹性云服务器制作为私有镜像。 根据界面提示,填写镜像的基本信息。
下载需要的HPC-X工具套件以及OpenMPI。 使用社区OpenMPI时,需要同时使用Mellanox的HPC-X 套件,HPC-X 的下载需要参考弹性云服务器操作系统的版本以及IB驱动版本,例如,下载的HPC-X版本为:hpcx-v2.0.0-gcc-MLNX_OFED_LINUX-4.2-1.2.0
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