简介
randfold是一个独立的基因测序相关软件,它从原始序列开始随机显示其核苷酸顺序。它根据改组后的序列计算推断结构的最小自由能(MFE),并多次重复计算以建立最小自由能(MFE)值的分布。
配置流程
1.配置编译环境
安装依赖。
yum install-y git
2.获取源码
获取“randfold”源码包。
cd/usr/local/ git clone https://github.com/eb00/randfold.git
3.编译和安装
1)编译randfold。
cd randfold/src/squid-1.9g ./configure&&make
2)编译randfold。
cd../ make
编译完成后会生成可执行文件“randfold”。
3)设置软连接。
ln-s/usr/local/randfold/src/randfold/usr/bin/randfold
4.运行和验证
执行如下测试命令。
randfold-d let7.tfa 999
当系统回显类似如下信息是,表示randfold执行成功。
cel-let-7-42.90 0.001000